（1）根據病原 根據病原可分由生物及非生物引起的兩大類。
①由生物引起的魚病：也稱寄生性魚病。一是魚類微生物病，如病毒病、細菌病、真菌病和藻病等。二是魚類寄生蟲病，如原蟲病、蠕蟲病、蛭病、軟體動物病和甲殼動物病等。
②由非生物引起的魚病：一是機械操作損傷。二是物理性刺激，如感冒、凍傷和放射性損傷等。三是化學性刺激，如工業汙水及農藥引起的中毒、氣泡病等。四是缺乏機體所必須的物質或條件，如泛池、饑餓及營養缺乏病等。
（2）根據感染的情況 根據感染的情況可分六種情況：
①單純感染：疾病由一種病原侵襲所引起。
②混合感染：同時有兩種或兩種以上的病原侵襲。
③原發性感染：病原侵襲健康者。
④繼發性感染：此種感染為發生在原發性感染基礎上，即病原侵入已是病體的機體上。如膚黴病的暴發必須在原已受傷的機體。
⑤再感染：被同一種病原第二次侵襲後又患病者，即機體在第一次患病痊愈之後，未失去對該病原的易感性，因此當第二次被侵襲時，又患同樣的疾病。
⑥重複感染：在機體內經第一次病愈後，仍遺留有該病原，僅是病原與機體間保持暫時的平衡，當新的同樣的病原又侵入機體，則又暴發該病。
（3）根據症狀 根據症狀可分為兩種類型：
①局部性疾病：病理變化主要局限於身體的某一部分。在魚病中常見的有皮膚病、鰓病、腸道病、眼病、肌肉病、肝病、腎病、膽囊病、鰾病等。
②全身性疾病：為該病影響到整個機體者。如魚病中常見的泛池、中毒、饑餓、營養不良等。
事實上，這兩者是相對的，任何一種疾病沒有嚴格的局部性，整個機體總是這樣或那樣地對它起反應的；而且大多數疾病開始時都往往表現為局部性，隨著疾病的發展，全身性的症狀就更加明顯。
（4）根據病程的性質 根據病程的性質可分為3種類型：
①急性型：病程迅速，由數天到1～2周，機能調節很快地由生理性的變為病理性的，當有些症狀還來不及表現出來時，機體即死亡。如急性鰓黴病，鰓急性發炎，經1～3晝夜病魚即死。
②亞急性型：病程稍長，為2～6周，該病的典型症狀才發展起來，如亞急性鰓黴病的主要症狀為鰓壞死性崩解，並現大理石化。
③慢性型：病程較上述兩型為長，甚至可延長到數月或幾年，其特征為持久而無力，因為引起這種病的原因和條件作用長期而不劇烈，且不易消除。如慢性鰓黴病的病變很微弱，僅小部分鰓壞死、蒼白。