現在在大昭寺主殿的南牆角，還可能看到一個半人高的青石甕，據寺裏喇嘛講，石甕是當年修大昭寺時留下的，石上的小孔，直通湖麵。俯首石甕，貼耳小孔，可以聽到湖裏野鴨的叫聲。據說，如果修行有道，還可以聽到羅刹女魔的呻吟聲。
鬆讚幹布去世後，吐蕃發生戰亂，大昭寺被洗掠一空，尼婆羅尺尊公主帶進藏的8歲等身佛像在戰亂中被毀。一些高僧和虔誠的貴族，偷偷將12歲等身佛像藏到了大昭寺的一個小殿內。采取的藏匿辦法和後來莫高窟僧人藏匿魏晉唐史籍、卷子、畫冊一樣，用土石將小殿的門封死，再用泥抹平，畫上壁畫。直到第三十六代吐蕃王赤德祖丹時，唐中宗將金城公主遠嫁吐蕃王，吐蕃再次掀起佛教文化熱，金城公主得知12歲等身佛像的下落後，將佛像從密藏的牆內請出，繼續供奉在大昭寺。
佛教裏有“加持、開光”一說，“加持、開光”就是在得道高僧的主持下，把佛教場所的普通建築或雕像賦予佛的真義。也就是通過誦經等儀式，使凡間的泥胎、銅塑、木質附著佛的靈性。大昭寺供奉的12歲等身佛像，是釋迦牟尼佛祖在世時所塑，並由佛祖親自開光。那麼，瞻仰大昭寺的12歲等身佛像，就如同親睹釋迦牟尼佛祖真身。
經佛祖釋迦牟尼親自加持過的三尊佛像，8歲佛毀於戰亂；30歲佛在天竺戰亂中被一些信徒偷偷送到大帆船上，準備飄洋過海運往他鄉供奉，半途遇到風暴，船被巨浪掀翻，30歲等身佛從此沉沒於南印度洋；唯一幸存的就是文成公主帶進藏的這尊12歲等身佛像了，其神聖和珍貴可想而知。
曆史上，大昭寺最大規模的維修擴建，是在15世紀初由黃教的創始人宗喀巴主持完成的。這次擴建，使大昭寺具備了現今的5個金頂、108個佛殿、占地兩萬五千多平方米的壯觀規模。竣工後，宗喀巴給釋迦牟尼12歲佛像敬獻了純金的五佛冠，並於當年藏曆正月十五在大昭寺舉行了格魯派（黃教）第一次傳昭大法會。
現在，西藏各地以及青海、四川、雲南、甘肅的藏傳佛教信徒，到西藏朝佛的最大心願就是叩拜大昭寺的“覺沃仁波切”——釋迦牟尼。在西藏，無論是在高山峽穀，還是在廣袤的大草原，都可以看到虔誠的叩長頭者。這些用身體丈量大地的信徒們，最終手指尖觸摸的終點就是大昭寺門前的青石板。當他們風塵仆仆地叩拜在釋迦牟尼像前的時候，覺得一切辛苦都是值得的。
在西藏的藏傳佛教世界，圓心就是大昭寺。拉薩有三條轉經路，第一條是圍繞大昭寺主殿釋迦牟尼佛的廊道，藏語稱為“廊廓”。這條寺內的轉經道有一圈銅質的轉經筒。走在“廊廓”上，朝佛者邊走邊念經，用手撥動經筒，發出一片嘩啦啦的聲音。第二條轉經道圍繞整個大昭寺，叫“八廓”。7世紀時大昭寺初建，寺廟四周先是有了一些朝佛者的帳篷，後來，慢慢多了一些經商的人，蓋起了房屋，再後來，就逐漸形成了拉薩著名的八角街。第三條轉經道叫“林廓”。這條轉經道圍繞整座拉薩城。早晨起來，就可以看到絡繹不絕的轉經者，其中以老年人居多。以大昭寺為圓心，如果再往外看，呈放射狀分布的就是覆蓋整個雪域高原的漫漫朝佛路。
走進大昭寺
大昭寺是西藏現存最輝煌的吐蕃時期的建築，也是西藏現存最古老的土木結構建築，開創了藏式平川式的寺廟布局規式。大昭寺融合了藏、唐、尼泊爾、印度的建築風格，成為藏式宗教建築的千古典範。
西藏的寺院大多歸屬於某一藏傳佛教教派，但大昭寺則是各教派共尊的寺院。活佛轉世的“金瓶掣簽”儀式曆來在大昭寺舉行，1995年，確定十世班禪轉世靈童的金瓶掣簽儀式就是在這裏舉行的。
藏族人民有“先有大昭寺，後有拉薩城”之說，大昭寺在拉薩的中心地位，不僅是地理位置、城市布局方麵的，也是精神信仰和社會生活層麵上的。從大昭寺金頂俯瞰大昭寺廣場，右邊遠處的山上是布達拉宮，近處的柳樹被稱為“公主柳”，相傳是文成公主親手所栽。大昭寺的布局方位與漢地佛教的寺院不同，其主殿是坐東麵西的。主殿高四層，兩側列有配殿，布局結構上再現了佛教中曼陀羅壇城的宇宙理想模式。寺院內的佛殿主要有釋迦牟尼殿、宗喀巴大師殿、鬆讚幹布殿、班旦拉姆殿（格魯派的護法神）、神羊熱姆傑姆殿、藏王殿等等。寺內各種木雕、壁畫精美絕倫，空氣中彌漫著酥油香氣，藏民們神情虔誠地參拜轉經。