但是，歹商“為人氣弱而多疑，不能善使其左右”（瞿九思：《萬曆武功錄·虎爾罕赤猛骨孛羅康古六歹商溫姐列傳》第11卷）；康古六與溫姐又先後死去，哈達部極力歸於孟格布祿貝勒。
努爾哈赤對哈達采取分化的策略，瓦解哈達，壯大自己。如哈達的索塔蘭率所部歸建州，努爾哈赤把族女嫁給他為妻；雅虎率十八戶附建州，努爾哈赤授其為牛錄額真。同時，對孟格布祿的騷擾也予以還擊，富爾佳齊一戰是為一例（前已述及）。但是，努爾哈赤並不取攻勢。
古勒山之戰以後，葉赫貝勒兵攻哈達，欲吞並之。哈達貝勒孟格布祿力不能敵。萬曆二十七年（1599），孟格布祿送三個兒子到費阿拉做人質，向建州乞師。努爾哈赤派費英東和噶蓋領兵二千助哈達，駐防其地。葉赫不願意哈達倒向建州一邊，設法離間哈達與建州的關係。葉赫貝勒納林布祿通過明朝開原通事，致書哈達貝勒孟格布祿稱：“爾若執滿洲來援二將，贖所質三子，盡殲其兵二千人，我妻汝以所求之女，修前好焉！”（《清太祖高皇帝實錄》第3卷）孟格布祿應允，約於開原往議，但機密泄漏。努爾哈赤見時機已到，決定發兵征哈達。
萬曆二十七年（1599）九月，努爾哈赤統兵征哈達。其弟舒爾哈齊自請為先鋒，領兵一千做前隊，直抵哈達城下，哈達兵出城迎戰。舒爾哈齊見哈達城堅兵盛，按兵不戰，道：“彼兵出矣！”努爾哈赤怒道：“此來豈為城中無備耶！”（《滿洲實錄》第3卷）說畢，親自帶兵沿城環攻。城上發矢投石，建州兵死傷很多。建州軍團團圍城，日夜猛攻。經過六晝夜的激戰，攻陷哈達城。揚古利生擒哈達貝勒孟格布祿。孟格布祿匍匐進見努爾哈赤，努爾哈赤將自己的貂帽和豹裘賜給孟格布祿，並把他帶回費阿拉監養。哈達部所屬城寨完全招服。建州對哈達的器械、財物、妻子秋毫無犯，降民編入戶籍，遷之以歸。
努爾哈赤將孟格布祿加以監養後，“尋誣猛奴私事，射殺之”（海濱野史：《建州私誌》上卷）孟格布祿被殺之訊傳至明廷，萬曆帝宣諭建州，責問努爾哈赤取哈達、殺孟格布祿之事。努爾哈赤表示遵從宣諭，願意歸還孟格布祿次子革把庫及其部民一百二十戶，並願意以女莽古濟給孟格布祿之子武爾古代為妻，且於撫順關外刑白馬盟誓，撫保武爾古代之寨。
萬曆二十九年（1601），努爾哈赤將武爾古代送回哈達，並以女妻之。但葉赫貝勒納林布祿，又乘機攻擾哈達。其時，哈達大饑，向明乞糧，開原守將不與，隻得“以妻子、奴仆、牲畜易而食之”（《清太祖武皇帝實錄》第2卷）。努爾哈赤乘時將哈達滅亡，並其部眾，有其屯寨，收其牲畜，奪其敕書。
努爾哈赤滅亡哈達，明朝失掉南關，扈倫四部被打開一個缺口。努爾哈赤吞並哈達，是他統一女真各部道路上的一塊裏程碑——“自此益強，遂不可製”（《明神宗實錄》第366卷）。他的下一個爭奪目標，是輝發部。