在第二次世界大戰的後期，日本聯合艦隊和美國航空母艦“小鷹號”，數度遭到一艘神秘潛艇的跟蹤。但一當他們發現並準備采取行動時，這艘潛艇又消失得杳無蹤跡了。在太平洋戰爭中，日、美雙方海軍激烈鏖戰之時，神秘潛艇也曾幾次出現。但它並未卷入戰事，而是對落水的雙方水兵采取救援行動，頗有國際紅十字會之風。這艘潛艇的速度和反應，是當時所有船隻都難以比擬的。因此，美國海軍稱之為“幽靈潛艇”。
待到第二次世界大戰結束，美國海軍即動用太平洋艦隊的全部潛艇，在南太平洋水域四次搜尋“幽靈潛艇”。蘇聯海軍也聞風而動，派出大量潛艇在太平洋、大西洋細細搜索。
搜尋曆時一年，卻無結果，可是美、蘇兩國海軍卻為此付出巨大代價：他們各有2艘與3艘先進的潛艇失蹤。
到了60年代末，“幽靈潛艇”又頻頻出現在太平洋和大西洋的廣大水域，跟蹤美、蘇艦隊。一次，美國“企業號”核動力航空母艦，在南太平洋發現被跟蹤，正待作出反應之際，對方悄然失蹤了。“企業號”派出數架反潛直升飛機到處捕捉，終空手而歸。
蘇聯艦隊也遇到同樣情況。這樣，美、蘇雙方便都懷疑是對方偵察潛艇。但其動作如此敏捷，則又令雙方咋舌和不服氣。60年代，美蘇兩國在海軍潛艇上的研製與擴充比賽，“幽靈潛艇”起了很大作用。
1990年，在瑞典和“北約”海軍舉行的一次海上軍事聯合演習中，“幽靈潛艇”竟大大咧咧地招搖過市，引來了一場大圍剿。10多艘潛艇與巡洋艦在開恩克斯納海灣排成梳篦陣勢，炮彈、深水炸彈與魚雷將這裏變成一片喧囂的戰場，最終卻是“北約”海軍等一方掃興而歸。“幽靈潛艇”將他們痛快地耍了一回。
過了一年，“北約”海軍又在比斯開灣舉行演習。這時，“幽靈潛艇”又目中無人地出現在“北約”視野。可是，令“北約”指揮人員奇怪的是：他們所有軍艦上的無線電通訊、雷達、聲呐儀等全部失靈。待到“幽靈潛艇”消失後，一切才恢複正常。這令“北約”幹著急，有勁使不出。當“幽靈潛艇”消失後，“北約”海軍還試著向消失的方向發射了幾枚“殺手”魚雷——這是當時最為先進的魚雷，能自動追擊目標，百發百中，可是一出膛卻向海底來了個90度的“倒栽蔥”。看來，“幽靈潛艇”仍在附近製約著“北約”海軍，捆綁著它的手腳。
於是，“北約”軍事研究人員提出一個猜想：“幽靈潛艇”乃是外星人派到地球的不速之客。
“幽靈潛艇”似乎有幾種類型。通常看見的那種類型同美國核動力潛艇外貌相似，隻是要精巧些。此外，1992年，法國潛水專家拉馬斯克在加勒比海的水下探險時，發現一座圓體的周身晶亮的銀灰色建築物。它飛快地旋轉運行，同拉馬斯克擦肩而過，卻悄無聲息，連波浪也未掀起。這大概是“幽靈潛艇”的又一種類型吧？
“幽靈潛艇”在地球的水域裏有無基地呢？按常理是該有的。那麼，這基地又在哪裏呢？有人說，是在百慕大三角區接近巴哈馬群島的海底下。
1985年，美國水下探險家在巴哈馬群島附近水下1000米深處，發現一座龐大的水下建築，裏麵似有機器在轟鳴。