對於手工業和商業，康熙帝采取了一些支持和鼓勵政策。他減少了江南紡織業的稅額，取消了過去每家機戶擁有的織機不準超過100張的限製，允許民間開采銅、鐵礦；康熙帝提出“恤商”、“利商便民”的口號，禁止一些關津渡口對商人任意加征雜稅，1684年，康熙帝宣布廢除禁海令，促進了我國對外貿易的發展。
康熙帝推行的上述恢複和發展經濟的措施，取得了比較好的效果，在他統治時期，耕地麵積、糧食產量都大為譜加，人口增多，工商業得到較大的發展。在此基礎上，國家財政出現良好狀況，國庫存銀常在四、五千萬兩左右。
康熙帝不僅是一位重視經濟的皇帝，還是一位愛好科學的皇帝，他能不帶種族的偏見，聘用了許多外國傳教士，向他們虛心地學習西方科學知識。
康熙帝對數學的興趣很濃，在南懷仁、白晉等人的指導下，他先後學習了歐幾裏得初等幾何、巴蒂斯的《實用和理論幾何學》以及代數、對數、三角等多種數學科目，達到了一定的水平。他還經常向大臣們講授數學，推動了當時我國數學的發展。
康熙帝對天文學也有很大的興趣，他向西方傳教士南懷仁等人學習天文曆法以及天文儀器的用法，後來，巳能比較熟練地運用當時各種先進的天文儀器進行觀測，例如，用照準儀測定太陽子午線的高度，用大型子午環測定時分等等。他甚至能準確地計算出某日某時日晷表麵上所顯示的陰影位置，並指出欽天監在天文推算中的錯誤，對天文學有了較深的造詣。
對於地理學、西方醫學、歐洲音樂等等方麵，康熙帝也表現出一定的興趣，他以洋教士為師，對這些知識進行了學習或了解。作為康熙帝一個中國封建君主，能認真地學習西方的科學文化，這在當時是很不簡單的，康熙帝是中國古代帝王中較為係統地學習了西方科學文化的第一人。
反擊沙俄鞏固邊疆
康熙在其統治期閭，在抗擊外來侵略、反對民族分裂勢力、鞏固邊疆方麵做出了重要貢獻。
在統一台灣之後不久，康熙就開始領導反擊沙俄侵略的軍事行動。
貝加爾湖以東、外興安嶺以南直至鄂霍茨克海的黑龍江流域，自古以來就是中國領土，我國曆史上的唐、遼、金、元、明等王朝，都在這個地區建立了行政管理機構，對那裏實行有效的統治。清王朝建立之後，接管了明朝的全部疆土，繼續行使對這一地區的統治權。但自17世紀以後，沙皇俄國開始派遣侵略軍侵入我黑龍江地區。沙俄侵略者所到之外，燒殺搶掠，無惡不作，波雅可夫率領的第一批侵略軍，曾經滅絕人性地在一個冬天裏吃了50個屮國居民。哈巴羅夫統領的侵略軍於1650年侵入黑龍江流域之後，采用屠殺的手段來對付手無寸鐵的中國百姓，在桂古達爾城一次就屠殺了661人，還搶走婦女243人和兒童118人，全城隻剩15人幸免於難。與此同時，沙俄侵略者還一再在我黑龍江流域修築尼布楚、雅克薩等城、企圖以此作為進一步侵略我國的軍事據點，甚至猖狂地叫嚷，要派2000名哥薩克騎兵，征服中國長城以北地區。
康熙帝對沙俄人侵我黑龍江流域之事十分關注，他明確地表示；“以黑龍江之地最為扼要”，決不可放棄。他曾經希望通過外交途徑來解決這一問題，但沙俄政府置之不理，於是，康熙帝在經過長期準備之層，於1685年命清軍進攻沙俄侵略軍盤據的雅克薩城。清軍在都統彭春、副都統郎坦、班達爾《尼布楚條約》劃定的中俄邊界。
康熙帝領導中國軍民反擊沙俄侵略的結果，收回了被沙俄侵占的一部分領土，遏製了沙俄對黑龍江地區的侵略，在很沙、黑龍江將軍薩布素的率領下，分水陸兩路進軍，同年6月兵抵雅克薩城下，在清軍猛烈的攻勢下，侵略者被迫投降，清軍取得了戰鬥的勝利，並平毀了雅克薩城。然而，在清軍撤離之後，沙俄侵略軍卷土重來，他們在雅克薩的廢墟上重建了更為堅固的城堡，企圖長期盤蹈。在這種情況下，康熙帝毅然決定進行第二次雅克薩之戰。1686年7—10月，清軍包圍了雅克薩城並與沙俄侵略軍展開激戰，在戰鬥中，俄軍傷亡慘重，其頭目托爾布津也被擊斃，後來俄軍不得不放下武器，同意通過談判解決兩國邊界問題。1689年，中俄雙方在平等的基礎上正式簽訂了《尼布楚條約》，該條約明確劃分了中俄兩國的東段邊界，從法律上規定了黑龍江和烏蘇裏江流域的廣大地區都是中國的領土。很長一段時間內保障了我國東北邊疆的安全。
在《尼布楚條約》簽訂後的第二年，康熙帝開始著手解決噶爾丹叛亂問題。
噶爾丹是厄魯特蒙古準噶爾部的頭目，他與沙俄相勾結，策動叛亂，企圖分裂中國。1688年，他率軍向喀爾喀蒙古發動突然襲擊，大肆進行殺掠，喀爾喀蒙古人民的生命財產蒙受巨大損失。1690年，噶爾丹率叛軍攻入內蒙古地區，前鋒已至距北京隻有約450公裏的地方。麵對這一嚴重的局勢，康熙帝力斥了大臣中主張妥協退讓的論調，決定禦駕親征。這年8月，康熙帝率領的軍隊在烏蘭布通與叛軍相遇並發生激戰，清軍以猛烈的炮火攻破了叛軍的“駝城陣”，叛軍潰敗，噶爾丹狼狽逃竄。此役後，噶爾丹假腥腥地向康熙帝修書乞降，但賊心不死，後來，再次發動叛亂。1696年，康熙帝第二次率軍親征噶爾丹。他親自統領中路大軍，馳驅幾千裏，穿越荒無人煙的大沙漠，在克魯倫河與叛軍相遇，叛軍見皇帝親征、士無鬥誌，一觸即潰，倉惶而逃，後又遭到西路軍的截殺，主力被殲滅殆盡，噶爾丹僅率數十騎逃去。1697年，康熙帝為了給噶爾丹以最後一擊，進行了第三次親征，噶爾丹陷人重圍，走投無路，服毒身亡。
噶爾丹死後，他的侄子策妄阿拉布坦在沙俄的支持下，又在西北和西南發動叛亂，1720年，康熙帝命第十四子胤褪為撫遠大將軍，進軍西藏，平定了叛亂。
康熙帝在位期間十分重視維護國家統一、鞏固邊疆的問題，並在這方麵做出了積極的努力。但就在平定策妄阿拉布坦叛亂後不久，1722年，康熙帝因病逝世，終年69歲，在位61年，是中國曆史上統治時間最長的皇帝。