以後，由於植物神經功能紊亂和腦供血不足、腦軟化的症狀惡性發展，劉少奇失去了自主吞咽功能，隻能靠鼻飼維持生命。他時而緊攥著拳頭，時而張開十指亂抓，而一旦抓住什麼又死死不放。在他痛苦地在空中劃動雙手不止不休的時候，有人把兩個硬塑料瓶子放在他手中。他緊緊捏著，於是稍稍安靜一些，天長日久，他竟將兩個塑料瓶捏成了“葫蘆”形。
1968年10月13日至10月31日，在北京召開了中國共產黨第八屆擴大的第十二次中央委員會全體會議。毛澤東親自主持會議，中央文化革命小組成員都出席了會議。會議期間，毛澤東就1966年8月黨的八屆十一中全會以來“文革”問題，作了講話，會議認為，毛澤東在“文革”中各個時期的一係列指示都是正確的。兩年來的“文革”成果就在於“在以毛主席為首、林副主席為副的無產階級司令部的領導下”，“深入地發動億萬人民群眾，在中國人民解放軍支持下”，“終於摧毀了以劉少奇為代表的妄圖篡黨、篡政、篡軍的資產階級司令部及其在各地的代理人，奪回了被他們篡奪的那一部分權力。”全會還批準了中央專案審查小組關於劉少奇罪行的審查報告，“決定將劉少奇永遠開除出黨”，並肯定反擊“二月逆流”運動是正確的。
1968年11月2日，中國各主要報紙在頭版頭條，以套紅大標題刊登了八屆十二中全會公報，全國各地廣播電台，也反複播放著八屆十二中全會公報內容。劉少奇在病榻上聽見了公報中有關他的結論：“全會批準中央專案審查小組《關於叛徒、內奸、工賊劉少奇罪行的審查報告》。這個報告以充分的證據查明：黨內頭號走資本主義道路當權派劉少奇，是一個埋藏在黨內的叛徒、內奸、工賊，是罪惡累累的帝國主義、現代修正主義和國民黨反動派的走狗。全會認為，在無產階級文化大革命中，黨和革命群眾把劉少奇的反革命麵貌揭露出來，這是毛澤東思想的一個偉大勝利，這是無產階級文化大革命的一個偉大勝利。全會對於劉少奇的反革命罪行，表示了極大的革命義憤，一致通過決議：把劉少奇永遠開除出黨，撤銷其黨內外的一切職務，並繼續清算劉少奇及其同夥叛黨叛國的罪行……”劉少奇聽著聽著，“永遠開除出黨”！“永遠開除出黨”！像惡魔咆哮著不離他的左右。他的腦子裏不時掠過他一生所走過的道路。他覺得冤枉啊！他渾身顫抖，大汗淋漓，呼吸急迫，頻頻嘔吐，血壓陡然高到260/130毫米汞柱，體溫驟然升至40.
從此，劉少奇完全明白了，任何辯駁都是徒勞。他緘默了，什麼話都不說，用無言表示抗議。然而，劉少奇的身體卻從此更趨衰弱，周恩來千方百計動員了北京醫院的兩名護士去護理他，可惜，他們無法護理劉少奇的精神創傷，對於由之而來的體力耗竭也就更無能為力了。
最後的二十七天
1969年10月，林彪一夥陰謀策劃以戰備疏散為名，把有礙他威信的奪權障礙清除出北京。10月18日，黃永勝等人向全軍發布了《林副主席第一個號令》，聲稱，為了“加強戰備，防止敵人突然襲擊，調動全軍進入緊急戰備狀態，要求部隊迅速抓緊布置反坦克武器的生產；立即組織精幹的指揮班子，進入戰時指揮位置；各級要加強首長值班，及時掌握情況，並迅速報告”。10月19日，林彪用電話記錄的形式報告毛澤東。毛澤東聽後，當即指示：燒掉。林彪、黃永勝卻以毛澤東說很好，燒掉為指示，繼續通知疏散。劉少奇便是“第一個號令”的最早受害人之一。他是在號令正式發布的前一天接到通知，並付諸行動的。
10月17日這一天，劉少奇病情篤重。他的血管裏不停地滴進為他輸入的液體，鼻孔插著長期放置的鼻飼管，吸痰器不時伸進他的喉頭，吮吸著湧上來的痰液。用醫護人員的話說，他“隨時都可能突然死亡”。然而，催促他立即離京的指令越逼越緊。為了通知劉少奇，護士用棉簽蘸上紫藥水在一張報紙上寫了幾個大字：“中央決定把你轉移到另一個地方”，劉少奇無言以答。解放前，他經曆過白區的鬥爭，理解這轉移可能包含的內容。他把臉轉了過去。隨著劉少奇頭部的轉動，護士又把那張報紙拿在他眼前，劉少奇再次把臉扭開。無奈，劉少奇原衛士長隻得俯在他耳邊，把寫在報紙上的字念了一遍。劉少奇緊閉雙眼，一言不發。此時，他心中一定非常清楚，等待他的將是什麼。
用不著劉少奇明確表態，他便被轉移了。
患有糖尿病的劉少奇，由於失去生活自理能力，長期臥床，又沒有人為他清洗，身上又髒又臭。臨離開北京時，看護人員索性把他的衣服剝去，包裹在一床粉紅色的緞麵被裏，被上蒙了一條白色床單。晚七時，劉少奇被放在擔架上，在專案組人員監護下，由護士和劉少奇原衛士長陪同，放在飛機後艙，運往河南開封。
晚9時許，載著劉少奇的飛機降落在開封機場。劉少奇被拖下舷梯，由救護車送往原開封市人委大院內的一座天井小院，小院四周是四座三層高的樓房，前後左右都不臨街道，電網密布，院外有重兵看守。劉少奇被安排在西樓一層南頭的裏間屋內。