（2）第二部分——自上東京看燈到招安——各本都有。這一大段之中，有黑旋風喬捉鬼，雙獻頭，喬坐衙等事，都是元曲裏很幼稚的故事，大概這些還是原百回本的遺留物。但這一大段裏有“燕青月夜遇道君”一節，寫的頗好。大概這一大段有潦草因襲的部分，也有用氣力改作的部分。自從郭武定本出來之後，這一大段也就不曾有什麼大改動了。
（3）第三部分——征遼至凱旋——是郭武定本加入的。這一大段之中，寫征遼的幾次戰事實在平常的很。五台山見智真長老的一節，我疑心是原百回本征田虎的末段，因為田虎在山西作亂，故亂平後魯智深與宋江乘便往遊五台山。郭武定本既刪田虎的一大段，故把五台參禪的一節留下，作為征遼班師時的事。這一部分自從郭本加入以後，也就無人敢刪去了。
（4）第四部分與第五部分——田虎與王慶兩寇——是原百回本有的，郭本始刪去，至百二十回本又恢複回來；百十回本，百十五回本，百二十四回本也都恢複回來。這兩部分的敘述實在沒有文學的價值，但他們的徼幸存留下來也可使我們考見原百回的性質，可以給我們一種比較的材料。最可注意的一點是這兩部分的文字有兩種大不同的本子：一種是百二十回本，一種是百十回本，百十五回本，《征四寇》本，與百二十四回本。百二十回本是用原百回本的材料來重新做過的。何以知道是用原材料呢？因為這裏麵的事實如緣纏井一節，即是元曲《黑旋風鬥雞會》的故事，是一證；有許多人物——如瓊英、鄔梨、喬道清、龔端、段家——皆與各本相同，是二證。何以知是重新做過的呢？因為百二十回本寫王慶的事實與各本都不同。各本的回目如下：
高俅恩報柳世雄，王慶被陷配淮西。
王慶遇龔十五郎，滿村嫌黃達鬧場。
王慶打死張太尉，夜走永州遇李傑。
快活林王慶使棒，段三娘招贅王慶。
百二十回本的回目如下：
謀墳地陰險產逆，踏春陽妖豔生奸。
王慶因奸吃官司，龔端被打師軍犯。
張管營因妾弟喪身，範節級為表兄醫臉。
段家莊重招新女婿，房山寨雙並舊強人。
這裏麵第四回的回目雖不同，事實卻相同；那前三回竟完全不同。大概百二十回本的編纂人也知道“高俅恩報柳世雄”一回的人物事實顯然和王進一回的人物事實有重複的嫌疑，故他重造出一種王慶故事，把王慶寫成一個壞強盜的樣子。這是百二十回本重新做過的最大證據。此外還有一個證據：百回本的第九十回是“雙林渡燕青射雁”（即《征四寇》的第十七回），百二十回本把這一件事分作兩回，改九十回為“雙林鎮燕青遇故”，後麵接入田虎、王慶的二十回，至百十回方才是“燕青雙林渡射雁”。這種穿鑿的痕跡更明顯了。
百十回本，百十五回本，百二十四回本，《征四寇》本，這四種本子的田虎、王慶兩部分，好像是用原百回本的原文，雖不免有小改動，但改動的地方大概不多。
（5）第六部分——平方臘一段與盧俊義、宋江等被毒死一段 ——是郭武定本有的，後來各本也差不多全采郭本，不敢大改動。平方臘一段平常的很，大概是依據原百回本的。出征方臘之前的一段（百回本的第九十回）寫宋江等破遼回京，李逵、燕青偷進城去遊玩，在一家勾欄裏聽得一個人說書，說的是《三國誌》關雲長刮骨療毒的故事。《三國誌》的初次成書也是在明朝初年，這又可見《水滸》的改定必在《三國誌》之後了。
平定方臘以後的一段，寫魯智深之死，寫燕青之去，寫宋江之死，寫徽宗夢遊梁山泊，都頗有文學意味，可算是《忠義水滸傳》後三十回中最精采的部分。這一段寫宋江之死一節最好：
宋江自飲禦酒之後，覺得心腹疼痛，想被下藥在酒裏，急令人打聽，……已知中了奸計，乃歎曰：“我自幼學儒，長而通吏，不幸失身於罪人，並不曾行半點欺心之事。今日天子聽信奸佞，賜我藥酒。我死不爭，隻有李逵見在潤州，他若聞知朝廷行此意，必去哨聚山林，把我等一世忠義壞了。”連夜差人往潤州喚取李逵刻日到楚州。……李逵直到楚州拜見，宋江曰：“……特請你來商議一件大事。”李逵曰：“什麼大事？”宋江曰：“你且飲酒。”宋江請進後廳款待，李逵吃了半晌酒食。宋江曰：“賢弟，我聽得朝廷差人送藥酒來賜與我吃。如死，卻是怎的好？”李逵大叫：“反了罷！”宋江曰：“軍馬都沒了，兄弟等又各分散，如何反得成？”李逵曰：“我鎮江有三千軍馬，哥哥楚州軍馬盡點起來，再上梁山泊，強在這裏受氣！”宋江曰：“兄弟，你休怪我。前日朝廷差天使賜藥酒與我服了。我死後恐你造反，壞了我忠義之名，因此請你來相見一麵，酒中已與你慢藥服了。回至潤州必死。你死之後，可來楚州南門外蓼兒窪，和你陰魂相聚。”言訖，淚如雨下。李逵亦垂淚曰：“生時服侍哥哥，死了也隻是哥哥部下一個小鬼。”言畢，便覺身子有些沉重，灑淚拜別下船。回到潤州，果然藥發。李逵將死，吩咐從人：“將我靈柩去楚州南門外蓼兒窪與哥哥一處埋葬。”從人不負其言，扶柩而往，……葬於宋江墓側。