海底地震是對航行在海上的人們的又一大威脅。1959年春，前蘇聯客貨輪“庫魯”號在勘察加沿海海域航行，突然受到震動，好像有隻大鐵錘不停地敲打船底，每打一次，船身就劇烈地抖動一下，船上的舵輪、雷達全部失靈，羅盤也出了故障。海麵上騰起無數水柱，周圍一片白色的泡沫。
1964年3月21日，美國阿拉斯加地震發生時，前蘇聯“堅定”號救護船正在距安克雷奇市250海裏的公海上。它在5分鍾之內竟受到3次劇烈震動，就好像全速前進的船隻，猛地撞上了大塊礁石一般。
在海底地震中，船隻損失的大小取決於地震強度，也取決於船隻與震中的距離。科學家認為，由海底傳遞到海麵的地下震動，在震源地區感覺最明顯，5~6級的地震便可以毀壞船體，掀掉鍋爐和發動機。
對停留在港內的船隻來說，最危險的則是海底地震造成的海嘯。地殼急驟升降，迫使幾千米長的水柱發生運動，在海水上層形成巨大而迅猛的波浪，當波浪湧進淺水海域時，浪頭驟然增高，速度放慢，像一麵牆一樣傾倒在岸上。狹長的海灣和楔形港口裏，海嘯的浪頭尤其大。
1958年7月9日晚，美國阿拉斯加東南的裏都亞港發生了一次地震。潮水所到之處，淹沒山坡，衝毀樹林。潮水過後，隻留下一片光石禿嶺。
海底火山爆發也常常給海上船隻帶來慘重的災難。1952年9月23日，東京南225海裏的一座礁石附近，火山爆發。首先來到這裏的一艘日本海上防衛廳的考察船，發現海麵上出現了一個新島，海拔高度30米，直徑150米。幾天之後，小島卻消失了，但火山口還在繼續噴射，火山熔岩流入海裏，蒸汽變成雲彩升上天空。這時，東京漁業研究所的一艘水文考察船又駛近火山爆發區，正當船上人員開始攝影、測定火山威力、選取當地水土樣品時，第二次火山爆發，考察船當即被蒸汽和灰燼吞沒了。火山噴射物散落以後，海麵上再也不見船的蹤影。直到過了很久，船的殘骸才被找到。
人們往往並不知道，有時來自火山的危險並非是火山本身，而是火山的噴發物——火山灰、水蒸氣等，它們像濃霧一樣，降低能見度，使船隻陷入死亡境地。