朝廷之中的暗流突然開始湧動。
開封府城的陷落，讓皇上震怒，也讓一些人看出皇上對內閣極大的不滿，特別是兩次的朝會，內閣首輔周延儒認為目前需要穩定局勢，暫時不要追究已經過去的事情，團結一致圍剿流寇，可這個提議被皇上直接否決，皇上要求追究開封府城陷落的責任。
已經沉默很長時間的東林黨人，抓住了這個機會。
蝸居了很長時間的工部右侍郎張溥，都察院右僉都禦史張采、楊彝，大理寺右寺丞吳昌時，詹事府右俞德龔鼎孳等人，明銳的把握住時機，開始了行動。
張溥等人是已經遭遇重創的東林黨人之中的骨幹，內閣大臣錢士升、侯恂等人也是非常看著張溥等人的，朝廷之中發生的任何事情，他們幾乎都要告知張溥等人，錢士升等人還曾經努力，讓發配到遼東的錢謙益和瞿式耜等人回到京城，可惜機會不成熟，沒有能夠成功。
就在皇上決定追究開封府城陷落責任的同時，張溥召集張采、楊彝、吳昌時和龔鼎孳等人，詳細商議，結合他們掌握的情報，開始提出來彈劾的奏折。
張溥等人的彈劾奏折，在朝中迅速引發了波瀾。
按照張溥等人的建議，已故的兵部尚書、五省總督孫傳庭，應該要遭受到懲戒，因為其在作戰部署的安排方麵的失誤，直接導致後來的開封府城失陷，已故的河南巡撫吳甡，應該被削去一切的名爵，因為其對開封府城的陷落有著直接的責任，河南總兵賀人龍應該交由刑部和大理寺審訊，其身為河南總兵，未能保住開封府城，明顯失職。
至於說朝廷之中，張溥等人也將矛頭直接指向了已經辭去內閣大臣、兵部尚書職務的楊嗣昌，剿滅流寇的整體作戰部署，是兵部負責的，開封府城的失陷，表明兵部在用人上麵和戰略部署方麵，都出現了重大的失誤，楊嗣昌必須要承擔主要的責任。
內閣次輔張鳳翼也在被彈劾的人員之中，按照內閣首輔和內閣次輔的分工，原則上內閣首輔周延儒協理禮部、吏部和戶部的事宜，內閣次輔張鳳翼協理兵部、刑部和工部的事宜，兵部出現如此重大的失誤，導致開封府城陷落，張鳳翼同樣有著不可推卸的責任。
張溥等人的奏折，猶如重磅炸彈，不少人認為他們的膽子太大了。
不過內閣首輔周延儒卻是暗自佩服，他從彈劾奏折之中，看到了錢士升和侯恂等人的影子，更是看到了錢士升等人揣摩皇上心思的本領。
皇上之所以一定要抓住開封府城陷落的事情，追究相關人員的責任，就是對內閣不滿意，希望通過這件事情來整頓內閣，而內閣之中的張鳳翼、楊一鵬、楊嗣昌等人，被認為與南京兵部尚書鄭勳睿之間的關係不錯，皇上早就不滿意了，隻不過找不到機會發泄而已。
錢士升、侯恂和張溥等人，一定是經過了仔細的分析，切中要害上奏了這份彈劾的奏折，他們在關鍵的時刻迎合了皇上的心思。
周延儒幾乎都是在皇上的身邊，他隱隱感覺到了，皇上對鄭勳睿和鄭家軍已經是恨之入骨，日夜擔心，要不是因為流寇和後金韃子的威脅，早就會對鄭勳睿和鄭家軍動手，可就算是局勢危急，也不能夠眼睜睜看著鄭勳睿和鄭家軍壯大起來，東林黨人與鄭勳睿之間有著不可調和的矛盾，這個時候啟用部分的東林黨人，放開手腳去對付鄭勳睿，皇上可以居中協調，毫發無損的看著兩邊廝鬥，等到兩敗俱傷局麵出現的時候，出手去收拾鄭勳睿。
錢士升和侯恂等東林黨人，應該是看清楚了局麵，不過為了振興東林黨，為了能夠爭取到權力，付出一定的犧牲也是值得的，東林黨人通過效忠皇上、通過與鄭勳睿之間的博弈，來重新發展壯大，未嚐不可。
經過了仔細認真的分析，也經過了長時間的思索，周延儒終於下定決心，在皇上決定追究開封府城陷落責任的時候，辭去內閣首輔的職位，讓位給東林黨人，就讓這些東林黨人給皇上賣命，與鄭勳睿去博弈。
周延儒很清楚，一旦東林黨人決定要動手，等待他們的就是覆滅的命運，皇上保不住這些東林黨人，關鍵時刻也不會出手保護，當初在南直隸和淮北等地發生的事情，他記得很清楚，鄭勳睿是讀書人，不願意動手殺讀書人，那是因為勝券在握，也是希望東林黨人能夠反省，不過鄭勳睿的隱忍換來如此的局麵，人家再次動手的時候，還會手軟嗎。