從朱元璋登基開始，“紮籬笆”工作就在有條不紊的進行，到洪武二十年，明王朝在北至遼東半島，南至廣西北部灣的漫長海岸線上，一共設置了五十八個衛，八十九個所，安置戰艦兩千多艘，精銳部隊三十萬人，在整個的中國東部沿海，打造出了一條當時世界上最堅固的海上防線，從明朝洪武五年開始，沿海明軍就陸續有了殲滅倭寇的戰報，明朝洪武十年以後，倭寇對浙江，山東，遼東地區的入寇，也多以失敗居多。打遊擊戰的倭寇，真碰上正規軍的明軍，硬碰硬打當然不是對手，像過去那樣“打一槍換個地方”，這條防線修的麵麵俱到，換個地方照樣挨揍，朱元璋苦心修起的“籬笆”，貌似是無懈可擊了。
不對，還是有一個漏洞的——台灣。
因為朱元璋的籬笆是沿著海岸線修的，但台灣卻是一個島，朱元璋的籬笆紮的再緊，也不能跨過大海，把台灣島也“包”進去。
這下就讓倭寇找到漏洞了，再來中國開工的時候，別的地方不去，先去台灣島和澎湖列島，明朝要是防備的嚴實，就先窩在島上看看情況，明朝稍有鬆懈，就趁機進兵撈一票，反正台灣島上有居民有糧食，倭寇千把人，給養補充能供得上，耗個十天半月沒問題，退一步說，就算是進不了中國沿海，臨走在台灣撈一票也值了。
這就麻煩大了，澎湖雖有明朝的“巡檢司”，但兵少勢孤，用以自保都難，哪有能力攻擊倭寇？請求戰友增援？小心中了倭寇的“調虎離山”，你沿海的船隊剛出動，說不定人家就乘虛而入了，往台灣調兵？台灣當地人口稀少，增了兵糧食給養供應都困難，不說島上百姓要勒緊褲腰帶，單是來來回回的運糧食，這成本核算可就虧大了。洪武十八年，十九年，倭寇連續兩年竄犯福建，都是用的這招，先紮在台灣，然後找機會在福建“叼一口就跑”，來來回回的在福建與台灣島之間搞起了折返跑，直把當地明軍折騰得疲憊不堪，特別是洪武十九年七月，倭寇以台灣島為基地，在福建沿海連續轉悠了一個月，數次聲東擊西，相繼搶掠了漳州，泉州，福州，興化，廈門等地，賺得盆滿缽滿後方才揚長而去。戰報傳到明朝都城南京後，氣的朱元璋暴跳如雷，破口大罵當時的閔浙巡撫湯和：“開國功臣，竟奈何不得區區倭奴”。
可罵完了還是要解決問題，說湯和無能這是氣話，仗打成這個慫樣，一是倭寇太狡猾，二也是台灣這個“漏洞”太難補。
所以，朱元璋再次“農民思維”：難補，那就不補了。
不就是籬笆紮不著嗎，那你別在籬笆外麵，搬到籬笆裏麵來不就行了？
當然，不止朱元璋這麼想，此時明王朝內部許多“名臣”也這麼想，比如後來當過“皇太孫”朱允炆老師，又當過大明王朝兵部尚書的黃子澄，此時雖隻是個翰林院編修，卻是位卑未敢忘憂國，此時也大膽上書言事，認為“小琉球漢夷雜居，孤懸海外，守之徒耗錢糧，不如遷其民以收抗倭之效也。”正中朱元璋“農民思維”下懷。
說中了就辦事，洪武二十年下旨：澎湖巡檢司裁了，兵撤了，人都強製拆遷了，快裁快撤快拆，不讓鬼子搶走一粒糧。幾代台灣移民的財產，房屋，糧食全毀了，台灣“一夜回到解放前了。”當然，身為苦出身的開國皇帝，朱元璋也很理解移民們的難處，遷至福建安置的台灣移民，家家給地給房子，“拆遷費”也發的足，明朝初期朱元璋重手肅貪，敢貪汙民脂民膏的貪官汙吏也稀少，總之還算是日子過得去了。
當然，台灣“被搬家”，在當時隻是朱元璋抗倭戰略裏的一環，這個整個的“戰略”就是今人所熟悉的明朝“海禁”，為了防備倭寇入侵，明王朝禁絕了一切民間的海外貿易往來，嚴禁沿海邊民出海，以防與倭寇勾結。同時強化官方貿易，特別是與日本之間的“朝貢貿易”，把兩國的經濟往來，作為逼迫日本限製倭寇的外交手段。
值得一提的是，雖然台灣移民們紛紛“被搬家”，但明朝此舉，並非是今天某些學者論證的那樣“放棄台灣”，台灣當地的“原住民”高山族，諸多部落紛紛接受了明王朝的冊封，《明實錄》紀錄過的泰雅，阿雅登部皆曾入京朝貢，明王朝都是“以土司之禮待之”。明朝永樂時期，日本“北朝”大將軍足利義滿（就是《聰明的一休》裏被一休耍弄的那位）就曾遣使招撫台灣基隆原住民首領，非但未能成功，當地原住民更是向明王朝彙報此事，永樂皇帝朱棣也曾為此遣使申斥日本，雖是孤懸海外，但台灣“原住民”對中央政府的忠誠，可謂赤心不改。