字仲陽，祖籍浙江錢塘，後祖父北遷，遂為東平鄆州（今山東鄆城縣）人。約生於宋明道元年，卒於政和三年。
錢乙自幼“從呂君問醫”，精勤好學，認真鑽研《內經》《傷寒論》《神農本草經》等。他“辨正闕誤”，所下功夫很深。此外，他把古今有關兒科的資料一一采輯，加以研究。在錢乙之前，有關治小兒病的資料不多，宋初，有人托名古代師巫撰《顱囟經》二卷，談到了小兒脈法，病症診斷和驚癇、疳痢、火丹（即丹毒）、雜證等的治療方法。錢乙對這部書反複研究，深有啟發，並用於臨床，收到了很好的療效。錢乙還受到《顱囟經》“小兒純陽”之說的啟示，結合自己的臨床實踐在張仲景總結的辨證施治的基礎上，摸索出一套適應小兒用的“五髒辨證”法。
錢乙由於對小兒科作了四十年的深入鑽研，終於摸清了小兒病診治的規律，積累了豐富的臨證經驗，著有《傷寒論指微》五卷，《嬰孺論》百篇等書，但皆散失不傳。現存《小兒藥證直訣》，或叫《小兒藥證真訣》，共三卷，上卷言證，中卷為所治病例，下卷為方劑。該書最早記載辨認麻疹法和記百日咳的證治，也是最早從皮疹的特征來鑒別天花、麻疹和水痘的醫書，書中記述多種初生疾病和小兒發育營養障礙疾患，以及多種著名有效的方劑，還創立了我國最早的兒科病曆。此書一向為曆代中醫所重視，列為研究兒科必讀之書。它不僅是我國現存最早的第一部係統完整的兒科專著，也是世界上最早的兒科專著。《四庫全書目錄提要》稱錢乙的書為“幼科之鼻祖，後人得其緒論，往往有回生之功”。