"京察"是明代考核京官的一種製度，規定六年一次，稱職者予獎或晉升，不稱職者處罰或斥退。很明顯，掌握這個權力就是把持了朝廷的人事大權，可以有很大人為性任職和罷免官吏。
萬曆三十三年(1605年)的京察，由東林黨人、吏部侍郎楊時喬主持。在京察中提出幾個倒黴蛋，決定要處分的人，其中就有幾個是首輔沈一貫的黨羽。由於沈一貫蒙蔽了萬曆帝，他的黨羽錢夢皋等人受到包庇，未遭處分，而楊時喬反被嚴旨斥責。東林黨人和其他一些朝臣一再奏劾沈一貫遍置私人、蒙上箝下，沈一貫被迫謝病不出，於次年致仕（辭職了）。
轉眼到了萬曆三十九年（1611年），當年的京察，由東林黨人、大學士葉向高主持，這一次，齊、楚、浙、宣、昆等黨裏麵一些人物被罷了官。但在南京(時稱留都)則出現了另一種局麵。這次在南京主持京察的，是齊、楚、浙黨方麵的官員，他們就合謀排斥了所有支持東林黨領袖之一李三才一派的人。雙方矛盾可謂越積越深。
萬曆四十五年(1617年)京察時，方從哲秉政，齊、楚、浙等黨多居要職，於是又"盡斥東林"。
熹宗天啟年間，黨爭達到高潮。最初，東林黨曾占上風。不久,反東林諸黨與宦官魏忠賢相勾結，形成"閹黨"，對東林黨施以殘酷的報複。魏忠賢使人編《三朝要典》，借"梃擊"、"紅丸"、"移宮"三案為題，打擊東林黨，更唆使其黨羽造作《東林黨點將錄》等文牘，想把東林黨人一網打盡。
天啟五年(1625年)三月，許顯純對已投入獄中的東林黨人汪文言嚴刑拷打，迫他誣陷楊漣、左光鬥等人在"封疆案"中接受熊廷弼的賄賂。所謂"封疆案"是指熊廷弼經略遼東，防守有方，但朝廷又派根本不懂軍事的閹黨王化貞為遼東巡撫。天啟二年，在後金軍隊的進攻下，王化貞丟了重鎮廣寧，一敗塗地。朝廷判熊、王兩人死罪，尚未執行。至此，閹黨就設計誣陷東林黨人。汪文言寧死也不肯誣陷楊漣(字大洪)等人，他在受刑時大呼："世豈有貪贓之楊大洪哉!"許顯純用毒刑害死了汪文言，又捏造汪的供詞，誣陷楊漣等六人受賄。於是魏忠賢用皇帝的名義，下旨逮捕東林黨人楊漣、左光鬥、袁化中、魏大中、周朝瑞、顧大章(時稱六君子)，並將受牽連的趙南星等十五人削籍為民，提問追"贓"。隨後，又有幾次殘酷的迫害，《明史》感歎："明代閹宦之禍酷矣，然非諸黨人附麗之，羽翼之，張其勢而助之攻，虐焰不若是其烈也。"崇禎元年(1628年)，魏閹勢力被迅速打壓下去，東林黨人才免遭毒手，被害的東林黨人被平反昭雪，但閹黨的勢力並沒有被徹底鏟除，東林黨同它的鬥爭一直繼續到明朝滅亡。
繼承東林黨風範的為複社，這也是一個黨派組織。複社是崇禎六年在蘇州虎丘成立的。領袖人物為張溥、張采，時人稱為"婁東二張"。在明崇禎後期，清軍壓境，一部分江南士大夫，繼東林黨而起，組織團體，也主張改良政治，以謀挽救明王朝的統治，大倉人張溥（天如）和張采等人合並江南的若幹文社，稱複社。其成員多是青年士子，先後共計2000多人，聲勢遍及海內，"成於數人之誌，而後漸廣以天下之意"。他們大都懷著飽滿的政治熱情，以宗經複古、切實尚用相號召，切磋學問，砥礪品行，反對空談，密切關注社會人生，並實際地參加政治鬥爭，可以說是東林黨的繼續和發揚。
東林黨人對"朋"和"黨"有了不同於前人的認識。他們不諱言"黨"，常以"吾黨"自稱。顧憲成說："君子在朝，非君子自能在朝也，本之君子之領袖為之連茹而進也。"至於後來的複社更是優於東林。複社是以德高望重者為盟主，基層以社長為中心，以集中聚會形式整合意見，以章程盟約為約束機製，它有統一的社規和相對成型的組織係統，在內部實行各司其職的分工管理。複社規模、影響之大，活動地域之廣，居我國古代曆史上諸文社之首。直到清朝順治九年(1652年)，複社被清政府取締。
7.親兄弟得明算賬
不說普靜老師幻化孝哥兒去了，且說吳月娘與吳二舅眾人，在永福寺住了十日光景，果然大金國立了張邦昌在東京稱帝，置文武百官。徽宗、欽宗兩君北，康王泥馬渡江，在建康即位，是為高宗皇帝。拜宗澤為大將，複取山東、河北。分為兩朝，天下太平，人民複業。--《金瓶梅》第一百回