十萬邊軍被安置在了十個分散的軍營裏，經過一番進一步的登記造冊，每個邊軍士兵拿到了一個身份牌和兩套軍服。
對於這個身份牌軍服，很多邊軍士兵都感覺新奇。軍牌這玩意做大的作用，就是戰場上確認陣亡士兵的身份。而紅色的軍服，看起來十分顯目、威武。大明崇尚火德，官員製服都是紅色為主。後來的滿清，則認為是北方黑水戰勝了明王朝的火，水為黑色，所以滿清官服為黑色。
接著又是確認編製，一直忙活到三月中旬才把十萬邊軍編成了九個步兵師。
就步兵師的編製問題，朱由校吸納了第五步兵師在遼東戰場上積累的經驗，決定給火槍兵裝備鐵甲。不過孫傳庭卻是有不同的看法，對朱由校建議道：“臣以為，火槍兵並不需要裝備鐵甲。一來裝備鐵甲之後機動能力有所下降。二來隻需給京營裝備足夠的野戰炮，在戰場上建奴步兵還沒有靠近上來，就會先被我們的野戰炮狂轟一頓，到時候建奴未必能對火槍兵方陣傾瀉多少箭支。”
“愛卿所言也不無道理，不過火槍兵裝備鐵甲，在戰場上也可萬無一失。”朱由校想了想，感覺火炮有時候未必時時刻刻都能支援到步兵，戰場局勢變化有點快，所以還是堅持給火槍兵裝備鐵甲。
“陛下，那不如將京營編練為兩種，一種火槍兵身著鐵甲，專門派往遼東作戰。另一種不裝備鐵甲，也無需配備弓箭手。可以用於其他戰場。同時這樣也較為節約軍費。”孫傳庭嚐試著建議道，拿出了個折中的方案。
“好，就怎麼辦。”朱由校聽了之後當即同意了，主要還是成本啊！
“另外長槍兵的縱深方麵，十人確實過多，臣以為三人就非常足夠了。若是擺開陣勢，敵方能在火器打擊之下衝到近前，陣型也必然較為散亂，三排長槍兵足以穩住陣腳。”孫傳庭繼續建議道，對長槍兵的縱深削得更狠。主要是感覺裝備了野戰炮之後，完全沒那個必要。
朱由校在這方麵的想法則趨於保守，說道：“三人太少了，持續的肉搏能力比較差，還是四個吧！”
“是，陛下。”孫傳庭沒有繼續堅持，明軍火器部隊的肉搏能力差，一直是個問題。薩爾滸戰役更是表現得尤為致命。
當初薩爾滸戰役，野豬皮能以騎兵在山區擊敗大量明軍，是有多重因素包含其中的。其一，明軍是火器部隊，在山區難以展開，不像在草原上對付蒙古人那樣，大老遠的就發現蒙古人的主力騎兵，然後提前擺開陣型，先用火器對敵人進行一番飽和式轟擊。所以野豬皮的騎兵盡管也不太適合在山區作戰，但明軍的劣勢更大。其二有人給野豬皮通風報信，不是別人，正是當今的朝鮮王滄海君。這家夥表麵上向大民稱臣，實際上是個反動分子。
於是乎野豬皮帶著騎兵突然殺出，明軍在山區行軍，根本毫無陣型可言，自然是直接被野豬皮殺潰。
簡單的說，薩爾滸戰役中，明軍的問題就是‘沒前排’頂不住，肉搏戰能力太差。山區火器又擺不開陣型，以至於又沒有火力輸出。沒前排，沒輸出，結果自然就GG了。
君臣之間一番商議，又對京營的編製進行了改變。曾讓朱由校鳴鳴自得的‘天啟方陣’，此時已經被修改得麵目全非。