不久，世祖又於閏六月初五正式賜經略洪承疇敕書，在前諭之基礎上作了一些重要的具體補充。全敕如下：
“茲以湖南西廣地方，底定已久，滇黔阻險，聲教罕通，不逞之徒，未喻朕心，時複煽惑蠢動，漸及湖南，以致大兵屢出，百姓未獲寧息。朕承天愛民，不忍勤兵黷武，困苦赤子，將以文德綏懷，歸我樂宇，必得夙望重臣，曉暢民情，練達治理者，假以便宜，相機剿撫，方可敉寧。遍察廷臣，惟爾克當斯任，前招撫江南，奏有成效，必能肅將朕命，綏靖南方。茲特命卿經略湖廣、廣東、廣西、雲南、貴州等處地方，總督軍務，兼理糧餉，聽擇扼要處所駐紮，應巡曆者，隨便巡曆，總督應關會者，必谘爾而後行，爾所欲行，若係緊急機務，許爾便宜行事，然後知會。巡撫、提督、總兵以下，聽爾節製，兵馬糧餉，聽爾調發。文官五品以下，武官副將以下，有違命者，聽以軍法從事。一應撫剿事宜，不從中製，事後具疏報聞，滿兵留撤，俟到日酌妥即行具奏。事關藩王及公者，平行谘會，相見各依賓客禮。文武各官，在京在外，應於軍前及地方需要者，隨時擇取任用，所屬各省官員，升轉調補，悉從所奏。撫、鎮、道、府等官，有地方不宜，才品不稱，應另行推用者，一麵調補，一麵奏聞，吏兵二部不得拘例掣肘。應用錢糧，即與解給，戶部不得稽遲，如緊急軍需，撥解未到，即與就近藩司、榷關行文取用，具疏奏聞。其歸順官員，內外酌量題錄，投降兵民，隨宜安插。事會可乘，即督兵進取，時宜防守，則慎固封疆。各處土司，已順者加意綏輯，未附者布信招懷。四川、江西、河南、陝西地方，鄰近湖廣，應有兵事相關者，移文總督、巡撫，掎角策應。卿受茲委任，務開誠布公，集思廣益，收拾智勇，毋為逆黨所誘，綏輯窮黎，毋為貪官所苦。進戰，則得地以守，固守，則出奇以戰，練士卒在平時，選賢良置要地，務使滇黔望風來歸，官民懷德恐後，庶稱朕誕敷文教至意。功成之日，優加爵賞。地方既定，詳善後，即命還朝，慰朕眷懷，爾其欽哉！”《清世祖實錄》第76卷第18、19、20頁。
這兩道敕諭十分重要，是幾年以來清廷用兵方略的一大變化，是指導今後一段時期軍事行動的基本方針，也是朝廷在任帥人選上的一種新的選擇。綜觀這兩道敕諭，結合有關文獻，可以看出四個問題。其一，剿撫兼施，偏重於撫。諭、敕皆一開始即強調要“以文德綏懷，不欲勤兵黷武”，“若全恃兵威，恐玉石俱焚”，將此列為經略的首要目標和方略。這和在諭告內三院之前幾天的一道諭旨，有著密切關係。順治十年五月十四日，世祖給兵部下了一道多年未見的罕有諭旨，宣布要大力推行招撫諭降。諭旨說：“天下初定，瘡痍未起，加之此年水旱，民不聊生，饑寒切身，迫為盜賊，及至官兵捕剿，玉石難分，魁惡雖多，剪除株蔓，豈無冤濫。況當年沉陷，情事不同，或見迫於貪汙，或迫脅於渠寇，既為賊黨，自拔無門”。今特降殊恩，曲加赦宥，自順治十年五月二十五日以前為“土賊”者，無論人數多寡罪犯大小，但能真心改悔自首投誠，盡赦前罪，仍著有司安插，“兵仍補武，民即歸農”。著兵部即速行文各地方督撫，轉行所屬，分貼告示曉諭，仍將撫過人數安插事實不時奏聞。《清世祖實錄》第75卷第16、17頁。也就在這前後幾天，招撫鄭成功之事正在大力進行，特封鄭成功為海澄公，其叔鄭鴻逵為奉化伯，並遣使敕諭成功及早歸順。《清世祖實錄》第75卷第8、9、10頁，第79卷第3、4頁。