梁啟超隻好伏在龍案上書寫了一行小字：“臣已將變法之舉措寫成書，現呈給皇上。”寫罷，他從懷中掏出自撰的《變法通議》，雙手獻給皇上。光緒皇帝高興地說：“愛卿的文章，朕早已聽說過，今日既然得此書，朕一定認真閱讀。”第二日，光緒皇帝又召見了譚嗣同、黃遵憲、楊銳、劉光第、嚴複、林旭等人。光緒皇帝頻頻召見維新派人物，早已引起守舊派的恐慌，朝中一些老臣紛紛跑到頤和園向西太後告密。西太後一律是置之一笑。當老臣們走後，她對李蓮英說：“小李子，準備垂釣之物，下午到昆明湖釣魚去。”
“老佛爺，您真叫‘宰相肚裏能撐船’呀！朝中來了那麼多重臣，紛紛告皇上的狀，您還有心思去釣魚！”西太後拍了拍小李子的肩膀，說：“讓他們去折騰一陣子吧，哀家還不到出場的時候。”
“老佛爺，您真英明偉大！”“別耍貧嘴了，讓你的那些兄弟們多留心皇上的動靜就行了。”“放心吧，那些公公們個個忠於老佛爺，皇上打了一個噴嚏，他們都會來報告的。”西太後露出了滿意的微笑。康有為在總理衙門“行走”之後，一方麵網羅變法人才，使梁啟超、譚嗣同，楊深秀、楊銳、林旭、劉光第、康廣仁、張蔭桓等積極參與變法者得以重用；一方麵幫助光緒皇帝擬定了一係列諭旨，把變法運動推向了高潮。“百日維新”中，光緒皇帝全麵推進了一係列改革，主要表現在政治方麵、經濟領域、軍事方麵和文化教育方麵。政治上，他大膽地進行了機構改革，裁減了閑職人員，合並了臃腫的機構，在經濟領域，他勸導紳民，兼采中西各法振興農業，倡議設立農學會，翻譯外國農學書籍，鼓勵發明創造，擴大利用水利資源，籌辦中國通商銀行，廣設郵政局，軍事方麵，他諭令軍機大臣及督辦軍務王臣采用西法編製軍隊，仿照西方兵製，改習洋槍，添設海軍，籌造軍艦，文化教育方麵，命籌辦京師大學堂，督促各省督撫選派人才赴日本學習，並廢朝考製度，一律改試策論，設華僑學堂，兼學中西文字，準設醫學堂，學習中西醫理，鼓勵各州、府廣育人才。
僅僅一百零三天，他就頒布了一百一九十多條諭旨。光緒皇帝是日理萬機，他希望早日讓大清國宮強起來。這些諭令發往全國各地，大小官吏們有的堅決執行，有的陽奉陰違，有的暗中抵抗，一時間，在全國範圍內，變法的成效並不顯著。
尤其在京城，政治製度的改革觸動了許多人的“神經”，他們一改原來觀望的態度，堅決反對光緒皇帝。不久，他們就形成了一股強大的反對勢力，衝擊著剛剛起步的變法活動，使得光緒皇帝步履艱難。
光緒二十四年七月十一四日，也就是召見梁啟超的同一天，光緒皇帝頒發了一個令許多人驚駭的諭令：裁撤詹事府，通政同、光祿寺、太仆寺、鴻臚寺、大理寺等六個閑散衙門，將其歸並內閣及刑部禮部辦理。裁撤湖北、廣東、雲南三省巡撫。
諭令發出，那些養尊處優、高官厚祿的老臣們無不欷歔，有的抹眼淚，感慨大勢已去，有的咬牙切齒，痛罵光緒皇帝，有的立刻跑到頤和園，在西太後麵前告狀。五天後，光緒皇帝又“扔了一顆炸彈”，他要免了禮部六堂官。這六個人是：禮部尚書懷塔布、許應騤、左侍郎堃岫、右侍郎溥頲、署左侍郎徐會澧、署右侍郎曾廣漢。
其原因是禮部主事王照的折子本劇由禮部各堂官逐層上遞，遞到皇上的手裏，可是他們認為王照的折子所陳多為新政，於是聯手阻撓了折子的正常傳遞。光緒皇帝得知此事後，勃然大怒，罷免了這幾位一、二品高官，想要來個殺一儆百。
孰料這個諭令不但觸動了被罷官員的“神經”，也觸怒了西太後的“神經”。還是在變法之初，西太後便逼迫光緒皇帝頒布了一條諭令：凡朝中一、二品高官任免均掌握在皇太後手中！如今，光緒皇帝破壞了這個製度，等於說對西太後進行了挑戰。
當光緒皇帝罷免了一大批舊僚官吏時，西太後震驚了，她責備前來請安的光緒皇帝：“皇上，親爸爸聽說你在宮裏鬧得不輕啊，不少老臣跑到園子裏哭訴。”光緒皇帝理直氣壯地回答：“朕要變法，但是那裏頑固派卻百般阻撓維新運動，對於他們，不能姑息。”西太後不滿地望了皇上一眼，說：“那些朝廷重臣，有的甚至是三朝老臣，他們一心效忠朝廷，如果不是什麼重大問題，不能處置他們。不然，朝廷上下人心惶惶，會引發混亂的。如果皇上一意孤行，亂了家法，皇上無法向列祖列宗交代！”光緒皇帝聽到這裏，非常生氣。他走近西太後，對她說：“親爸爸，兒既為一國之君，就當以拯救大清子民為己任，以捍衛國家領土完整為己任。豈能死抱什麼‘祖宗家法’不放？誤國殃民的事情，兒不幹！”“放肆！皇上是說親爸爸在誤國殃民？”“兒不敢！兒隻是說親爸爸應該順應時代潮流，向西方學習，以使國宮民強。”西太後抓起一隻茶杯，猛地擲向光緒皇帝的腳下，大吼：“退下去，日後皇上不要再來園子裏請安了！”接著便是西太後的“嗚嗚”哭聲。光緒皇帝嚇得不知所措，他久久地跪在西太後的麵前，哀求似的說：“親爸爸息怒，孩兒不孝，還望親爸爸原諒。”
西太後抹了一把淚水說：“皇上早把親爸爸的恩情給忘了，你長大了，眼裏還有親爸爸嗎？”說罷，又大哭大叫起來。光緒皇帝恭恭敬敬地向西太後叩了一個頭，說：“親爸爸，別傷心了！孩兒告辭了。孩兒如果有什麼過錯，乞求親爸爸原諒。”說罷，轉身欲走。西太後猛地喊住了他：“皇上，有個決定忘了告訴你，榮大人北洋三軍中的一部分人今日駐紮長辛店，還有，皇宮各門守衛從明日起由榮大人的衛兵擔任。”光緒皇帝愣住了，他萬萬沒想到西太後竟以武力監視他，他再次暗自說：“看來變法要流血了。”西太後低沉地說：“皇上回宮吧，親爸爸累了！”光緒皇帝回到皇宮，仔細揣摩著西太後的每一句話，越想越害怕。他深信西太後已安排妥當，可能會以武力相逼，逼迫他停止變法，甚至是廢除他的皇位。夜已深，光緒皇帝一點兒睡意也沒有。珍妃坐在床頭，望著蠟燭出神。光緒皇帝走近珍妃，輕聲說：“親爸爸暗中操縱著實權，萬一她想發動政變，廢除朕，轟轟烈烈的維新運動不就夭折了嗎？”珍妃也是愁雲滿麵，她輕聲說：“箭在弦上，不得不發。珍兒以為皇上該布置一下了，以應付突發事件。”
“對，愛妃道出了朕的心聲。朕立刻擬旨，令人將密旨送到康有為手中，或許，他有妙計。”“皇上，珍兒有一言，不知當講不當講？”“隻管說，這兒隻有你我，我們是最親愛的人，有什麼話不可以講！”珍妃受到了鼓勵，她鼓足勇氣說：“珍兒思前想後，總怕太後趁九月閱操之際發動政變，囚禁皇上。”光緒皇帝緊握珍妃的手，輕聲說：“朕也有這層顧慮。可是，秋天閱操不得不去呀！”“那就先動手為強，搶在太後的前麵，免得被動。”“愛妃，喝口茶，你慢慢說。”光緒皇帝凝視著珍妃，仿佛珍妃是他的“謀士”。自從珍妃進宮以來，光緒皇帝不僅在感情上依戀她，而且在朝政上也依靠於她。珍妃見識廣，處理問題冷靜沉著，很有“偉丈夫”的氣魄，每當光緒皇帝遇到棘手的問題時，他總想請教一下身邊的“女秘書”，而珍妃往往能一語道破天機，想出妙招。珍妃從光緒皇帝手中接過茶杯，抿了一口茶水說：“太後暗中早已派榮祿布置了兵力，皇上所顧慮的流血事件可能難以避免，因此，目前誰搶在前麵，誰就有可能勝利。皇上所信賴的維新派多出身書生，果真打起來的話，維新派絕對不是守舊派的對手。珍兒以為還是盡快召見康有為等人為好。”“好，朕這就諭令康有為、梁啟超等人覲見。”“恐怕他們上不了大殿。榮祿的衛兵早已控製了整個皇宮，隻怕皇上見不到他們。”“這怎麼辦呢？”“可以讓楊銳設法聯絡康有為，讓康有為或梁啟超設法混入皇宮，皇上可以在毓慶官召見他們。”“這行嗎？”“這是唯一的辦法。”珍妃臉上一點兒笑容也沒有，光緒皇帝更是神情緊張。他緊握住心愛人的手，低聲說：“朕明天早上就擬一份密諭，讓楊銳帶出宮，希望康有為他們盡快想出穩妥辦法以對付突發事件。”