在第二次世界大戰的後期，日本聯合艦隊和美國航空母艦“小鷹”號曾經數度遭到一艘神秘潛艇的跟蹤。但每當他們發現並準備采取行動時，這艘潛艇又消失得無影無蹤了。在太平洋戰爭中，日、美雙方海軍激烈醫戰之時，神秘潛艇也曾出現幾次。但它並未卷入戰事，而是對落水的雙方水兵采取救援行動，頗有國際紅十字會之風。這艘潛艇的速度和反應超過了當時所有船隻。因此，美國海軍把它稱之為“幽靈潛艇”。
第二次世界大戰結束後，美國海軍即動用太平洋艦隊的全部潛艇，在南太平洋水域4次搜尋“幽靈潛艇”。前蘇聯海軍也聞風而動，派出大量潛艇在太平洋、大西洋細細搜索。搜尋曆時幾年，卻無結果，可是美、蘇兩國海軍卻為此付出巨大代價：他們各有兩艘與3艘先進的潛艇失蹤。
到了20世紀60年代末，“幽靈潛艇”又頻頻出現在太平洋和大西洋的廣大水域，跟蹤美、蘇艦隊。一次，美國“企業”號核動力航空母艦在南太平洋發現被跟蹤。正待作出反應之際、對方又悄然消失在聲呐和檢測儀的定位之外了。“企業”號派出數架反潛直升機到處捕捉，結果仍是空手而歸。
前蘇聯艦隊也遇到同樣情況。這樣，美、蘇雙方便都懷疑是對方偵察潛艇。但其動作如此敏捷，則又令雙方咋舌和不服氣。20世紀六七十年代美蘇兩國在海軍潛艇上的研製與擴充比賽，“幽靈潛艇”起了很大作用。
1990年，在瑞典和“北約”海軍舉行的一次海上軍事聯合演習中，“幽靈潛艇”竟然又出現了。10多艘潛艇與巡洋艦在開恩克斯納海灣排成梳篦陣勢，炮彈、深水炸彈與魚雷將這裏變成一片喧囂的戰場……最終卻是“北約”海軍等一方掃興而歸。“幽靈潛艇”又將他們痛快地耍了一回。
過了幾年，“北約”海軍又在比斯開灣舉行演習。這回“幽靈潛艇”又目中無人地出現在“北約”視野。可是，令“北約”指揮人員奇怪的是：幽靈潛艇出現時他們所有軍艦上的無線電通訊、雷達、聲呐儀等全部失靈。待到“幽靈潛艇”消失後，一切才恢複正常。這令“北約”非常著急，有勁使不出。當“幽靈潛艇”消失後，“北約”海軍還試著向消失的方向發射了幾枚“殺手”魚雷——這是當時最為先進的魚雷，能自動追擊目標，百發百中——一可是一出膛卻向海底來了個90度的“倒栽蔥”。看來，“幽靈潛艇”有可能在附近製約著“北約”海軍，捆綁著它的手腳。
於是，“北約”軍事研究人員提出一個猜想：“幽靈潛艇”乃是外星人派到地球的不速之客。
“幽靈潛艇”似乎有幾種類型。通常看見的那種類型同美國核動力潛艇外貌相似，隻是精巧些。此外，1992年，法國潛水專家拉馬斯克在加勒比海的水下探險時，發現一座圓體的周身晶亮的銀灰色建築物。它飛快地旋轉運行，同拉馬斯克擦肩而過，卻悄無聲息，連波浪也未掀起。這大概是又一種類型的“幽靈潛艇”吧？
“幽靈潛艇”在地球的水域裏無有基地呢？按常理是該有的。那麼，這基地又在何處呢？有懷疑，是在百慕大三角區接近巴哈馬群島的海底下。
1985年，美國水下探險家在巴哈馬群島附近水下1000米深處發現一座龐大的水下建築，裏麵似有機器在轟鳴。
1993年7月，美、法兩國專家調查隊在這一片水域還發現一座巨大的海底金字塔、塔的底邊長300米，高約200米，塔尖距離海麵100米。金字塔上還有兩個巨大的洞，水流以驚人的速度奔流出人，使這一帶海麵霧氣騰騰，波詭雲譎。因此，有不少人說，作為“魔鬼三角”的百慕大，之所以有許多飛機、船隻在此喪命，海底金字塔應難辭其咎。