南宋末年，入閩聚居在汀州的漢族，開始進行第二次遷徙，他們遷徙的方向一是廣東梅州諸縣，二是廣東潮州。
遷入梅州的主要是客家人。光緒《嘉應州誌》卷三二《談梅》說：“元世祖至元十四年（1284年），文信國（文天祥）引兵出江西，沿途招集義兵，所至響應，相傳梅民之從者極眾（父老流傳，鬆口卓姓有八百人勤王，敗後隻存卓瑞一人）。至兵敗後所餘遺孑隻楊、古、卜三姓，地為之墟。閩之鄰粵者相率遷移來梅，大約以寧化（今寧化縣）為最多。所有戚友詢其先世，皆寧化石壁鄉人。”遷入梅州的客家人主要是為避元軍兵亂而從汀州遷的客家人。《五華魏氏族譜》說，魏氏入粵是為了避兵，“元主起兵二十餘萬，從建昌而來。殺戮人民，在此經過，是誰敢當？我祖兄弟，驚恐流涕，商議隻得移別處逃生”。《興寧黃陂曾氏族譜》載曾氏“因宋元兵擾，不能安居，由寧化徙廣東長樂縣家焉”。據李紹雲《嶺東地理與客家文化》一書統計，宋末移入梅州的客家人，約有1686戶，共6989人。故楊恭恒據客家各姓宗譜雲，客人來梅州，“多在宋末元初。由汀來者十之八，由贛來者十之二”。
遷入潮州的主要是被稱為“閩人”的福建人。福建本來就“土地迫狹，生籍繁夥，雖磽確之地，耕耨殆盡”，是南宋人稠地狹最嚴重的地方，故入粵漢族往往多從福州、泉州和興化軍順著海岸地帶從閩入粵，即進入廣東潮州地區。據史所載遷入潮州的閩人為數甚多，南宋大臣王大寶的祖先、潮陽程氏、海陽林氏、後來由潮遷閩的鄭成功的祖先，均遷自福建。乾隆《潮州府誌·宦跡》載遊宦留居潮州的10人中有9人是閩人。由於閩人甚多，南宋時潮州“有廣南、福建之語……雖境土有閩廣之異，而風俗無漳（州，屬福建）、潮之分”。這些入粵居潮州的閩人遂形成廣東的福佬人（潮汕人）族群。
宋元之時，遷入華南漢族的發展雖然表現在數量上仍然很突出，是北方中原漢族在中國曆史上最後一次大規模遷徙的重要組成部分，但更重要的是遷入華南的漢族內部發生了深刻的社會文化變遷，即華南大地滾滾而來的漢族移民，與秦漢至隋唐遷入華南的漢族會合，在不同的曆史條件、地理環境、遷徙源流、遷入時間以及吸收華南少數民族土著族群語言文化不同等情況下，至宋元時初步形成了若幹不同的族群，主要有分布在廣東、廣西南部的廣府人；分布在福建、廣東梅州、廣西部分地區的客家人；分布在廣東潮汕地區及雷州半島和海南的福佬人；分布在廣西的平話人；分布在福建福州一帶的福州人；分布在福建泉州、漳州一帶的閩南人；分布在福建莆田、仙遊一帶的興化人；分布在福建建甌、建陽一帶的閩北人；分布在福建沙溪流域的永安人；分布在兩廣江河上的疍家人等十餘個各具語言文化特點的族群，從而基本上構成了華南漢族族群體係。與隋唐前遷入華南的發展情況相比，宋元時華南漢族在曆史的風雨中，在文化的互動中，在民族的涵化中其民族內部發生了深刻的社會文化變遷，從而形成了各具不同文化人類學特點的族群，這是一種質的發展。
六、明清漢族向華南的遷徙和發展
中國自元以後，統一已成為中國曆史不可逆轉的大趨勢。在元末農民起義中崛起的朱元璋於洪武元年（1368年）在南京稱帝，建立明朝，至崇禎十七年（1644年）李自成攻占北京，崇禎帝自縊，清兵入關曆時278年。清兵入關後統一全國，建立了一個疆域空前遼闊的清朝，至宣統三年（1911年）辛亥革命後皇帝被廢，曆時268年。明、清兩朝共曆544年。
眾所周知，漢族自秦漢形成以來雖曆經國家分分合合，合合分分，但是在中華這一塊大部分土地相對封閉獨立的大地上，以其高於其他民族文明程度的涵化力和凝聚力，越來越發展，最終成為中國人口最多的一個民族。與此同時，以宋元為界，北方的契丹、黨項、女真等族入主中原後先後基本上被漢化，南方的蠻、俚、僚不是部分被漢化，就是開始或基本上演化成為壯、侗、水、毛南、仫佬、黎、布依等民族，到明清之時，就華南來說，民族格局基本穩定，除漢族外，華南的少數民族，包括土著和遷入在內的有壯、侗、水、毛南、仫佬、彝、瑤、苗、京、黎、佘、回、滿，以及台灣的高山族等。這是一方麵的背景情況。