護法戰爭爆發後，段祺瑞被迫下台，馮國璋發布停戰布告。西南軍閥立即準備拋棄孫中山，與北方軍閥妥協，並開始醞釀南北議和。1918年5月，孫中山憤然辭去大元帥職務，返回上海，護法戰爭失敗。 南北議和最終破裂，直係軍閥吳佩孚與南軍息戰言和，矛頭指向皖係，直皖戰爭爆發。1922年4月，為爭奪地盤和對北京政府的控製權，張作霖統兵入關，第一次直奉戰爭爆發。1924年9月，直皖江浙戰爭、第二次直奉戰爭相繼爆發。10月，直軍將領馮玉祥回師北京發動政變，推翻了直係軍閥政府。