石淋的成因，和其它淋病一樣。總的是濕熱蓄於下焦，形成“腎虛膀胱熱”的機製而來的．其不同之處，在於石淋要經過濕熱受到煎熬而結成砂石；如《丹溪心法》說：“淋症所感不一，或因房勞，或因忿怒，或因醇酒，或因厚味。蓋房勞者陰虛火動，忿怒者氣動生火，醇酒厚味者釀成濕熱，積熱既久，熱結下焦，所以淋漓作痛，初則熱淋、血淋，久則煎熬水液，稠濁如膏，如砂石。”
《醫宗必讀》和《張氏醫通》也有相同的記載說：“正如湯瓶久受煎熬；底成白堿。”
“積熱既久，熱結下焦”階段．相類於近代醫學中的由於輸尿管疾患引起尿液鬱滯，出血、粘液增多，上皮細胞多量脫落、菌團形成的一個過程。水液久受煎熬情況．相類於近代醫學中由脫落的上皮細胞片、菌團、血塊、粘液為核心，不斷結合尿液中的磷酸、鞣酸、鹽類等而成為砂石的過程。
石淋的治療，由於有濕熱結於下焦，所以要用清利濕熱的藥，由於久受煎熬，結成砂石，所以要用通淋排石的藥。這是一種針對性很強的治則，古人也多數認為石淋離不開熱的情況。《素問·六元正紀大論》中“其病中熱，脹肚，小便黃赤，甚則淋”，“不遠熱則熱至……熱至則身熱……淋閉之病作矣”等的記載，肯定了淋病有熱；陳修園也說“五淋病，皆熱結”。所以近代大多數治療石淋的報道中，均用大隊清熱利濕排石的藥物，如金錢草、瞿麥、葵子、牛膝、虎杖、大黃等，也確實收到了良好效果。此外古人還提出了淋病忌汗、忌補之說，忌汗出官《金匱》“淋家不可發汗、發汗則必便血”，忌補則是多數古人的看法，如張路玉說：“最不可用補氣之藥，氣得補而愈脹，血得補而愈澀’，熱得補而愈盛，水瀆不行，加之穀道閉遏，未見其能生者也。”劉完素甚至認為在冷淋的治療中用熱藥也是“使氣液宣通，熱散而愈”，他在《素問玄機原病式》中說：“世傳方論雖日冷淋，複用榆皮、瞿麥、茯苓、通草雞蘇、鬱李仁、梔子之類寒藥治之而已，其說雖妄，其方乃是，或謂患淋而服茴香、益智、滑石、醇酒溫藥而愈者，然則冷歟，殊不知此皆利小便之藥也，蓋醇酒、益智之性雖熱，而茴香之性溫，滑石之性寒，所以能開發鬱結，使氣液宣通，熱散而愈也。”忌汗，因為病不在表而在裏：確無發汗之理，而究竟忌補與否，此中有瓣杏的問題，要根據病人的具體情況而定，下麵舉1個病例來說明。
舉例案：
姓名張×，男，47歲，幹部，住院病曆號3750。
患者於1982年7月15日，突然右腹部疼痛，未經治療而緩解，之後常反複發作，曾在平穀縣某醫院住院治療，經腎盂造影，診斷為“右側輸尿管結石”於l982年8月31日轉入我院中醫病房住院治療。
入院後拍X光片：示第四、第五腰椎右側可見0．5×0．5厘米大小密度增高陰影；腎盂造影，右側腎盂輕度積水。
病人納食一般，大便腹，小便順，腰腹疼痛不甚明顯。舌苔白，舌質紅，脈沉細。
診斷：石淋(西醫診斷：泌尿係結石)。當時主管大夫瓣杏為濕熱久蓄膀胱、煎煉尿液為石，給予清熱利濕排石通淋。
處方：金錢草30克，海金砂20克，車前子3Q克，枳殼l0克，雞內金l5克，滑石20克，扁蓄l5克，瞿麥l5克，丹參30克，雙花l0克，生龍、牡各30克，海浮石15克。並用金錢草每日40克，代茶飲。
服上方9劑後，於l982年9月9日X光拍腹部平片複查，結石與入院時相比下降l．5厘米。仍服上方每日1劑，合金錢草代茶飲。1982年9月17日、23日兩次X光腹部平片複查：右側輸尿管結石，無下降趨勢，仍在第五腰稚與腰骶之間。
1982年9月25日查房時主管醫師邀看患者，見患者麵色黃白，白汗不斷，便腹日行5次，舌淡紅，苔白根膩l，脈沉軟。此乃氣虛失運，外則衛陽不固，內則氣化不利，腎氣不得主二陰，而致濕熱之邪鬱滯下焦，久而煎灼結為砂石窒塞，因囑加用益氣之治，與前方交替服用，每三劑一更換。
處方：生黃芪30克，黨參l5克，炒白術l0克，雲苓l0克，炙甘草6克，懷牛膝10克，當歸l0克，豬苓l0克，升麻3克。
兩方各服3劑後，X光拍片：結石已進入管盆。位於輸尿管末端。白汗漸斂，後者曾感覺尿道刺痛。尿頻或夾血絲，此係結石進入膀胱時，刺傷血管而來，為求消石，囑患者白備胡桃仁、香油、紅糖各l斤(500克，)，搗和．共熬成膏，分作4天服完．連服二料後於l0月20日、23日兩次X光拍片均未見結石而痊愈出院。上述病案，從不同方麵肯定了石淋的治法，例一是用清利濕熱，排石通淋原則收效的，例二是用補氣藥、補腎藥起到作用的。通過這兩案的治療效果，使我們體會到瓣杏的重要性，通過患者所表現的臨床症狀抓住病因病機中邪正虛實的變化，才能機圓法活。
形成本病的“腎虛、膀胱熱”這一矛盾，已說明存在正虛邪實情況，邪實是濕熱煎結而成的砂石，正虛是腎不足以主二陰。初病多邪實，治療重點在蕩滌濕熱砂石方麵，“五淋病，皆熱結”(陳修圓)，“諸淋皆屬於熱”(樓全善)，以及《素問玄機原病式》中提到的冷淋之治，均是針對初期症情的，也是必需忌用補氣之藥之時，這就是第一個患者所處的情況，此時如用補氣之藥，自然要“氣得補而愈脹”、“熱得補而愈盛”，甚至可以“窒塞其間，令人悶絕”；久病則正虛，就不能濾子忌補之說，要根據患者所現的腎虛氣虛等不同虛證用藥，撩景嶽說：“淋囂初病，則無不由乎熱劇，淋久不止，及痛澀皆去而膏液不已，淋則白濁者，此惟中氣下陷及命門不固之證也。”這是概括了本病的全麵變化而言的，張路玉也提到氣虛、勞倦、思慮傷脾等能引起淋病，這種情況就是例二患者的情況，開始隻用排石清濕熱，就沒有加用補氣益腎藥後的效果好，關鍵是在於通過扶助正氣，恢複腎主二陰的功能，增強下焦氣化而促進機體排石消右的作川。