煩惱，每個人都有。很多時候，我們認為煩惱和痛苦是一體的，但佛教裏將煩惱視為一種負麵的思想或情緒。有了煩惱，便會產生痛苦。
偉大的釋迦牟尼佛告訴我們：脫離輪回最大的障礙就是煩惱，而菩薩在成佛之前的障礙稱為所知障，煩惱和所知二種障礙的本質就是光明的如來藏。原始清淨的如來藏，經由我們的主意識，通過眼耳鼻舌身等五根，對外在的色聲香味觸產生五識。在意識、五根、外境的交互循環過程中，讓心有了混濁的狀態，這種情形在佛經裏是如何譬喻呢？就像海水本身是清澈的，不會有浪，但為什麼海麵會生起如此大的混濁波浪？是風讓海水起了波浪。所以，這種突然生起分別的識，既捉不住它，也不清楚它是正麵或負麵，這種混沌不解的疑惑就是無明，也是所謂的客塵汙染。而心的原始本質就像是海底的水，永遠都是清淨的，具備著高度的智慧以及圓滿的慈悲，這稱為佛性。
煩惱，是因為有無明有分別心而產生。煩惱是思想的一種狀態，不是指因煩惱而起的種種痛苦。痛苦是煩惱的果，解脫輪回的障礙就是煩惱造成的。所以，要脫離輪回之苦，必須先了解煩惱如何產生、該如何滅除，這樣才知道如何對治它。寧瑪巴的大師米滂仁波切說：“什麼是煩惱？貪欲等稱為煩惱。”歸納來說，煩惱就是貪念、嗔恨、嫉妒、傲慢、疑心等，稱為五毒。
從無始輪回以來到現在，我們已經非常習慣負麵的思想和行為，對於正麵的思想或行為卻需要努力學習才能展現。我們與生俱來、不需經過學習便存在的，就是煩惱。所以，母親懷胎時，胎兒可能因為不高興在母親的肚子裏拳打腳踢，歡喜的時候也會露出笑容。胎兒在母親體內的喜怒哀樂，都來自於前世延續的習氣。而出生後，嬰兒對喜歡的事物會感到很開心，對不喜歡的事物也會用哭鬧的方式來表達，這些都是與生俱來的習氣。更嚴重的是，隨著年齡的增長，欲望及嗔恨心也跟著增長。從懂事以來，我們就有貪念，因為要滿足當下饑餓的需求，對正麵的親切關懷會歡喜接受，對負麵的語言會有抗拒之心，這些都會隨著年齡不斷增長。
我們小時候的貪念、嗔恨、傲慢，是前世所播下的種子在今世成熟了。但是，在年紀還小、對很多東西還不懂分別的時候，這種毒還隻是種子，看不出來後果有多嚴重。就像是食用被汙染的水或食物而中毒一樣，剛開始根本感覺不到毒性的存在，等到日積月累，傷害就愈來愈重。多數的毒物在剛開始享用的時候，感覺是舒服的，有快感的；而隨著中毒愈來愈深，痛苦會愈來愈烈。除非出生在有良好道德觀念或有正確宗教信仰的家族，才不會持續惡化，這也是自己和家族在前世福報的共業成熟，才有機會讓自己在今生的教育下慢慢改變看待事物的觀點。
就像一個小朋友，當別人欺負他的時候，他會哭著跟家人投訴。如果是不理智的父母，沒有正確道德觀念，大多會告訴小朋友用以牙還牙的方式反擊，而不會告訴他正確解決問題的方法。之後，小朋友心裏就會慢慢建立起負麵模式的思考了。這種情形容易發生在父母有暴力傾向或口無遮攔的家庭裏。有些小孩在剛學會走路的年齡，就會用暴力解決事情。或是業力更深的，當他發脾氣，可又無法對別人使用暴力時，會反過來咬自己發泄。這時如果父母有慈悲的心，好好教導小孩正確理解這些嗔恨是不好的，再慢慢引導他往正麵發展，小孩的嗔怒習氣是可以改變的，因為前世帶來的是還沒成熟的種子。如果知道土裏種的是罌粟花等具毒性植物的種子，隻要不在上麵灑水、施肥，沒有陽光照耀，種子自然就會在土裏腐爛；即使能長出芽來，也是非常脆弱的。小孩子的煩惱種子（貪、嗔、癡、慢、疑等）和罌粟花的種子一樣，影響力還很小，關鍵在於不要讓它繼續成長。父母如果認同他的負麵情緒，或者沉默以對，都將是一種鼓勵，那麼負麵情緒就會慢慢擴張。如果生在佛教家庭，從小就被教導說傷害別人、將別人的物品占為己有、惡口傷人、動手打人等都是非常不好的作為，慢慢地，小孩子就懂得去改變自己，因為是非觀念已經播種在他的心靈上。現在有很多家庭是溺愛勝過於教育，而讓小朋友失去是非觀念。