全鬥煥在12·12政變成功後，對以鄭升和為首的穩健派將領進行了大清洗，大逮捕，對金大中等政治領袖則加以內亂罪加以逮捕審訊。為他登向獨裁總統的道路上邁出了新的一步。
但他還不能夠一腳踢開過渡總統崔圭夏。崔有合法選舉身份。全鬥煥則采取步步奪權、占據要害的手法，逐步把持政權的核心部門。
樸正熙被刺後對金載圭判處死刑。其空缺的中央情報部長官一職先由李熹性將軍代理了幾個月，李在鄭升和被捕後接任陸軍總長兼戒嚴總司令。全鬥煥第一個掌管的要害部門就是中央情報部。
1980年5月，在血腥鎮壓了光州人民起義後，全鬥煥再一次向崔圭夏逼宮。5月31日成立了一個類似軍政府的國家安全措施特別委員會，由總統崔圭夏任名義職務的主席。全鬥煥是實權人物。在這個委員會之下設立了常設機構國家保衛非常對策委員會，全鬥煥任委員長。
代理中央情報部長
1980年4月，全鬥煥逐步從幕後走向前台。他出麵就要控製要害部門。中央情報部自然是重中之重了。
漢城《東亞日報》4月30日刊登題為《中央情報部精簡組織》的消息，對全鬥煥的三把火進行報道：
中央情報部代部長全鬥煥29日說：“由於本人掌握中央情報部和保安司令部等兩大情報機構，因此有人臆測說，這將招致政治發展的失敗。這僅僅是杞人憂天而已。與這種杞人之憂相反，這將對戰勝內外難關作出積極的貢獻，從而促進政治發展。”全代部長這天下午在情報部會議室舉行的同記者的懇談會上說：“我認為，在困難的時期擔負重任是國家賦予的使命，我將發揮所有的精力盡到自己所負的責任，特別是作為一個軍人，我隻有一個信念，這就是貢獻我所有的忠誠為國家服務。”
全代部長說：“我將努力以虛心的態度聽取對情報部的枇評，在對內方麵糾正互相矛盾的法律體製和製度，在組織和管理方麵果斷地實行大膽的整頓和精簡，在對外方麵成為能照顧國家安危的名符其實的機構，以獲得國民的信賴。”
對於“軍方如何看待最近的國內外形勢”的詢問，他說：“由於伊朗和阿富汗事態微妙，軍方確實是緊張的。”他說：“搞政治的人不關心國家的安全，為了政權或政黨的利益而搞欺騙之類的東西，但從軍隊角度來看，我認為這是相當令人擔心的事情。”
他接著說：“實現‘安全’，從習慣上講也可以說是為了政權。但是，我認為在我國的現狀下，不管是十年還是百年，國家政策都應該把安全放在首位。”他說：“不能以維持政權的概念來利用安全，政治界人士不能從政治上利用或反利用安全。”
全代部長在談到今後情報部的管理方針和機構整頓問題時說：“在業務重點方麵，主要是進行收集國內外對共情報活動和收集政策資料，要確立秘密活動原則，全部消滅進出所有機關部處進行千涉的事情。”他說：“計劃統一取消或合並類似機能，徹底貫徹以能力為主提拔部內人事的原則，保障專門的重要人員的身份。要調整職務級別，使它同政府的其它部處取得平衡。要修正和完善過去的許多矛盾和盲目之處。”
對於創建新黨的議論，他說：“根據我所領導的機構掌握的情況來看。我認為這是毫無根據的胡言亂語。”他在談到對政治發展日程和修改憲法的看法時說：“本人所做的事情同政治發展日程和修改憲法等政治問題無關。”“請記住，保護政治發展是我所領導的部處的基本任務。”
對於全鬥煥是如何任代理情報部長的，《東亞日報》報道得較為全麵。漢城《東亞日報》1980年4月15日日刊登了題為《全鬥煥中將任情報部代部長》的消息，全文如下：
崔圭夏總統14日下午任命現國軍保安司令全鬥煥（陸軍中將）兼空缺中的中央情報部代理部長。
任命現役將軍兼任情報部長和保安司令職務，是前所未有的。崔總統這天下午向新任的全代理部長授予了委任狀。
青瓦台當局人士就發布兼任命令說：“起用現役保安司令擔任情報部代理部長，是出於這樣的判斷，即在戒嚴令下，軍方正在調整安全、情報、搜查業務，兼任可以使業務調整更富成效。”
這位當局人士說：“今後，情報部將根據中央情報部法，擔負在國家安全方麵的本來任務。”他說：“如果說過去有一些弊病的話，今後將加以糾正。”
當局人士還說：“在很久時間裏保留任命情報部長，是因為殺害已故的樸正熙總統的人是情報部長，因此。從道義上講，情報部不是不需要反省和負責任的。同時，在非常戒嚴令下，戒嚴部隊一直發揮了安全、搜查和情報機能，所以任命情報部長的必要性不是很大。”