隨著春天的降臨，西域的野花開得漫山遍野，那些經過鮮血澆灌的鮮花，顯得格外的鮮豔。
明軍平定準噶爾，僅僅用了一個多月時間。
整個準噶爾盆地在一場大戰之後，再度恢複了秩序與寧靜，準噶爾牧民在明廷的幫助下，逐漸開始恢複生產。
同時關內來的農業技術人員，也開始指導這些準噶爾牧民從事棉花種植業。經過一番商議和‘分贓’，這些從事棉花種植業的牧民，歸為準噶爾部首領哈喇忽刺直接管理與抽稅，並給與了哈喇忽刺五萬戶的統治定額與棉花種植地。
每戶棉農，給與土地五十畝，哈喇忽刺相當於變成了一個擁有250萬畝棉田的超級地主，當然這些土地不是哈喇忽刺的，但哈喇忽刺卻能夠從這些土地中抽取十分之一的稅收。
至於人口不足的問題，可以慢慢繁衍。準噶爾部盡管被打得成年男子損失慘重，但是那些十幾歲的少年還是很多的，過些年人口自然能夠恢複。
讓準噶爾部從事農業，也是一個消化過剩人口的好辦法。再加上那個的推廣，再讓一部分蒙古人出家當和尚，基本上也就沒有什麼過剩人口了。如果還有過剩人口，那就去城市當工人。
至於其他合適種植棉花的土地，則分配給願意移民到西域的漢民耕種，剩下的則由生產兵團進行開發。
一個和諧的戰後新秩序就這樣被建立了起來，在這個新秩序之下，大明對準噶爾部的持械進行了嚴格的限製，刀具是可以擁有的，但是弓箭已經全部上繳，從此不能裝備弓箭和長械武器。作為戰敗者，準噶爾部投降的時候就接受了這個條件。
準噶爾部此時也有自知之明，見識了明軍的恐怖戰鬥力之後，加上接下來又能過上安生的日子，再也沒有任何反叛的念頭。
在接管了準噶爾部的邊防之後，大明與中亞的布哈拉汗國正式接壤，布哈拉汗國和準噶爾部蒙古又有很大的不同，中亞地區被一些極端宗教滲透嚴重。
朱由校作為穿越者，自然很明白，蒙古人與漢人在同一個國家內生活還是可以和平相處的。但是和那些極端宗教，卻是摩擦不斷。
此時那些極端宗教已經滲透到了西域，朱由校製定的西域政策中，對待這些極端宗教的方案就是堅決打擊。
寺廟拆了，經書燒了。
何謂極端宗教？
就是一種具有欺騙性的宗教，把一切不可解釋的東西，都歸結於某個神，通過欺騙性讓人產生安全感，又通過欺騙性達到染指政治的目的。
人生來都會迷茫，我從哪裏來？
如果連自己從哪裏來都沒搞清楚，就更不知道自己要去向何方了。
麵對這些未知的問題，人都會感到恐懼，感到沒有安全感。於是一些宗教就產生了，通過一番胡謅之後，把某種神給塑造了出來。
相比之下，中國道家並非宗教，道家本身不具備欺騙性，所有在解釋那些未知的東西時，道家是給出係統理論進行解釋的。因此漢代成立的五鬥米教（道教）會消亡，因為道教用的是道家的學術作為宗教核心，並不具備欺騙性。