優先發展重點領域，以科研促進臨床技術的提高。進一步擴充以家係為主的精神分裂症永生化細胞庫，為精神分裂症候選基因的檢測奠定了物質基礎；著重各類型精神病的家係收集，最大一例精神分裂症家係達80餘人，並繪製出大家係圖譜，為下一步的連鎖分析和基因定位做好準備；建立了精神分裂症腦抗原的提取與檢測技術，進行了單核細胞、T淋巴細胞酸性醋酸酯酶組織化學染色、圖像分析，進一步確定精神分裂症病人免疫改變的規律，為臨床檢測精神分裂症提供生物學指標。在萊姆病研究中，利用自行建立的離體免疫製取單克隆抗體的方法，成功製取抗P39單克隆抗體，對陽性雜交瘤進行克隆，對腹水抗體進行純化與鑒定，進一步摸索萊姆菌培養技術，並製備了性能優良的抗原片數百張，發表論文4篇。在廣泛推廣萊姆病試劑盒的基礎上，其診斷準確率得到了進一步驗證，並申報國家發明專利。
實行獎懲機製，充分調動全員積極性。進一步修訂完善了《科學技術獎勵辦法》。醫院獲軍隊科技進步三等獎2項，醫療成果三等獎1項。檢驗科佟玉品主任的“酵母表達的戊型肝炎結構區ORF2蛋白生物學特性研究”、馮方波的“精神分裂症患者中樞神經係統免疫調節失衡及病理意義”分別獲得軍隊科技進步三等獎；精一科梅桂森主任的“中西醫結合治療精神病的臨床研究”獲得醫療成果三等獎。全年發表論文159篇，其中國家級68篇，省市級91篇，有29篇登在統計源期刊。
重視龍頭專業建設，創辦特色中心。本著“突出重點，兼顧一般”的大專科、小綜合辦院宗旨，突出發展本院精神衛生專業的優勢，重點建設。按照《北京軍區醫學專科中心管理辦法》及《考評細則》的標準，在精神病科原有特色的基礎上，按照《精神衛生發展“十五”規劃》，大力加強科室技術建設和人才培養。上半年通過自評、初審、終審和答辯，得到軍區評審組專家和聯勤部領導的一致認可，列為軍區“3.27計劃”，成為“十五”期間全區重點發展的專科中心。
其他工作進一步完善“軍衛1號”工程網絡建設。完成了“軍衛1號”工程網絡服務器的更新及數據遷升；增設了8個信息站點；完成醫生工作站、住院登記、病案編目等子係統版本更新；引進應用《醫療質量實時監控》軟件；完成北京市醫療保險數據結構更新、操作員培訓及網絡程序使用。醫院配合全軍“百館萬家”工程，與解放軍醫學圖書館聯網，實現了網上查詢，開設了4個查詢工作站點，同時，引進《GLIS通用圖書館集成係統》軟件，使圖書館采購、編目、流通、管理實現全自動化管理。
健全製度，藥材采購更加規範。藥材實行集中招標采購，醫院有215種藥品參加軍區和總後的招標，招標金額占總采購金額的46%。投資218萬元購置了激光相機、CT球管、自動染色尿沉渣、人工腎水處理裝置、病理細胞顯微分析係統等設備，設備總價值達2000萬元。
根據北京市醫保中心的要求，做好基本醫療保險網絡數據的上傳和下載，對醫保網絡版藥品、診療項目、服務設施等目錄進行了維護，實行了與“軍衛1號”工程的轉換，6月份正式啟用，實現了網上結算、報盤等工作。(二六一醫院)海軍總醫院
醫療工作堅持以質量為中心，狠抓了醫療護理質量管理和醫療安全管理。不斷深化整體護理，建立了臨床護理支持中心，確保以病人為中心護理理念落實到位。自9月1日實行《醫療事故處理條例》後，對醫院醫療安全工作提出了更高更嚴的要求，在全院提出了“醫療安全等於自身安全，醫療質量等於病人生命”的口號，及時製定了《海軍總醫院維護患者及其親屬知情同意權管理辦法》、《海軍總醫院病曆管理辦法》和《海軍總醫院醫療事故、糾紛防範及處理預案》等相關製度。加強醫療質量監督，強化環節質量管理，建立了個人、科室、機關三級醫療質量監控網絡，建立醫療質量獎懲機製，設立了年度科室醫療安全流動獎杯。通過以上措施，促進了醫護質量的提高，有效地降低了事故和糾紛的發生率，醫院全年未發生一起醫療事故。
年門診456261人次，急診48122人次，同比增加了38.3%；出院14826人次，同比增加了8.4%，床位使用率97.2%，周轉次數20.8。門診與出院診斷符合率98.6%，臨床初診與確診符合率99.4%，臨床與病理診斷符合率及入院3日確診率達100%。住院病人搶救成功率86.7%，治愈好轉率97.8%，治愈者平均住院日14.5天，均達到了總後要求。無三級醫療事故，無菌手術切口感染率0.07%，院內感染率2.6%，甲級病案率98.4%，均達到了總後質控指標。
醫保工作。醫保門急診33855人次，住院1132人次，醫保總收入2495.15萬元，同比增長78%。
開展新業務、新技術共100餘項，組織重要新業務、新技術論證會8次。其中I125籽粒內照射治療腦內實性腫瘤、氬氦刀治療肺部腫瘤、嗅鞘細胞移植治療脊髓損傷等新技術在臨床的運用取得新的進展。
始終堅持姓軍為兵的辦院方向，把為兵服務放在首位。醫院連續4次被總後評為“全軍為部隊服務先進醫院”。根據體係部隊的實際需要，醫院對為兵服務措施進行了充實完善，新增了建立綠色就診通道、為邊遠體係部隊傷病員提供電話通報檢查結果服務、調整軍人用藥目錄等6條措施，最大限度保證軍人看病優先優質、同病同治。全年門、急診共診治軍人151756人次，占門、急診接診病人總數的33.3%，住院收容軍人4152人次，占住院病人總數的28.1%。組織了26批次238人次到26個單位巡診，共累計檢診4388人次。召開體係部隊座談會6次，征求為兵服務工作的意見。3次派專家、教授對313醫院進行技術指導；赴東海艦隊10個單位巡診，為官兵檢診3393人次；組織師以上幹部體檢，曆時一個半月，體檢2686人，總受檢率為83.7%。為體係部隊辦理包幹、醫療保健證17000人次。實施軍人特殊醫療項目10項、79人次。全年共為軍人看病補貼2126.76萬元，圓滿完成150名飛行學員招飛體檢任務。
出色完成“兩會”、“十六大”的保健及軍內各類保障任務。中央保健委員會辦公室授予本院“中國共產黨第十六次全國代表大會醫療保健先進單位”。繼續做好對落後地區醫療事業的掛鉤幫帶，派出3名專家對雲南會澤人民醫院進行為期2個月的技術幫帶，捐贈醫療設備價值約5萬元，並無償接受會澤醫院進修人員4人；捐贈密雲穆家峪醫療設備價值3萬元；參加北京市組織的衛生下鄉和各類巡診29人次。
醫學教育繼續醫學教育。全年完成國家級繼續醫學項目4項，全軍一類項目6項，海軍二類項目3項和海軍體檢信息管理學習班1次，參訓人數431人。醫務人員全年外出參加各類專業會議210人次，學習班56人次，外出進修5人次。出國交流、考察21人次。院內舉辦學術活動35次，舉辦國際學術交流1次，共有2100餘人次參加學習，在院內形成了良好的學術氛圍。選送了9名優秀人才攻讀博士學位，17名攻讀碩士學位。
臨床教學工作。全年接收進修生173人，軍人36人；實習生219人，軍人188人。對進修生實行了崗前培訓，計66學時。對實習生組織大講課20學時，510人次。實習學員出科考核67人次。全年為部隊培養進修生、實習生280餘人。2002年增列碩士生導師2名，目前本院擁有博導3名，碩導18名，博士生培養點3個，碩士研究生培養點18個，國家人事部已批準本院設立博士後流動站。正式成立了第二軍醫大學海軍臨床醫學院，現有學員55名。成立了13個教研室，28個教學組，首批聘請118名教授、副教授、講師，全年完成教學2329學時。