第五，水土流失嚴重加劇了麵源汙染度。漢江位於秦巴山區，山高坡陡，土薄石厚，暴雨頻繁，降水量大而且集中，水土流失相當嚴重。雖然陝西省秦巴山區麵積僅占長江流域的4%，年輸入長江泥沙卻達1.2億噸，占長江總輸沙量的12%，而且水土流失的麵積有進一步擴大的趨勢。據調查分析，陝南地區坡耕地平均每年每畝流失表土1.5厘米，約流失土壤12萬噸，相當每畝每年損失氮磷鉀肥270公斤，土地肥力不斷降低，迫使農民不斷增加化肥使用量。20世紀80年代中期和90年代末相比，化肥使用量由每年9.8萬噸增至17.1萬噸，增加了1.8倍，單位麵積使用量增加了3.1倍。嚴重的水土流失不但威脅到陝南3市人民群眾的生活、生存、生產，而且加劇了麵源汙染度，嚴重阻礙了陝南三市經濟社會的可持續發展，直接影響了南水北調中線工程水源區的水質。
二
保護和恢複漢丹江流域的生態環境不僅是保護南水北調工程優質水源的需要，也是治理水土流失減少入江泥沙，保護長江水源地，為長江中下遊地區創建更加安全發展環境的需要，同時也對維護該地區世界級自然遺產和豐富的生物多樣性具有十分重要的作用。
第一，進一步完善和盡快實施《丹江口庫區及上遊水土保持環境建設規劃》，將陝西漢丹江流域的5市31縣（市、區）全部列為水土保持生態治理的重點區域，予以重點投資，並提高投資標準。力爭使陝西在5-10年內，完成對2.74萬平方公裏水土流失麵積的全部治理。每年逐步減少6000萬噸泥沙流入丹江口水庫，確保“一江清水送北京”。
第二，采取國家投入和受水區籌集相結合的方式，從每調1立方米水中提取1元收入，建立陝西南水北調中線水源區建設基金，扶持水源區的水土保持、水資源保護和發展綠色經濟產業，解決因提高工業廢水排放標準後工礦企業治汙補助、關停企業債務和員工安置。切實處理好水源保護與經濟社會發展的關係，改善水源區群眾生產生活條件，構建人與自然和諧發展的社會環境。
第三，為保護南水北調中線工程能夠充分長期地發揮效益，將漢丹江流域水資源保護作為受水區經濟和社會發展的重要組成部分，納入京、津、華北地區社會經濟發展的中長期計劃之中，統一規劃和全麵部署。在退耕還林、天然林保護、生態公益林補償、長治工程、優勢農產品產業帶開發、農村能源建設等項目出台的政策和措施，應優先向水源區傾斜，支持水源區人民群眾發展生產。加大對水源區的財政轉移支付力度，實施金融扶植政策，幫助水源區恢複活力。像建設北京密雲水庫、引灤入津工程一樣，給予一定的經濟支持和政策優惠。
第四，盡快建立漢丹江流域生態補償機製。生態補償是一個新興課題，目前國家尚未出台與之相關的政策法規，建議國家能夠以漢丹江流域水源地生態補償為對象，以專家為主體，組建專門的調研班子，全麵係統地研究生態補償機製問題，讓水源區受損者的福利狀況得到改善，促進生態環境建設的良性循環，保持自然生態永續利用。
第五，適度提高大中型水庫水利工程水源地移民安置補償政策標準，確保移民搬得出、穩得住、能發展、有保障。實現移民的長治久安，構建水源區和諧的人際關係和保持社會的祥和穩定。陝西省安康市有24萬貧困人口，居住在水源保護區內高寒山地，建議國家每年安排搬遷5萬人，力爭在“十一五”期間內全部遷入中低山區，並大力發展沼氣，減少水源保護區的群眾生活取暖對木材的依賴，封山育林，恢複自然植被，使水源保護區生態良性循環，山區群眾早日脫貧致富。