12月，由兩院院士投票評選的“2000年度中國十大科技進展”新聞揭曉，“超級雜交稻取得重大進展”列為榜首。“隆平農業高科技股份有限公司”在深圳證券交易所上市，簡稱“隆平高科”。
2001年
2月19日，獲得首屆“國家最高科技獎”，在北京人民大會堂舉行的頒獎典禮上，接授了由江澤民主席親自頒給的獎勵證書和500萬元獎金。
8月31日，獲菲律賓2001年度“拉蒙·麥格賽賽獎”。
11月經國家主席江澤民推薦，赴委內瑞拉推廣雜交水稻。
12月8日，被香港中文大學授予名譽理學博士。
2002年
1月18日，第二屆“袁隆平農業科技獎”頒獎大會在湖南雜交水稻研究中心舉行，13個縣（市、區）級單位獲獎。
4月1日～4日，出席並主持在海南省三亞市召開的國際水稻強化栽培學術討論會。
4月5日，美國權威雜誌《科學》發表中國科學家關於水稻基因組的論文，我國科學家率先繪製出由袁隆平院士提供的超級雜交水稻基因圖譜，人類第一次在基因組層麵認識水稻。國際科學界稱之為“世界生物學領域的裏程碑”。
5月14日，出席在越南河內召開的第四屆國際雜交水稻學術研討會，任組委會副主席，並作題為《超級雜交稻》的學術報告。為表彰他在越南發展雜交水稻所做出的傑出貢獻，越南政府授予他“越南農業和農村發展榮譽徽章”。
9月16日，出席在北京召開的首屆國際水稻大會，在會上作題為《超級雜交水稻》的學術報告。
11月18日～20日，出席在北京召開的政協第九屆全國委員會常務委員會第十九次會議。
12月4日，出席湖南省懷化市湖天開發區“國際雜交水稻城”項目啟動儀式。
2003年
3月，出席全國政協第十屆全體會議，並於3月13日當選為第十屆全國政協常委。
4月19日，應菲律賓總統阿羅約邀請赴菲考察雜交水稻，菲總統在碧瑤市總統行宮接見袁隆平院士。
10月3日，胡錦濤總書記視察湖南雜交水稻研究中心，袁隆平院士彙報超級雜交水稻新進展。
由袁隆平院士主編，中國農業出版社出版的《雜交水稻學》，先後於2003年8月和12月分別榮獲第11屆全國優秀科技圖書獎一等獎和第6屆國家圖書獎。
2004年
1月，榮獲以色列沃爾夫獎勵基金會授予的“沃爾夫獎”。
應邀赴澳門作超級雜交稻學術報告；聘請全國政協副主席馬萬祺擔任“袁隆平農業科技獎勵基金會”名譽理事長。
2月13日，出席在聯合國糧農組織總部羅馬召開的國際稻米大會，在會上發言，呼籲推廣雜交水稻。
3月30日，美國華盛頓召開的“2004年度世界糧食獎桂冠發布會”，榮獲世界糧食基金會授予的2004年度“世界糧食獎”。
5月9日，出席在耶路撒冷以色列議會大廈舉行的2004年度以色列“沃爾夫獎”頒獎典禮。卡察夫總統向袁隆平院士頒發獎狀和獎金。沃爾夫基金委員會負責人稱讚袁隆平是“現代農業研究史上一位科學巨人，對世界糧食生產產生了極大影響。”
8月16-18日，應馬來西亞元首基金會的邀請，赴馬進行考察訪問，幫助馬國發展雜交水稻，以解決基稻米不能自給的難題。
9月1-3日，出席在泰國首都曼穀舉行的“”首屆水稻的未來國際大會。泰國公主詩琳通代表國王向袁隆平院士頒發了“金鐮刀獎”，以表彰他在雜交水稻研究領域做出的傑出貢獻。
11月8日，湖南省人民政府在湖南農科院隆重召開“袁隆平院士榮獲世界糧食獎慶功會”，中共湖南省委副書記、省長周伯華代表省委、省人大、省政府、省政協對袁隆平院士獲世界糧食獎表示熱烈祝賀！會上，還宣讀了《湖南省人民政府關於對袁隆平院士給予嘉獎的決定》。周伯華省長向袁院士頒發配套獎50萬元人民幣。袁院士發言說，榮譽不隻是個人的，更是我國農業科技界。乃至國家的光榮，是在黨和政府的關心與支持下，在農業科技人員的共同努力下取得的。會上，袁隆平院士宣布把自己獲得的世界糧食獎獎金12．5萬美元全部捐贈給“袁隆平農業科技獎勵基金會”。
11月30日，菲律賓總統阿羅約在總統府接見袁隆平院士。
2005年
3月26日，回良玉副總理視察國家雜交水稻工程技術研究中心海南三亞南繁試驗基地，袁隆平院士彙報超級雜交稻育種新進展。
7月16日，中共中央政治局常委，全國政協主席賈慶林視察湖南雜交水稻研究中心，看望全國政協常委、“中心”主任袁隆平院士，袁院士向賈主席介紹了超級稻研究情況，並滿懷信心地說，依靠科技進步，中國不僅能夠實現糧食自給自足，還將促進農業產業結構調整，幫助農民致富，並可以幫助發展中國家解決糧食安全問題。
8月13日，中共中央政治局常委、國務院總理溫家寶視察湖南雜交水稻研究中心，看望袁隆平院士及科研人員。在“中心”試驗田邊，溫總理一下車就對袁院士說：“你到我辦公室看過我，今天我到你的試驗田來看你來了。”袁院士向溫總理彙報了中國雜交水稻研究的現狀和展望，超級雜交稻的研究目前已經圓滿完成第1期和第2期目標，現正向超級稻第3期13.5t/hm2的目標努力，采取的技術路線是將常規育種與分子技術相結合，利用野生稻的增產基因，稗草的有利基因及玉米的C4基因等，進一步提高水稻產量。聽後溫總理深情地說：“我相信，通過袁老師的努力和我們全體科研人員的努力，一定能夠實現這個（指超級稻第3期）目標。還可能在新的起點上，創造新的奇跡。”
9月11-13日，出席在天津召開的首屆國際生物經濟高層論壇農業生物技術分會第2屆雜交粳稻科技創新研討會。
10月19日上午，應中華人民共和國外交部的邀請，袁隆平院士在外交部第四期大使參讚學習班上，向我國駐80多個國家的大使、總領事和參讚作報告。報告會上，袁院士介紹了雜交水稻的基本知識，我國雜交水稻的成就和最新進展，以及雜交水稻在國外的發展形勢和現狀。精彩的報告引起了外交官們的濃厚興趣，袁院士和他的雜交水稻，將成為我國外交的“友好大使”。10月18日下午，國務委員唐家璿在釣魚台國賓館會見了袁院士，對他在雜交水稻上所作出的貢獻給予了高度讚揚和評價。
11月7-9日，應邀出席在上海光大國際會展中心召開的“2005亞太種子協會年會”。在會上以“中國超級稻的發展”為題作了學術報告，並榮獲“APSA傑出研究成就獎”。
11月16-17日，出席並主持湖南省2005年超級稻研究開發彙報會，有15個成員單位的課題主持人出席了會議。
2006年
3月26日，出席並主持在三亞南繁基地召開的“C4ga型超級雜交稻研究學術研討會”。
4月25日，榮獲美國科學院外籍院士殊榮。
8月21日，出席國家雜交水稻工程技術研究中心成都分中心揭牌儀式。
9月13日，出席在沈陽舉行的中國第3屆雜交粳稻科技創新論壇。
9月17日，在長沙會見美國杜邦先鋒種子公司作物研究總監KayPorter博士一行，並就水稻育種與種子生產進行探討。
10月4-7日，出席並主持與美國水稻技術公司的合作會議，在研究中心簽訂了改良0044不育係的技術委托合同。
12月19日，出席並主持在長沙召開的湖南省第6次超級稻研究開發協作組會議暨第4屆袁隆平農業科技獎頒獎大會。
12月25日，在長沙會見北京大學校長許智宏院士一行，向許院士一行介紹了超級雜交水稻的研究情況與“種三產四”豐產工程計劃。許智宏院士表示，袁隆平院士領銜的超級稻三期目標，是一項造福人類的偉大工程，我們所有從事植物生理學研究的專家，都願意做好相關的基礎研究，為這一宏偉計劃服務。
2007年
1月16日，作為特邀專家陪同溫家寶總理出席在菲律賓首都馬尼拉召開的中菲農業合作情況交流會
1月28日，在北京人民大會堂舉行的“和諧中國，2006年度影響力人物”頒獎盛典會上，被評為“2006年度影響力人物”。
3月16日，在香港中文大學作題為“超級雜交水稻育種新進展”學術報告。
4月29日，出席在美國首都華盛頓召開的美國科學院院士年會，正式就任美國科學院外藉院士。
5月10日，接受中央新聞媒體大型采訪團來長沙研究中心采訪，共30多家媒體50多名記者，采訪活動持續一周。
5月23-24日，出席首批學生畢業50周年聚會，並為聚會題詞：“久別重相聚，師生情誼長”；“風雨兼行五十年”。
6月3日，出席在湖南省委大禮堂舉行的“圓夢千秋”袁隆平先進事跡報告會。
7月9日，出席在湘陰縣召開的湖南省超級雜交稻“種三產四”豐產工程早稻現場觀摩會。
7月11日，出席在長沙舉行的非洲國家雜交水稻技術培訓開學典禮。
7月16日，出席在北京人民大會堂舉行的“十一五”國家科技支撐計劃“糧食豐產科技工程”重大項目簽約儀式，作了“種三產四”豐產工程的學術報告。
7月24日，出席在北京人民大會堂由中央組織部、宣傳部、統戰部，國家科技部、農業部和湖南省委共同舉辦的“袁隆平先進事跡報告會”，作題為“兩個心願”的發言。
8月29日，全國政協主席賈慶林在北京會見袁隆平院士。
9月13日，出席安徽蕪湖超級雜交稻“種三產四”豐產工程驗收會。
9月18日，由中央文明辦、全國總工會、共青團中央、全國婦聯聯合主辦的首屆全國道德模範評選活動揭曉，袁隆平院士榮獲“全國敬業奉獻模範”稱號，並在人民大會堂受到胡錦濤總書記的親切會見。
9月21日，中國科技館與中央電視台聯合主辦的“大家智行天下”之“大師講科普”大型科普電視節目第7期，作了題為“發展雜交水稻，造福世界人民”的講座。
10月15-21日，應中共中央的邀請，作為無黨派人士代表列席中共第十七次全國代表大會，開幕式、閉幕式，均在主席台貴賓席就座。
10月29-30日，美國水稻技術公司投資者列支敦士登國王二世漢斯、亞當公爵以私人身份訪問“研究中心”並會見袁隆平院士。
11月18日，出席中國·湖南第九屆（國際）農博會、第六屆中國優質稻米博覽交易會“現在農業與新農村建設高層論壇”，並作“超級雜交水稻育種研究進展”的學術報告。
11月26日～12月3日，訪問澳門科技大學，並與澳門行政長官何厚鏵會見。在澳門科技大學作了關於雜交水稻新進展的學術報告。
2008年
3月，出席全國政協第一屆全體會議，當選為第十一屆全國政協常委。
3月24日，赴海口祝賀推廣雜交水稻老功臣陳洪新老人進入90華誕。
3月29日榮獲“2007年影響世界華人終身成就獎”，出席在北京舉行的盛典。
6月3日，赴湖南嶽陽出席湖南奧運聖火傳遞活動，為湖南首站第一棒火炬手。接受記者采訪時說：“非常激動！非常開心！”
9月12-14日，出席在長沙召開的第5屆國際雜交水稻學術研討會，並作學術報告。第5屆“袁隆平農業科技獎”頒獎儀式也在這次國際雜交水稻學術研討會的開幕式上隆重舉行，有朱英國院士等12名雜交水稻曆史功臣獲獎，每人獎金5萬元。
9月15日，出席在長沙舉行的雜交水稻新組合拍賣會。兩係雜交水稻新組合兩優1128以1180萬元的高價竟拍成功。兩係雜交水稻新組合Y優2號也拍出了650萬元的高價。
附錄（二）
袁隆平部分論著目錄
袁隆平水稻的雄性不孕性科學通報，196617（4）：185～188
袁隆平雜交水稻培育的實踐與理論中國農業科學，1977（1）：27～31
袁隆平雜交水稻製種與高產的關鍵技術遺傳與育種，1977（1）：4～5
袁隆平雜交水稻簡明教程（中英文對照）長沙：湖南科學技術出版社，1985
LongpingYuanHybridRiceinchina中國水稻科學，19861（1）：8～18
袁隆平雜交水稻育種的戰略設想雜交水稻，1987（1）：1～3
袁隆平、陳洪新雜交水稻育種栽培學長沙：湖南科學技術出版社1988
袁隆平兩係法雜交水稻研究的進展中國農業科學，199023（3）：1～6
袁隆平選育水稻光、溫敏核不育係的技術策略雜交水稻，1992（1）：1～4
袁隆平水稻光、溫敏核不育係的提純和原種生產雜交水稻，1994（6）：1～3
LongpingYuanXiqinFuTechnologyofHybridRiceProductionRome：FAO，1995
袁隆平選育水稻亞種間雜交組合的策略雜交水稻，1996（2）：1～3
袁隆平雜交水稻超高產育種雜交水稻，1997（6）：1～6
LongpingYuanHybridRiceDevelopmentandUse：InnovativeApproachandChallenges開羅：第十九屆國際水稻會議1998年9月7日～9日
JimingLi，LongpingYuanHybridRice：Genetics，BreedingandSeedProductionPlantBreedingReviews1999（17）：17～158
袁隆平雜交水稻學中國農業出版社，2002
袁隆平超級雜交稻研究上海科學技術出版社，2006