一、古代驛道
明代設置驛站，在天祝境內有岔口驛、鎮羌驛（今金強驛）、安遠驛。並有從華藏寺向東經鬆山、過景泰或古浪通往內蒙古阿拉善和寧夏至北京的古道；向西進石門溝過五台嶺至天堂寺渡過大通河經青海互助到西寧的古道。
二、公路
（一）國道公路
甘新公路通過天祝地界全長54．6公裏，始建於民國26年（1937年）。
國道主幹線：連霍（連雲港——霍爾果斯）高速公路天祝段於1998年測線修築，2001年交付使用。縣境內54公裏，為二級公路。專用道032線（永登——天祝煤礦），全長76公裏，縣境內長34為公裏，四級路。專用道042線（石門河——炭山嶺）全長60公裏，為三、四級公路。
（二）縣鄉公路
全縣共有縣道201．23公裏、鄉道303．46公裏、村道1040．98公裏。
縣道142線（華藏寺至東大灘）全長78公裏，其中天祝縣境內69公裏。華藏寺至幹城段59公裏為瀝青碎石路麵，其餘為砂礫路麵。
興鬆公路（興泉至鬆山）全長64．5公裏，其中天祝縣境內15．7公裏，三級公路。
縣道143線（炭山嶺至天堂寺）全長27公裏，三級公路，瀝青碎石路麵。
曹西公路（曹家台至西溝口）全長32．2公裏，三級公路。
古哈公路（古浪至哈溪）全長43．32公裏，其中天祝縣境內27．32公裏，三級公路。
南旦公路（南岔河至旦馬）全長29公裏，其中天祝縣境內23公裏，四級公路。
牛祁公路（牛家花園至祁連）全長42．8公裏，其中天祝縣境內20公裏，四級公路。
蔣東公路（蔣家坪至東坪）全長16．36公裏，四級公路。
哈毛公路（哈溪至毛藏）全長41公裏，首段6公裏山重三級公路，後35公裏為山重四級公路。
金代公路（金強河至代乾）全長28．8公裏，山嶺重丘區四級公路。
華柏公路（華藏寺至柏林）全長13．99公裏，瀝青混合料路麵。
安柳公路（安遠至柳條河）全長26．74公裏，
連賽公路（連城至賽拉隆）全長4．15公裏，山嶺重丘區四級公路。
石門溝至藥水神泉公路旅遊專線，全長19．5公裏，農一級公路。
三、交通運輸業
1954年，酒泉運輸公司車站在天祝設打柴溝、天祝運輸站，開始辦理客貨運輸業務。同年縣車隊有貨車3輛/9噸，年貨運量0．42萬噸，年貨物周轉量5萬噸公裏。有客運轎車13輛，線路9條。年客運量40．6萬人，年旅客周轉量2292萬人公裏。
1988年，建成天祝汽車站，為三級客運站。2002年，縣汽運輸公司改製為民營企業。
2005年，全縣從事道路運輸業戶657戶，道路運輸產業實現產值9300萬元。有客運車輛147輛，貨運車輛510輛；客運線路19條，其中跨省2條，跨地、市7條，縣內10條。平均日發客車67班次，全年完成客運量86萬人，貨運量198萬噸，客運周轉量5880萬人公裏，貨運周轉量9591萬噸公裏。
2006年，全年完成客運量90萬人，貨運量380萬噸，客運周轉量3000萬人公裏，貨運周轉量24200萬噸公裏。
四、鐵路
1953年10月1日，蘭新鐵路蘭州至打柴溝段竣工通車，1955年5月1日打柴溝至武威段竣工通車。蘭新鐵路在天祝縣境內長71．5公裏，設華藏寺、石門河、安家河、打柴溝、深溝、岔西灘、金強河、烏鞘嶺、青河、天祝10個車站及打柴溝機務段。
蘭新鐵路在縣境內共有大小鐵路橋梁35座，過水涵管洞80道，隧道2處。1989年前為蒸汽機牽引。1990年，蘭（州）武（威）段電氣化鐵路改造工程竣工，列車機車改為電力機車，縣內各車站均可辦理客貨運業務。
石門河至馬營坡全長8公裏的鐵路專用線，主要向石門河火車站轉運原煤和石膏。後被拆除。
2002年，國家批準修築蘭新鐵路蘭州至武威複線工程，複線在天祝過境段全長73．98公裏，其中烏鞘嶺雙隧道全長20．05公裏。隧道進口自天祝縣打柴溝鎮上河東村，出口至古浪縣黑鬆驛鎮龍溝村，2005年底隧道貫通。2003年起對華藏寺車站進行擴建改造，成為蘭州至武威間段的中心站。