（1）原因 魚類疾病發生的原因有以下3類：
①致病性刺激：機體的生存不能離開外界環境，外界環境中則充滿著許多刺激，它們不斷地作用於機體，其中大多數對機體並無害處，相反地為維持機體的正常活動所必需，如氧、溫度、水等。但也有一部分，或由於強度過大，或由於作用時間過長，或由於其本身即對機體不利，都能引起機體生病，這些就稱之為致病性刺激。這方麵的種類很多，包括機械性刺激（如外傷）、物理性刺激（如高溫、低溫、電流、放射能和大氣壓等）、化學性刺激（有機和無機的化學物質）和生物性病原（也叫病原體）四大類。
②缺乏機體所必需的物質：機體的生命活動取決於機體和環境的相互作用，當機體必需的物質缺乏或不足時，可引起機體機能的劇烈變化，甚至死亡。如魚由於缺乏必要的營養而生各種營養缺乏病；魚離開了水，很快就死亡等。
③機體本身的改變：一般正常的物質或外界條件也可能成為致病的原因，如各種過敏性疾病等。
（2）條件 疾病的發生不僅要有一定的原因，而且還需要適宜的條件。由於條件不同，即使有病原存在，疾病可能發生或不發生。條件大致可分為機體本身的和外界環境的兩大類。前者包括機體的種類、年齡、性別、健康狀況等。如飼養在同一池塘的魚，當暴發鰓隱鞭蟲病時，主要是引起夏花草魚患病，而且在夏花草魚中也並不是每條魚都患病，病情則更是多種多樣。後者包括氣候、水質、飼養管理、生物區係等。如引起雙穴吸蟲病流行，必須具備該病的第一中間寄主錐實螺及終寄主鷗鳥等才行。
所以疾病的發生都有一定的原因，但疾病的原因不是孤立地起作用，而是始終在機體內、外環境的具體條件下發揮作用的。