1917年 五十歲
三月四日，章太炎在上海發起亞洲古學會。
七月一日，張勳等擁立溥儀複辟。十二日，複辟失敗。
段祺瑞任國務總理，掌中央大權。拒絕恢複臨時約法與國會。
九月一日，孫中山在廣州成立護法軍政府，組織護法軍，討伐段祺瑞。章太炎被任命為護法軍政府秘書長，前往昆明爭取雲南軍閥唐繼堯的支持，因唐缺乏誠意未果。
1918年 五十一歲
赴四川，到鄒容祠行禮。在重慶等地講學。又赴湖北、湖南，十月歸抵上海。
十一月，北洋政府教育部把章太炎一九一三年擬定的注音字母公布，注音字母采自章太炎。
四川觀鑒廬出版《太炎教育談》。汪太衝編《太炎外紀》出版。
1919年 五十二歲
五四運動爆發。
《章氏叢書》浙江圖書館刊本問世，較上海右文社版新增《齊物論釋》重定本、《太炎文錄初編》《補編》《菿漢微言》三種，校勘頗精，修訂了右文社版不少錯誤。
1920年 五十三歲
一月至三月，身患黃疸，病臥。六月，熱病大作，幾死。
從反對軍閥割據變為讚成軍閥割據，提出“聯省自治，虛置政府議”。
1921年 五十四歲
七月一日，中國共產黨成立。
夏，主張“武力統一”的吳佩孚率軍南下，打敗主張“聯省自治”的湘鄂川軍，“聯省自治”運動遭到打擊。
《太炎學說》上下卷由四川觀鑒廬出版。上卷為章氏一九一八年在四川演講記錄，下卷為一批書劄。《章太炎的白話文》出版，吳齊仁編，泰東圖書館鉛字排印本。
1922年 五十五歲
黎元洪任總統，章太炎受勳一枚。繼續宣講“聯省自治”。
四月至六月，應江蘇教育會之邀，主講國學，每周一次，共十次，講題為《國學大概》《治國學方法》《經學之派別》《哲學之派別》《文學之派別》《國學之進步》。講演記錄有兩個版本，一為曹聚仁所編《國學概論》，一為張冥飛所編《章太炎先生國學講演集》。
柳詒徵對章太炎在《諸子學略說》中“詆孔”的觀點提出批評，章太炎公開作答，表示接受批評，懊悔“前聲已放，駟不追舌”。
《章太炎尺牘》出版，上海文明書局鉛字排印本。
1923年 五十六歲
三月二日，孫中山在廣東宣告大元帥大本營成立，章太炎以為“廣東帥府之欲以武力統一西南，亦西南之吳佩孚也”。
九月，《華國月刊》在上海創刊，章太炎任社長，欲發揚“國故”，挽救“人心”。
1924年 五十七歲
中國國民黨第一次全國代表大會召開，發表宣言，實現國共合作。章太炎與國民黨右派馮自由、居正等聯合發表公函，反對國共合作。
《章氏叢書》由上海古書流通處印本出版。
1925年 五十八歲
三月十二日，孫中山逝世，章太炎撰文祭悼。
五卅運動爆發，章太炎發表通電，欲“使水深火熱之民，早登衽席”。
1926年 五十九歲
三月二十日，蔣介石製造中山艦事件。四月七日，章太炎在上海組織“反赤救國大聯合”，任理事。發出通電，“反對赤化”。八月八日，章太炎應五省聯軍總司令孫傳芳、江蘇省長陳陶遺聘請，到南京任“修訂禮製會會長”。十三日，通電全國，反對北伐。
1927年 六十歲
蔣介石發動“四一二”大屠殺。
五月至六月，被上海市黨部臨時執委會指名為第一號學閥，呈請國民黨中央加以通緝。
七月至十一月，居同孚路賃寓，終日宴坐，兼治宋明儒學，借以懲忿。
1928年 六十一歲
寫《自定年譜》，至民國十一年（1922年）五十五歲止。
1929年 六十二歲
終年閉門杜客，對國事、學術均保持緘默。
1930年 六十三歲
撰《春秋左氏疑義答問》。
1931年 六十四歲
五月一日，《國學叢刊》由中國大學出版，弟子吳承仕編輯。在該刊發表文章《與吳承仕論宋明道學利病書一、二》《論古韻四事》《漢儒識古文考》等。
九一八事變後，通信中多次議論時事，對蔣介石、張學良拱手將奉、吉讓與日本不滿，同時也不滿粵方乘機倒蔣。
1932年 六十五歲
北上見張學良。在燕京大學演說，號召青年拯救國家的危亡。
秋，赴蘇州講學，組織國學會，親撰《宣言》，主張“範以四經”：《孝經》《大學》《儒行》《喪服》。
1933年 六十六歲
二月，與馬相伯聯合宣言（“二老宣言”），反對日本帝國主義侵占我國東北領土。
《章氏叢書續編》在北京發行，弟子吳承仕、錢玄同校刊，收錄著作七種：《廣論語駢枝》一卷、《體撰錄》一卷、《太史公古文尚書說》一卷、《古文尚書拾遺》二卷、《春秋左氏疑義答問》五卷、《新出三體石經考》一卷、《菿漢昌言》六卷。
1934年 六十七歲
秋，由上海遷居蘇州。另創章氏國學講習會。
1935年 六十八歲
三月，蔣介石派丁維汾（鼎臣）慰問，並致萬金為療疾費，章即將此款移作章氏國學講習會經費。
四月，開辦章氏星期講演會，共九期，講題為《說文解字序》《白話與文言之關係》《論讀經有利而無弊》《論經史實錄而不應無故懷疑》《再釋讀經之異議》《論經史儒之分合》等，均有記錄稿單行出版。
九月，《製言》半月刊創刊，由章太炎主編。其宗旨是研究中國固有文化，造就國學人才。
1936年 六十九歲
冬、春間，於章氏國學講習會授《小學略說》《經學略說》《史學略說》《諸子學略說》，俱有記錄稿刊行。夏，為國學講習會學生講完《尚書》。六月十四日，病逝於蘇州。時人評為革命元勳，國學泰鬥。國民政府令以國葬，葬杭州西湖畔張蒼水墓側。