黃巢占領福州後，又開始向南運動，包圍了廣州。
在此期間，黃巢曾致書浙東觀察使崔璆、嶺南東道節度使李迢，要求朝廷封自己為天平節度使。二人懼怕黃巢威勢，極力申奏，但朝廷不許，黃巢不甘心又自己上書，求為廣州節度使，朝廷這次隻授予了他府率的官職。
黃巢一輩子最恨別人看不起自己，老子要說都是當皇上的料，找你要個節度使都不行，好吧，那我就把廣州攻下來給你們看看。
同年九月，廣州失守。
因為唐朝，並不像後來明清那樣閉關鎖國，所以像廣州這樣瀕臨南海的港口城市，有著非常多的跨國商人和外國傳教士。
黃巢攻陷廣州後，發現這是一個不同於中原的世界，這裏再也不是什麼蠻荒之地，這裏充滿了富庶，且有著外夷文化的衝擊，各種宗教更是在這個城市中，交互錯雜。
黃巢連番血戰，糧草早已殆盡。所以，又一番新的搶掠開始了，黃巢軍見人就殺，看到值錢的就搶來，不值錢的便一把火燒掉。
而各國在廣州的教會，也沒有幸免。回教、基督教、猶太教皆被黃巢視為邪教，黃巢命令將成千上萬的教徒統統殺死，也就是說在廣州城內，除非你信奉儒學，有其他信仰的人一律殺光，無論國籍。
當黃巢的軍隊到達了廣州的港口後，黃巢傻眼了，因為大批的外國商船停靠於此，船上的貨物不計其數。還有很多是唐朝要出使外國的商船，這些船上也裝著中國最好的特產。
黃巢立即下令，把這些商船上的貨物全部收繳充當軍費。可以說黃巢是大大發了一筆橫財，可是碼頭的水手和各國的商人們卻遭了殃。黃巢下令無論他們反抗與否，都全部殺死。
一時間，廣州碼頭的屍體堆積如山，海水都被染成了紅色。
據某些學者推測，廣州屠城，保守估計有十二萬人被殺，其中包括回教徒、基督教徒、猶太人及平民。
這件事情造成了極壞的國際影響，唐僖宗聽聞大怒，一向自由、開放、和平的唐王朝形象遭到了極大的破壞。
唐僖宗此時恨透了黃巢，從太宗皇帝到現在，唐朝威儀一直廣播世界，但是這時卻發生了這樣的事情。唐僖宗已經下定決心，一定要除掉黃巢這個敗類。
黃巢率軍離開廣州，向西北進發，攻取了桂州（今廣西桂林），恰遇湘江水暴漲，黃巢軍便乘數十隻大木筏順流而下，經永州（今湖南零陵）、衡州（今湖南衡陽），攻占了潭州（今湖南長沙）。之後，又轉而進攻饒、信、池、宣、歙、杭等十五州。這時黃巢軍又得以發展，黃巢軍此時的人數已經達到了二十萬人。
唐僖宗此時派出了淮南節度使高駢，來攻打黃巢。廣明元年（公元880年）三月，高駢遣其猛將張璘渡江南下。
不可一世的黃巢終於遇到了可與之抗衡的宿敵，黃巢且戰且敗，退守饒州（今江西波陽）。張璘又乘勝進軍，黃巢無奈退守信州（今江西上饒）。
此時，各地節度使的援軍已經趕到，眼看著黃巢的軍隊就會土崩瓦解，徹底煙消雲散。可是此時黃巢又使出了無恥的伎倆，第一是賄賂，第二是“投降”。
賄賂當然是真的，但是投降是假的。張璘和高駢減慢了進攻的速度，緩了緩節奏。這給了黃巢一個難得的喘息機會，黃巢利用這個空隙迅速北渡淮河。然後偷襲張璘部，張璘戰死。
此時，各路節度使都已經以為黃巢被高駢所滅，也已散去。聽聞黃巢又死灰複燃，再來圍剿已無可能，而且各藩鎮之間也存在著極大的矛盾，所以都不願再來和黃巢較量。
黃巢正是抓住了這一個機會，把下一個進攻的目標定在唐朝的東都洛陽。
這時朝廷亂作一團，大宦官田令孜自請率兩神策軍弓弩手去守潼關，更多人則認為黃巢軍擁有六十萬之眾，潼關又無重兵，難以堅守。
潼關是首都長安的大門，一旦失守，長安城必然不保。唐僖宗衡量利弊，還是決定讓田令孜率兵東守潼關，以保護長安城。
十一月十七日，黃巢大軍進抵洛陽城下，唐將齊克讓退守潼關，東都留守劉允章則率眾出城迎接黃巢入城，洛陽失守。
黃巢軍進占洛陽不幾日，即向關中挺進。
當黃巢走到潼關時，麵對潼關上早已嚇得發抖的軍士，黃巢心中無限的得意 ：“吾道淮南，逐高駢如鼠走穴，爾無拒我！”
連高駢這樣的猛人都怕了我，你們這幫鼠輩還要在這抵擋我的大軍嗎？這是黃巢一生中說的最有底氣，也最有氣概的一句話，此時他心中所受的委屈，全部在這一刻得到了巨大的釋放。
潼關之上的士兵都是神策軍，這本來是一支由長安豪富子弟組成的軍隊，他們隻是為了厚得供給和賞賜才賄賂宦官掛名軍籍的，平日高車大馬，悠然自得，未嚐經曆戰陣。
聽說出征，嚇得他們抱頭痛哭，為了逃避戰事，他們以金帛雇商販與貧民代自己去鎮守潼關。