“我們被陷害了！”周純麟將被打，與於連長對質，以及自己沒有承認的情況，全部告訴了曾玉良。
一天下午，軍法處長把曾玉良從監獄裏拉出去。周純麟在門縫看到後，心痛欲絕，為他難過，自己受過刑，知道那種味道真是太難受了。
曾玉良受刑回到監獄後，通過牆縫，告訴周純麟受刑的情況。他被帶到審訊室後，劈頭第一句就是：“你是不是共產黨員？你是不是蘇聯的走狗？你有沒有紅五角星？”他不承認，他們就用馬鞭子輪番抽打，打得他死去活來，直到第三天晚上，才被拖回牢房。
周純麟又連續坐了五天五夜的老虎凳，死過去活過來好多次。棍棒、扁擔、皮鞭、辣椒水等等各種刑罰的滋味，都嚐過了。他被打得皮開肉綻，背上的衣服早已成了碎片，黏在血和肉上。但是，靠著寧折不彎生命力的倔強，他硬是咬緊牙關，一句不招！曾玉良雖然比周純麟少受了幾次刑，但是每次也把他打得很慘。有一次，他被打昏過去後，被直挺挺地拖回牢房。
身心交困的最沉重時刻，寒冷和饑餓也不放過他們。他倆在監牢裏都戴著腳鐐，睡在蘆席上，冰涼冰涼的，寒氣直往心窩裏鑽。整天吃不飽，一頓一個不到拳頭大的饢，一碗涼水。周純麟雖然吃不飽，還能馬馬虎虎對付著。可是，曾玉良的肚子大，過去在紅軍裏是出名的小胖子，別說是隻有一個拳頭大的饢，即使一頓五個也很難填飽他的肚子。曾玉良有時餓的呀呀直叫，可是在敵人麵前一個餓字也不講。敵人拿油煎的餅子來引誘他招供，他連看也不看一眼。
十多天過去了，周純麟的傷剛剛有點好轉，軍法處長和幾個公安人員又把他帶去審問，又一次讓於清文連長與他對質。這一次，周純麟比較策略，先頂著於清文的話說：“你要說我反政府的話，那是我反對政府中的貪官汙吏，反對政府裏那些陽奉陰違的人！”因為他知道這樣講，與“六大政策”中的“清廉”是一致的。但是，軍法處長不肯罷休，一個勁兒地讓公安人員用皮鞭抽打他。他們自己輪班休息，卻不讓他睡覺，不給他飯吃，不給他水喝，一連拷打折磨了三天，還灌了辣椒水。
周純麟回到原先的牢房之後，卻不見了曾玉良。原來，敵人覺察到他倆有接觸，於是在他出去受審的時候，搜查了他倆的牢房，連破席和牆縫都搜遍了。他們還是不放心，就把曾玉良調到別的牢房去了。
天氣很冷，他們與敵人鬥爭的內容又增加了一個方麵，就是要草墊，要被子，要火烤，還要一個小便桶。一天夜裏，周純麟在過堂時，看到自己的被子蓋在一個公安人員身上，就提出：“我要被子。”
軍法處長陰陽怪氣地說：“你的被子我也想給，可是，你們連隊還沒有將你的被子送過來啊，我拿什麼給你呢？”
“我們連隊已經將我的被子送來了。”
“在哪裏呀？我怎麼不知道。”
“在那個家夥身上！”他用手指著躺在床上，蓋著他的被子的公安人員說。
“你怎麼知道的？”軍法處長厲聲問道。
“因為我被子的一頭，有一條黑平光呢縫著。”他理直氣壯地回答。
軍法處長見他說的證據確鑿，本來就很長的臉一下拉得更長了，提起皮鞭一麵劈頭蓋臉地猛烈抽打，一麵惡狠狠地說：“就是不給你！就是不給你！”
周純麟也毫不示弱，又提出三條要求：第一，要見原來喀什警備區的司令；第二，要見原來騎兵四十八團的張團長；第三，把我送回省城，見盛督辦。他這三條提出後，他們好多天都沒有答複，也沒有審訊他。他一見到軍法處長就提這三條要求，此人一直避而不答。
11月中旬的一天晚上，突然一位蘇聯顧問到監獄裏來，悄悄地把他帶到辦公室，翻譯也是蘇聯人。當時，他不認識這位顧問，因為這位顧問不是他們司令部的顧問。他事後才知道，這位顧問是從省城來的，是盛世才的總顧問。
周純麟跟著顧問進了辦公室。顧問讓他先坐下，定定神，然後劈頭第一句話就問：“你們坐監獄是怎麼回事？好好對我講一講。”
當時，中蘇兩黨關係是很好的。他在喀什騎兵四十八團時，因到蘇聯顧問住處彙報情況，也常與司令部的蘇聯顧問見麵。因此，顧問一提問，他就將什麼時候進的監獄，審問的內容，以及獄中的殘酷刑罰等，統統說了。
顧問問得很詳細，連他的吃、住、睡以及獄中天天死人的情況，都一一問到了。顧問反複問他：“據你所知，他們是為什麼把你送進監獄的？”
周純麟想了一會兒，說：“對於這個，我確實說不清，但聽看守和放風時別人議論，好像是反盛世才的人利用反間計，來陷害跟隨盛世才的人，而我和曾玉良被牽連了。”他又把在監獄裏聽到的情況告訴蘇聯顧問，“聽說是英國住喀什的領事，收買了騎兵三十一團的艾買提團長和公安局的一部分人，陷害了這個團的米傑副團長。米傑受刑後屈打成招，又咬了我所在的騎兵四十八團的於清文連長，於清文又咬了我和曾玉良。”
這天晚上，蘇聯顧問與他談了兩個多鍾頭。最後，顧問說：“我是從省城來的，你是中國工農紅軍，不要怕。中國工農紅軍是什麼也不怕的，他們不能把你怎麼樣！”聽顧問這麼說，周純麟心裏一亮，坐牢的事黨組織已經知道了。
從這以後，他們的生活情況有了一些改善，地上有了鋪草，被子還給他了，連隊也給他送來了大衣，審訊次數也明顯減少了。
1939年正月的一天夜裏，軍法處長突然帶著幾個公安人員闖進牢房，不問青紅皂白，給周純麟戴上腳鐐，戴上手銬，還用一塊黑布蒙住頭，推上汽車。他還以為要暗害他們，後來從押送士兵的閑談中才知道，是盛世才來了電話，說案情重大，一個人也不要死，要安全地送到省城，他要親自審問。這天夜裏，周純麟被從漢城監獄送到回城公安局的王廟第四監獄。在回城監獄，還是三天兩頭被審問一次，他還是那麼幾句話。
2月，周純麟、曾玉良、趙海豐，還有一個維吾爾族的副團長共四個人，被當成“要犯”分乘四輛車子，由一個排的部隊押送，從喀什的監獄出發，走了一個多星期，於一天下午到達省城督辦公署的大院門口。
天依然昏昏欲睡的死樣子，下著鵝毛大雪，非常寒冷。周純麟頭上沒有帽子，身上還穿著夏天的單衣，披著黑色的夾大衣。他下車後好長時間都站不穩，想把靴子脫下鬆鬆腳，但腳腫得厲害，脫了好久也沒有脫下來。
他們進了督署的第二道門之後，從裏麵出來兩個軍官，帶著幾個士兵，要把他們四個人往後院監獄裏送。那個維吾爾族中校副團長邊哭邊叫喊，非要見盛世才本人不可。幾個士兵推他拉他，他堅決不走，就在地上躺著，怎麼拉也拉不動。他們三人也不願意走，一定要見盛世才。雙方僵持不下，一個軍官跑到後麵去了兩趟。
盛世才衣冠楚楚，從裏麵走出來。維吾爾族副團長心急火燎急不可待，從地上爬起來，大步走上前去，跪在地上，脫了上衣，轉過身去，要盛世才看他的背。
周純麟也上前幾步，隻見他的背上一個眼一個眼的，周圍有許多火泡，都破了皮，血肉模糊。他背上的眼，是在喀什受審訊時，先用錐子錐，然後用油紙撚子放進去燒。盛世才看了那個副團長的背，改變了原先要他進監獄的決定，對身旁的一個軍官說：“把他送到醫院去。”為什麼這個中校副團長在公署裏敢於大叫大嚷？盛世才見了他的背之後，為什麼又能讓他住進醫院？
當時，喀什附近駐有兩個騎兵團。騎兵四十八團住在漢城，是盛世才的老部隊；騎兵三十一團住在回城，大都是維吾爾族人。1937年南疆叛亂時，三十一團也有不少人想叛變盛世才，但由於沒有來得及跑掉才住在回城裏。對於這一點盛世才心裏清楚，於是就從自己身邊的衛隊裏，派了四個親信，想去改造這個團。一個是警衛連連長，也就是被屈打成招的中校副團長。盛準備讓這個副團長接任團長，另外三個人是警衛連的排長，準備接任這個團的三個連長。臨行時，盛世才特地向這個副團長交底說：“你名義上是副團長，三個排長暫時還當排長，但你們要注意控製部隊，要不了多久這個團就交給你們了！”