隨即有大批軍警在出事地點搜查刺客，當場捕獲了張先培、黃之萌、楊禹昌、陶鴻源、薛榮、李懷蓮、許同華、傅思訓、黃永清、蕭聲10人。但當時又由袁手下的著名大劊子手、勞務處總理陸建章親自開庭審問，當天就有法國新聞記者保釋了其中的7個人，隻有張光培、黃之萌、楊禹昌三人因當場搜出武器被判處死刑，當天執行。
這些刺客並不都是同盟會會員。他們都不滿意南方對袁的妥協政策，想用暗殺手段把這個不雨不晴的局勢擺轉過來。行刺的人分為三隊，每人攜帶手槍一支、炸彈一枚，一隊裝作三義茶館的的茶客，一隊裝作祥宜坊酒店的酒客，還有一隊徘徊在東安市場附近擔任接應。他們都不是熟練的槍手，雖然布置得很好，但因沒有投中目標而失敗了。
對於袁世凱來說，這次遭刺，可謂是“大難不死，必有後福”。
從此，隆裕太後不但不懷疑袁是“革命軍的奸細”，並且相信他是清政府的“股肱社稷之臣”，當天就派特使前往慰問，並於26日封為一等侯以示優異。也正是由於這一事件，使袁以前所捏造的用以恐嚇清政府的“革命黨人已經遍布於北京城”的謠言得到“證實”，引起清政府內部的大慌亂，使他們不得不在保全皇位與保全性命之中選擇其一。
就從這天起，袁稱病不入朝，派他的心腹民政部大臣趙秉鈞做他的代理人。1月19日（農曆十二月初一日），趙在參加禦前會議時采取了攤牌的辦法，提出了南北兩政府同時取消、另在天津組織臨時政府以及優待清皇室的問題。在座的年老王公都默默無語，少年親貴則堅決反對，使得隆裕皇太後作不出最後的決定來。
趙秉鈞突然站起身來大聲地說：“今天開會，明天也開會，議來議去議不出個所以然來，內閣隻得引咎辭職！”
他滿麵怒容地往外跑，署理外務部大臣胡惟德和署理郵傳部大臣梁士詒也跟著走出來，嚇得隆裕太後臉上變了顏色。
1月26日，袁又第二次使用他的法寶：北洋軍將領段祺瑞等47人聯名發出通電，籲請清帝即日退位，明定共和政體，以安皇室而定大局。25天之前，通電誓死擁護君主立憲，反對共和政體的也正是這些將軍，名單上僅僅缺少了一個馮國璋。
原來馮國璋在攻下漢陽後，清政府封他二等男爵，他曾經表示過“感激涕零，願為朝廷效死”；他此時已經內調，不適宜於出麵來唱這個“反調”了。
就在同一天，又發生了一件出人意料的刺殺案，清貴族中的少壯派良弼被一個名叫彭家珍的誌士刺死了。
良弼是清貴族中惟一有膽識的軍事人材。禁衛軍名義上由載濤統率，良弼以禁衛軍第一協協統兼任軍谘使，實際上是禁衛軍的組織者與領導者。以前袁到北京來組織責任內閣時，其第一步驟就是要把清政府的這支武力奪過來，他才可以把清政府完全控製在自己的手裏。
他特意提出皇族應當親自出征的建議，逼使膽小如鼠的濤貝勒辭去禁衛軍軍統，他就把他的心腹大將馮國璋從漢口前線調回來，接替了這個位置。
但是，禁衛軍的實權仍然抓在良弼的手裏，而良弼正是對袁世凱最懷疑、最反感的一個人物。如果馮國璋以袁的私黨的麵目出現，而不以清政府的忠實奴才的偽裝姿態出現，就很難插進清皇族的圈子裏充當袁的內奸。他和袁的密切關係是人所共知的。但自他得到二等男爵以來，就經常地表示“與袁的政見不同”，反對與“反叛朝廷的匪軍”講和，主張組織力量“大力撻伐”。
慣於賣弄小聰明的良弼，錯誤地認為馮是為個人打算因而與袁所走的路線不同，就竭力拉攏馮，借以分化袁的力量。
良弼始終認定袁是插在清政府心髒裏的一支毒箭。
當袁內閣以辭職手段要挾清政府接受退位條件時，主張批準內閣辭職，另組皇族戰時內閣，派鐵良南下統率“討伐軍”的也正是良弼。袁從內線取得了這個情報。當然，袁在京內的力量大過良弼的力量，殺良弼是可以做得到的。但是，殺害一個皇族，將使他永遠洗不清“活曹操”的惡名，而他是不肯這樣做的。
刺死良弼的彭家珍，四川陸軍武備學堂畢業，曾任奉天軍事教官及中級軍官。1911年同盟會北方支部成立時，彭入盟被推為軍事部長。他聽了良弼阻止清室退位的消息，內心十分氣忿，願以一死除此害群之馬。1月26日，他守在光明殿胡同良弼住宅的附近，等到良弼下朝回來，他扔了一顆烈性炸彈，炸斷了良弼的一條腿，延至次日不治而死。彭自己也被彈片炸傷，當場犧牲了。
在此以前，袁曾捏造“革命黨人潛伏京師”的謠言，清貴族還將信將疑。在11天之內，接連發生袁自己被刺和良弼被炸身死的兩大事件，他們就不能不相信袁的話是有根據的。並且由於袁本身也是刺客的對象，沒有人懷疑良弼之死是出於袁的政治陰謀。