隨著“扁宋會”、連戰訪問大陸等事情一再的針鋒相對，陳水扁和李登輝雙方矛盾再次急劇上升。為拉抬民進黨“國代”選情，陳水扁在接受偏“台獨”色彩的電視台專訪時，對李登輝采取了近乎“割袍斷義”的決絕行動。他連續炮轟李登輝“想做台灣的國父”，還要李登輝“不要認為，我像他兒子一樣，就把我當成他兒子”，就算是“父親要管兒子，也沒那麼簡單”。李登輝聽完這番話後，連連向身邊的人表示自己對陳水扁的言論感到“心痛、心寒”，還哀歎的說道：“現在台聯和我對陳水扁來說，已經沒有利用價值了！”李登輝的“台聯黨”更是跳出來反擊陳水扁，說陳水扁不要臉，到處跟人說自己是台灣之子，甚至比吳三桂還不如。至此，陳水扁和李登輝的關係徹底陷入了冰點。
台灣“國代”選舉結束後，陳水扁又想回頭去找李登輝，但是李登輝並沒有理睬。陳水扁兒子陳致中結婚的時候，陳水扁想借這個場合與李登輝“一笑泯恩仇”，所以早早就派人向李登輝送去請帖。據稱，陳水扁本人還曾兩次打電話，可是李登輝都沒有回應，甚至連祝福新人的話都不願說。上次陳水扁嫁女時曾踴躍參加的李登輝極為冷淡，強調自己早已排定其它活動，自然不能去參加婚禮了。對於陳水扁稱將在忙完兒子終身大事後，向李登輝“請益第二階段修憲”一事，李登輝更是公開向媒體嘲諷地說：“請益？開玩笑，不要這樣說，不要把責任都推給我，每次出事情就把責任推給我，我不是那麼好欺負！”
“台獨”媒體大亨林榮三之子結婚的時候，陳水扁終於和李登輝坐到了一個飯桌上吃飯，對此，陳水扁急不可耐地對外宣稱：“相信看到阿扁與李前總統一起，也是在座所有人都共同高興的事”。第二天在接受電視采訪時，陳水扁還振振有詞地指責外界拿扁李關係“做文章”，說扁李關係其實並沒有那麼差。然而李登輝一席“在別人的婚禮上，講那些做什麼！”的話，卻打破了陳水扁企圖製造“扁李和好”的假象。李登輝甚至主動把矛頭指向陳水扁，質疑他政策反複，中立性的判斷太多，自立性的判斷太少，還說這樣執政的人“軟手軟腳”，讓老百姓無所適從。