薩空了買齊必要的機器設備，招聘了30多人，已經是1939年3月了。
機器很重不能用飛機運。他們先將機器陸運到越南，經海防、河內，穿過越北，進入廣西境內，通過貴州運到重慶。這條運輸線是為了運輸抗戰物資，宋子文搞的一個東南運輸公司。他們在河內受到了法帝國主義在業務上的阻撓，在越南呆了將近兩個月。在河內，他們幫助王炳南的德籍夫人王安娜，找到了放在倉庫裏準備運送給延安的藥品，並把王安娜和藥品送走。
機器運到重慶，陳立夫的CC係截住車子，說他們事實上是去延安。盛世才住重慶的代表張元夫也是CC係，站在陳立夫的立場上，交涉時不使勁。他們在重慶差不多等了三個月。
機器運到蘭州，國民黨西北行政長官朱紹良支持軍統，又把他們的車子扣下，全部鎖進山洞裏。薩空了找軍統的人問：“這是新疆的東西，放行不放行？”軍統的人說要打電報問蔣介石。那時，蔣介石有求於新疆，回答說應該放行。
此時，周恩來在蘭州，住在中運會蘭州招待所。他是墜馬摔壞胳膊去蘇聯治病的，鄧大姐和孫維世陪同。薩空了知道周副主席在蘭州後想去見見，因為自己困難太多了，看看周副主席有什麼幫助。薩空了見到周副主席、鄧大姐和孫維世，還在一起吃了飯。“今天晚上，蘭州領導請我看戲，你跟我一起去。”周副主席說。
看完戲後，薩空了問周副主席：“你這次經過新疆，告訴沒告訴盛世才，是否打算告訴盛世才。”
“沒有。”周副主席接著說，“用你個人的名義給盛世才打個電報，說我要路過迪化。”
後來，薩空了從毛澤民那裏知道，盛世才親自到機場迎接，大開盛宴，恭恭敬敬地送走了周副主席。
1939年9月間，薩空了的車子回到迪化。報社可以像個樣來辦了。薩空了離開迪化到回來，這中間有八、九個月時間。他到迪化後，馬上碰到問題，盛世才已經不讓杜重遠見人了。
“我要去見杜重遠，可以吧？”薩空了問盛世才。
“你去吧，沒問題。”
事實上，杜重遠已經被拘留起來。薩空了問杜重遠是怎麼回事？
“我已經向政府辭職，不再做新疆學院院長了。我這地方門庭冷落，沒人敢到這來了！”
“到底是怎麼回事？”
“我後悔，沒等你回來，寫了一封6000字的信，批評盛世才。本想等你回來商量後再送給他，因你老是沒消息，也不知什麼時候回來，所以就直接送給他了。”
“你雖和他是同鄉、同學，但他這個人是翻臉不認人的。你自己寫的《盛世才與新新疆》中說，他這個人吃一頓飯就可以把所有的人關起來。你怎麼不考慮這個問題？”
“我已經等不及了，我看他實在不像話！”
杜重遠最主要的問題是，這年暑假率新疆學院暑期工作團去伊犁。這雖經盛世才批準，但杜重遠沿途宣傳群眾，宣傳抗日，盛認為杜是宣揚自己，別有用心。伊犁行政長姚雄對工作團郊迎十裏，對杜重遠十分熱情，盛認為他們乘機串聯，相互勾結，是杜在網羅黨羽，圖謀不軌。杜重遠作為新疆學院院長，叫學生下鄉，深入農村，深入社會，做社會調查，了解下邊群眾受壓迫受迫害的情況。有人興風作浪，告密起哄，說杜的目的是當督辦，取盛世才而代之。盛世才能容忍嗎？杜重遠峻峭挺拔，但無法在現實中展示高遠的情誌。他給盛世才寫了長信，表白自己是一心想幫助盛建設新疆，卻遭人嫉妒和暗算。信中還揭露盛手下那幫人的問題，最後提出辭職。