就目前來說，人們在研究艾滋病起源時，主要提出了以下幾種不同看法。
其一是“外空傳入地球”的假說。有兩位英國科學家曾提出過這一看法，認為艾滋病病毒可能早在外空中存在，但因千百年來缺乏傳播媒介，所以人類一直沒感染上。後來由於一顆飛逝的彗星撞擊了地球，將這種可怕的病毒帶到地球來，禍害了人類。
其二是“猴子傳給人類”的假說。科學家經過研究後發現，在猴子身上存在與人類艾滋病患者相同的病毒，被發現的猴子生活在非洲。科學家們在追蹤艾滋病傳播範圍中發現，艾滋病在非洲的流傳比在美洲和歐洲更早，也更快。據一些專家估計，攜帶艾滋病病毒者，可能高達非洲中部城市人口的10%。在80年代，紮伊爾的金沙薩市在對千份血液樣本加以檢驗後，發現其中6—7%帶有艾滋病病毒。讚比亞首都盧薩卡也作過一次廣泛性的調查，發現18%的輸血者帶有艾滋病病毒，在讚比亞1987年間便約有6000名兒童接受艾滋病治療。而非洲某些地區5%的新生嬰兒都帶有艾滋病病毒，其中一半至2/3的人在兩年內會演變成艾滋病。中部非洲大湖地區正流行艾滋病時，法國一位研究人員偶然了解到當地有些居民有以下生活習俗：將公猴血和母猴血分別注入男人和女人的大腿和後背等，以刺激性欲。有些居民還用這種方法治療不孕症和陽萎等病。研究者們從血液接觸可以感染上艾滋病病毒，以及中非地區高發病率與奇特生活習俗等方麵聯係起來，假定艾滋病病毒是猴子傳染給人類的。但是中非部分居民的奇特生活習俗的曆史，無疑是長於艾滋病流行史。
其三是“人工製造”的說法。這是由新聞界披露出來的消息。20世紀80年代中期，坦桑尼亞政府報紙《每日新聞》發文，稱艾滋病病毒是美國細菌戰研究的產物。後來，英國一家素來以消息來源可靠著稱的報紙刊載了英國反對活體解剖學會的看法。該學會成員聲稱：艾滋病是美國製造的一種細菌武器。
研究者首先在中非的綠猴身上作試驗，後來轉為在以減刑為條件自願接受該病毒的一些服重刑的囚犯身上試驗，囚犯中不少是同性戀者。他們被釋放後，便把艾滋病帶到社會上，並由各種途徑傳播開來。這是試驗者和被試驗者始料不及的後果。據說，這項原計劃為生物戰研究的試驗，也因有關人員發現合成的病毒潛伏期過長，效果不夠理想而放棄進一步的研究。這一消息見諸報紙之後，至今已被幾十個國家和地區的報紙轉載，引起各種各樣的議論和猜測。美國有關方麵否認這一說法。但一些非洲國家的傳播媒介，將美國為全世界艾滋病最多的國家與此問題聯係起來，持肯定態度。
目前對艾滋病的研究已取得許多重大成就，但它究竟怎麼起源，至今各說其是，弄清艾滋病的來源無疑對人類的醫學科學將有巨大的意義。