前列腺結石的治療可根據病人有無自覺症狀和伴發疾病分無需治療和需要治療兩種情況。
無需治療的前列腺結石，病人常常沒有明顯不適症狀，既無會陰部不適，亦無排尿異常，而且結石小，數目少。此類病人常常可以與存留在前列腺腺體內的結石長期和平共處，不必管它，因為這種結石目前尚無特效藥可治療，因而服用那些無關緊要的藥物就不必要了。患此疾病的人也不必為此而過多煩惱和擔心，因為前列腺結石在許多情況下並不影響身體的健康，許多人發病10多年仍沒什麼變化。當然，並不是說發現了前列腺結石都可以不去管它，而須做定期檢查，包括觀察結石大小、數目、位置等有無變化。
需要治療的前列腺結石，常常是由於並發梗阻和感染，或者同時伴有前列腺炎及前列腺增生而須治療。此時治療的重點往往是伴發或並發疾病。對伴隨前列腺增生的結石可行手術治療，具體方法有3種：①經尿道切除前列腺和結石，即經尿道插入一種特別的前列腺切除鏡，在前列腺尿道外邊觀察邊進行前列腺電切，這種方法可以將前列腺內的結石一並取出，臨床最為常用，適用於年齡較輕者，可避免術後性功能障礙的發生；亦可用於年老體弱者，但有結石不易取盡、術後易複發等缺點；②大而多發的結石伴前列腺增生可行恥骨上前列腺及結石一並切除術；③前列腺深部的多發結石可行經會陰前列腺（包括結石）切除術。對於伴感染者則可以抗感染和對症處理。