二、均方根
在多焦電生理中用來測量振幅的另一個方法是計算波形在某個時間間隔內采樣值的均方根。
優點是不需要依賴於對反應波形的特定成分的辨認，即不需要像峰峰值測定那樣要有明確的各波位置才能確定其振幅值，而隻需要確定其基本特定成分可能出現的時間段：開始時刻和終止時刻，根據公式就能獲取反應幅值。它的缺點是不能區分信號和噪聲。信號和噪聲對的計算都有貢獻。這種振幅測量方法一般會導致對信號振幅的過高估計。
三、數量積
數量積是在基礎上發展的。如果根據先前的經驗已經知道反應的波形形狀，可以把它作為模板來提取更加精確的振幅結果。如果沒有先前模板的，則可用自身的波形作模板，那麼它的數量積。
應用什麼樣的模板作數量積計算，對測量振幅的準確性起著非常關鍵的作用。在係統中，如果使用了參考數據（正常數據），那麼計算數量積的模板是由正常數據提取的。如果沒有使用正常參考數據，那麼計算某波形數量積的模板是由該波形所屬組的平均波形提取的。
理想的模板應該是每一位置上年齡匹配的正常對照組在同等條件下記錄的波形的平均。在科學研究中，足夠數量的同等條件記錄常常是達不到的。但是，在研究視網膜功能異常時，這樣的正常組數據一般是需要的。它不僅提供了局部模板，還提供了正常人局部反應振幅的變異情況。這些變異可以應用於局部功能異常的檢測。
數量積在研究患者的電生理反應時的另一個優點是，反應的波形和潛伏期的改變都可以引起振幅（數量積）的降低，並在反應密度的地形圖中顯示為一個凹陷。
如果在測試範圍內，波形的變異比較少，則應用數量積進行振幅測量是比較合適的。但如果在測試範圍內，各個波形之間有比較多的不同，在這種情況下提取模板是不可能的事情，這時應用數量積進行振幅測量是不合適的，應使用振幅測量。
均方根和數量積主要用於三維圖形的處理。
通過刺激不同大小區域得到的局部反應振幅隻是代表該區域的視功能，但由於各區域的大小不一致，沒有直接的比較意義，將反應振幅除以各自的刺激麵積，獲取單位麵積反應，稱為反應密度或振幅密度，通過振幅密度可比較不同部位不同區域的視網膜功能。
第五節 二維和三維圖產生
各局部反應密度按其分布可形成三維的表麵功能圖，即功能地形圖。如僅按61個六邊形，103個六邊形等構成三維功能圖將會很粗糙，缺少平滑性，為此，可采用較刺激區更細的六邊形插入法，圖2-11所示由虛線勾畫出刺激六邊形，包括中央插入一個六邊形（實線），其反應密度即來自該刺激六邊形的反應密度，而跨邊界的六邊形的反應密度等於兩個相鄰六邊形的反應密度的算術平均值。由此，就可以獲得較為平滑的三維菜單麵圖；當除去軸，可以得到二維菜單麵圖。
第六節 掃描延遲的修正
在對一幀圖像的處理是通過行掃描和幀掃描來實現的，行掃描的時間很短，可以忽略，但幀掃描的時間較長，如對掃描頻率的顯示器，則每幀掃描時間，即掃描一幀從顯示器的頂到底需要，當最上方的六邊形在幀掃描時就顯示，而最下方的六邊形則要相隔才顯示，這個時間和視覺生理的反應時間相比，影響較大，必須給予補償。補償的方法如下：將屏幕分成8大行，分別給予0～7的行標號，相鄰兩大行之間時間差各個六邊形區域均落在相應的行中，如果有的六邊形落在兩行中，六邊形較多部分所占行定為該六邊形的行標號。這樣，最頂部標行不必補償，標行處的各六邊形反應時間如果還是按標行起始時間計算，則實際延遲，必須要將此消除，測得標行六邊形反應的時間需減去，也即將反應提前，以此類推，如對標行，則需提前，這些計算在計算機進行數據處理的時候，根據各刺激六邊形所在的行標號，給予不同的時間補償。采用這種補償方法，隻在行內存在著時間差，將的時間延遲縮小到1.68。
第七節 提高信噪比
提高信噪比的方法有多種，包括偽跡剔除、空間平均和濾波等。
一、偽跡剔除
眨眼和微小眼球運動都會造成曆記錄的失敗，為了保證記錄反應成功，可以采用偽跡剔除法，偽跡剔除的方法有兩種：①剔除不合適的記錄段，剔除後此段反應為零，造成記錄的不完整性，必須對此段再作測試，將重測試的反應結果作取代，這樣勢必會增加測試時間；②剔除不合適的單次反應，通過全局的反應來預測和剔除異常信號，在整個記錄中采用一個反應估價值，均超過此估價值，可作為偽跡，將其剔除。
二、空間平均
將測試區與周圍6個六邊形相比較作加權平均，周圍每個區域的權重比例可以進行調節，但必須注意，權重越大則該點本身的值保留越小，一般這種空間平均最多可以進行3次迭代。
三、濾次
由於各種頻率波的幹擾，使記錄波形產生一定的噪聲，可以通過儀器的濾波裝置濾去一些幹擾波，最常用的有50隻陷波濾波器。應注意過多使用各種頻率的濾波會使反應振幅變小。