對圖坦卡蒙的死，曆史上沒有任何記錄。雖然考古學家在對他的木乃伊進行的檢驗時，發現他的頭上有一處受傷的痕跡，但在他死以前已經部分治愈，可能是意外受傷，但也不排除被暗殺的可能，因為根據X光照片顯示，他頭顱後的下方有一個暗點，表示他的後腦可能有被重擊的慢性創傷。而他的繼任者力圖抹去曆史對他的記載，所以在他墳墓被發掘以前，曆史很少有對他的記載。
死於謀殺
曆史學家鮑勃·布雷爾列出了三位最有可能成為凶手的人：
軍隊統帥霍朗赫布。霍朗赫布常常教圖坦卡蒙狩獵、駕駛戰車，這些活動都提供了謀劃一次事故的充足機會。霍朗赫布弑君最可能的動機是自己篡權登上王位，要做到這一點對於手中掌握軍權的他並不難。
其妻安克姍娜門。她的動機可能是篡位，也可能是希望有繼承人。在圖坦卡蒙的墓穴中還發現了兩具胎兒木乃伊。據推斷，兩個死胎都是圖坦卡蒙和妻子所生的女兒，死亡原因是早產或死產。
宰相阿伊。圖坦卡蒙父親在位時，阿伊就是宰相。後來他輔佐9歲的小圖坦卡蒙登基，實際上一直在執掌國家大權，而且深得圖坦卡蒙的信任。阿伊的殺人動機可能是覬覦法老的寶座，而在圖坦卡蒙死後他確實當上了下一任法老。阿伊謀殺了圖坦卡蒙，並且利用王後想要孩子的心理，迫使王後嫁給了他。得到王後不久，他又殺掉王後，繼承了法老的王位。
死於腿部受傷
然而，後來埃及放射學專家突然發現，圖坦卡蒙死前不久大腿曾骨折。經證實，法醫得出結論：圖坦卡蒙並非頭部受傷致死，而是由於腿部的受傷而致死的。
執政期間，圖坦卡蒙曾親自帶隊穿過尼羅河與敵人對戰，這場戰爭雖然勝利了，但是在對戰的過程中，圖坦卡蒙被敵人用斧頭對著膝蓋下方砍了一刀，雖然這一刀並不致命，如果放在今天，簡單縫上幾針就會痊愈，但在幾千年前的古埃及，卻很可能發生感染，導致這位年輕法老早亡。
這一發現為圖坦卡蒙的死因又添迷霧，謎底究竟在哪裏？也許，有朝一日，新的考古發掘會揭開這一謎底。
迷點聚焦：圖坦卡蒙究竟因何而死？死因背後的真相到底是什麼？
迷外之音：在圖坦卡蒙陵墓中有一句咒語：誰打擾了法老的安寧，死神的翅膀就將降臨在他頭上。後來，進入法老墓室的絕大多數都會莫名其妙地死去，這句咒語也因此更為神秘。現在科學家證實，事實上，法老的詛咒根本不存在。