研究“幽靈潛艇”的人則說，海底金字塔正是“幽靈潛艇”的最佳基地。那上麵的兩個巨大的水洞是“幽靈潛艇”出人的所在。
俄羅斯的一些研究者認為，僅從“幽靈潛艇”及其基地來看，其擁有者的智慧便高出地球人許多。何況“幽靈潛艇”並未攻擊過人類，而是人類不斷地攻擊過它，但它也從不還擊人類。這說明駕駛“幽靈潛艇”者的道德文明也比人類高。
據前蘇聯軍方的檔案資料，在北極地區內，“幽靈潛艇”時常與“不明飛行物”——飛碟（ufo）配合行動，海空呼應。60年代末，在前蘇聯北極圈內的科拉半島附近的海域，發現有1艘“幽靈潛艇”被冰層封凍住。前蘇軍以為是侵入國境的美國潛艇，遂派出大量戰機前來俘獲“侵略者”。就在這個時候，飛碟趕來了。前蘇軍的通訊、雷達、各種儀表全部停止運作，致使飛碟從空中自由降落，飛向“幽靈潛艇”，幫助破冰開路，使“幽靈潛艇”獲得解脫。
這一情景，終使前蘇軍有所醒悟，“幽靈潛艇”乃外星人的傑作，並非美國入侵者。
鑒於“幽靈潛艇”從不犯人的道德水準，美國海軍情報局的亨利·羅德上校認為，美國和前蘇聯等國因追蹤“幽靈潛艇”以及因航行百慕大海區而失蹤的艦船、飛機以及上麵的人員，不過是當了外星人的俘虜而已，他們總有一天會平安回來的。
研究者還指出，外星人來到地球後，大致分作兩類：一類在地麵活動，一類在水下活動。或許他們在外星上本來就分作這兩類人吧？水下外星人建造了“幽靈潛艇”（或者是他們從外星攜帶來的吧？），又以百慕大三角海區水下金字塔為基地進行活動。所以，自第一次世界大戰以來，各大洋，特別是太平洋與大西洋，不時會傳來“不明航海物”——“幽靈潛艇”的報告。
還有一些研究者認為，在大洋深處，長期以來就一直生活著一支具有高度文明、高度智慧的生物。它們不是外星人，而是地球人的最親密的鄰居，也可以說是地球人的一種類型。它們既能在“空氣的海洋”裏生存，又能在“海洋的空氣”裏生存。而百慕大三角的大金字塔，不過是他們在海中建造的發電用的電磁網絡。持這種觀點的研究者還強調：人類起源於海洋，現代人類的許多習慣以及器官明顯地保留著這方麵的印痕。如喜食鹽，身上無毛，會遊水，海生胎記，愛吃魚腥等。這些特征是陸地上的哺乳動物所不具備的。當人類進化時，很可能分作陸上、水下兩支。上岸的就是人類，水下的則被稱作“海妖”。而“海妖”的智慧比人類高出很多。造出了人類不能造出的“幽靈潛艇”。
研究者還認為，要全麵揭開百慕大三角與“幽靈潛艇”之謎，隻有等到人類的科學文明甚至道德文明與“海妖”相接近、相溝通時方可。可是這一天要等到多久呢？“海妖”和人類是否真的能成為朋友呢？這是一個未知數。