能征慣戰的元軍有點吃不消了，激戰了一天，盡管日軍傷亡慘重節節後退，但元軍的傷亡數量也逐漸增多，更糟糕的是，右副元帥劉複亨被日軍前線將領藤原景資一箭射中肩窩。眼看天黑下去了，雙方陷入僵持，日軍出乎意料的頑強抵抗阻止了元軍向太宰府的推進。因為擔心會遭到夜襲，元軍全部撤回到停在海邊的船上。
4. 元艦一夜消失了
這一夜無人能睡。
鐮倉和京都的宮殿燈火通明，北條時宗在忙著調集四國的武士增援九州，後宇多天皇則親臨神宮祈禱。九州的太宰府裏，激戰了一天的日軍將領，在對明天即將到來的惡戰爭嚷不休。
元軍的海船上，高級將領們也在召開軍事會議。眼看日軍頑強抵抗，而且數量有增無減，統帥忻都心生退意。據高麗史記載，高麗軍將領金方慶堅決反對撤退：“我軍雖少，但已入敵境，人自為戰，即孟明焚舟、淮陰背水計也。”但是忻都認為：“小敵之堅，大敵之擒。策疲兵入境，非完計也，不若班師。”忻都做了最後決定：明日班師。
當夜，災難卻突然降臨。
一股強烈的台風夾雜暴雨，當天夜裏突襲博多灣沿海。元軍艦隊一片混亂，這些海船全是高麗人按照老式造船法所製，質量不夠牢靠，在台風暴雨中或碰撞而翻，或觸礁而沉，士卒溺死者多達萬餘人。
對元軍遭遇台風暴雨的詳細經過，如台風時間和損失情況，一直到今天都說法不一。日本某些史料明顯誇大其詞，有稱：“凶賊船數萬泛海上，突然逆風虞起，吹歸本國，少數船隻擱淺陸上。”元軍艦隊一共千艘不到，哪裏來的“數萬”？
不過，《元史?日本傳》裏卻對台風隻字未提，隻是簡單的敘述為：“至元十一年冬十月，入其國敗之。而官軍不整。又矢盡。惟擄掠四境而歸。”
第二天清晨，日軍在太宰府前集結列隊，準備迎接更艱難的戰鬥，但久久不見元軍來攻，派斥候（偵察兵）一打聽，一個天大的喜訊傳來：海麵已經空蕩蕩，沒有一艘元軍的戰艦！
除了少數立功心切的武士，日本朝野一片狂喜，敵人逃了，我們勝利了！
雖然“元寇”走了，但誰也無法保證他們不會卷土重來。於是，日本舉國上下開始了祈禱——從龜山上皇、後宇多天皇到公卿大臣，個個前往神社祈禱神鬼顯靈“敵國降伏”。幕府執權北條時宗也不例外，篤信佛法的他刺血寫經，祈求菩薩保佑。
軍事上，日本也在積極增加防備力量，九州、四國的武士加強戒備，關東的武士調往京都戍守。最關鍵的是，日本人用了五年時間，組織民力在博多灣沿海灘頭構築了一道防禦石牆，石牆高6～7尺許，寬1丈，蜿蜒長達20公裏，等於修築了一道阻礙元軍的海岸長城。
日本人同仇敵愾加緊戰備的同時，忽必烈卻茫然不知。
第一次征日結束後，在忽必烈看來“入其國敗之”已經達到了效果：這下夜郎自大的日本人肯定知道蒙古大軍的厲害吧！第二年春天，忽必烈再次向日本派遣了一支由禮部侍郎杜世忠為首的使團，招諭日本稱臣通好。這次，北條時宗更加幹脆：將五個使臣首領拉到鐮倉郊外的龍口斬首。
這群萬裏迢迢送死的羔羊，其實是死在忽必烈的盲目自信上。臨刑前，杜世忠吟了一首李白的詩：
“出門妻子強牽衣，問吾西行幾日歸？來時倘佩黃金印，莫見蘇秦不下機。”
曆史證明，如果你想激怒蒙古人，有一個好方法：侮辱他們的使者。六十年前，成吉思汗派使團去中亞大國花刺子模，使者被剃光胡須趕走，成吉思汗勃然大怒，揮軍西征終於屠城滅國；十五年後，爪哇國王將前來招瑜的元朝使臣孟琪黥麵（臉上刻字塗墨）驅逐，招致忽必烈的三萬大軍跨海遠征。
日本人斬了使者！當一個僥幸逃命的高麗水手把詳細情況帶到大都時，忽必烈徹底震怒了。
公元1279年，廣東崖山，隨著末代小皇帝趙昺被大臣陸秀夫抱著蹈海而死，南宋覆滅。平定了大陸，忽必烈開始騰出手重點對付日本，大量士兵和無數糧草被運送到高麗境內，高麗和中國江南的造船廠晝夜開工，興建大小戰船——第二次跨海遠征緊鑼密鼓。
二、大軍覆滅豈因神風
今天如果去日本福岡觀光，可以在博多灣蜿蜒的海岸線上，看到部分殘破的“元寇防壘”遺址。在冷兵器唱主角的十三世紀，長達20公裏、一人多高的堅固石頭防壘，確實是蒙古騎兵難以逾越的護國長堤。
元軍的龐大艦隊，再次被暴風吹打得七零八落，看上去，日本真是命好。在後世無數“東風不與周郎便，銅雀春深鎖二喬”的諷喻聲中，有多少人留意過這些不起眼的石壘？元軍覆滅，豈是神風的功勞？
1. 無邊石牆擋住了蒙古鐵騎
公元1281年（元至元十八年，日弘安四年）年初，元軍第二次征日艦隊集結完畢，這次的遠征軍空前強大：兵分兩路，一路以忻都、洪茶丘為統帥，率蒙古、高麗、漢聯軍四萬人，從高麗合浦出發，沿上一次的線路先攻對馬和壹岐兩島；一路由南宋降將範文虎率江南軍（南宋降軍）十萬人從寧波出發，橫渡東海到壹岐島會師。日本史書稱為“弘安之役”。