前已提及蒽醌類化合物是植物蘆薈中的主要活性成分，大多具有殺菌、抑菌、消炎、解毒和促進傷口愈合等作用；具有健胃和緩瀉功效，能增進食欲，對多種便秘有明顯的治療作用；另外，在抗腫瘤、降低血糖和血脂、提高機體免疫能力方麵，都有積極作用。
把新鮮的蘆薈葉片橫向切斷，收集流出的黃色葉汁，濃縮幹燥，即為藥用蘆薈。《中華人民共和國藥典》關於蘆薈也有類似表述，但其“庫拉索蘆薈習稱‘老蘆薈’，好望角蘆薈習稱‘新蘆薈’”的提法與蘆薈行業的習慣有所不同。藥用蘆薈中含有許多蒽醌類化合物。
蘆薈苷(barbaloin或aloin)又稱蘆薈大黃素苷，俗稱蘆薈素，是早在1851年獲得的第1個結晶性蒽酮碳苷，它的結構於1952年得到確定，為10-C-β-O-吡喃葡萄糖-1，8-二羥基-3-羥甲基-9(10H)-蒽酮。後來用反相高壓液相分離，從中分離出蘆薈苷A和B，它們是苷元C10位的一對非對應異構體，具有不同的旋光性和圓二色性，並可相互轉化。其中蘆薈苷A具有反式結構，蘆薈苷B具有順式結構。
一、蘆薈苷的物理性質和化學性質
蘆薈苷為檸檬黃色結晶體，熔點148℃～149℃，在室溫下存放快速形成蘆薈苷－水化合物結晶體，熔點變為70～80℃。旋光度（水），（乙醇），略有沉香氣味，味苦。蘆薈苷具有升華性，常壓下加熱即可升華，其還原型產物在加熱升華過程中易氧化成相應的蒽醌類化合物。蘆薈苷易溶於吡啶中，可溶於冰醋酸、水、甲醇、乙醇、丙醇、異丙醇、丙酮和醋酸甲酯等，微溶於異丁醇、氯仿、二硫化碳和乙醚，在熱水中也可溶解，在冷水中溶解性較差，幾乎不溶於苯、乙醚、氯仿等非極性溶劑。
蘆薈苷化學性質比較穩定，但在水溶液中易被氧化，蘆薈大黃素和4－羥基蘆薈苷可能是其降解產物。蘆薈苷有熒光反應，而且在不同的pH下會出現不同的熒光。蘆薈苷的紅外光譜（溴化鉀）在3420cm-1、1640cm-1、1620cm-1處有特征吸收，紫外和可見光在226nm、270nm、298nm、360nm處有最大吸收。
二、蘆薈中其他蒽醌類化合物的性質
11-去氧蘆薈苷(chrysalosin)最初是通過催化還原蘆薈苷得到的，後來發現在植物中也有分布。後莫那特蘆薈苷(homonataloin)經結構鑒定為羥基甲基化衍生物，熔點203℃。Cassialoin的結構為10-羥基-10-C-β-吡喃葡萄糖基-3-甲基-9(10H)-蒽酮，是10-羥基-11-去氧蘆薈苷。蘆薈鼠李苷B(aloinoside B)是蘆薈苷的11-α-L-鼠李糖苷，而蘆薈鼠李苷A(aloinoside A)被認為是其10-C-葡萄糖的異構體，熔點233℃。蘆薈苷的2個立體異構體的8-O-β-D-葡萄糖苷分別被命名為cascarosidesA和B，而cascarosides C和D是由11-去氧蘆薈苷的2個立體異構體衍生而來的類似物。4，5，8-三羥基-2-甲基蒽醌（helminthosorin）為紅色針狀晶體，熔點210～212℃。
人們已從50多種植物包括20餘種蘆薈屬植物的葉汁中發現了蘆薈苷和後莫那特蘆薈苷，且二者的含量接近。在含有蘆薈苷或後莫那特蘆薈苷的植物中可以發現有蘆薈苦素（aloesin）存在，而隻有5種蘆薈屬植物中可以找到蘆薈鼠李苷。除了百合科外，人們還從鼠李科植物珀希鼠李（Rhamnus purshiana DC.）中發現了蘆薈苷、cascarosides A～D和11－去氧蘆薈苷，從Cassiagarrettiana Craib中發現了cassialoin和11－去氧蘆薈苷。
蒽醌類化合物主要分布在蘆薈葉片中，在根中也發現含此類物質，但其每克新鮮組織中的含量僅為0.01mg。Sigler和Rauwald於1994年發現在蘆薈花的花瓣和花序軸中也存在著蒽醌類物質。蘆薈苷在藥用蘆薈中的含量可達18%～30%。
三、蘆薈苷的提取和分離
從蘆薈中提取蘆薈苷，可以用水作溶劑進行。將粉碎的蘆薈用微呈酸性的熱水浸漬提取，浸出液放置約24h，傾出上層清液，於低溫濃縮，自然冷卻，蘆薈苷可以結晶析出，再自熱水中反複重結晶，就能得到較純的產品。或者於酸性的浸出液中，加入稀氫氧化鈉水溶液使混合液呈堿性，再加入氯化鈣溶液，則蘆薈苷伴同鈣鹽一並沉澱析出，濾集沉澱，用稀鹽酸洗去沉澱中的鈣鹽，可得黃色粉末狀物即為粗製蘆薈苷，再於熱水中反複重結晶，可得純品。