基本情況1999年全市有各級各類衛生機構5990個，比上年增加267個，增長率4.679%；其中醫院686個，同比增加10個，增長率1.48%。床位總數69465張，同比增加370張，增長率0.54%；其中醫院床位67684個，增加730張，增長率1.09%；全市平均每千人口擁有醫院床位6.15張，增長率0.33%。衛生人員總數161823人，比上年減少786人，增長率其中衛生技術人員116597人，比上年增長621人，增長率0.549%平均每千人口擁有衛生技術人員10.60人。
1999年北京市人口總數1099.80萬人，出生率5.739%死亡率5.73%。
全年診療7085.65萬人次，其中門診6431.68萬人次，急診396.70萬人次，住院77.85萬人次，出院78.12萬人次。
衛生防病和醫療保陣圓滿完成國慶50周年和迎接澳門回歸等重大慶典活動的衛生防病和醫療急救保障任務。為確保國慶衛生防病工作不出意外，在全市衛生防病任務十分艱巨的情況下，調動全市衛生防疫隊伍，針對慶祝活動的每個環節，嚴密部署，製定了《國慶活動衛生防病工作要求》，對國慶活動各有關單位的食品、飲用水的供應方式、供應品種、衛生管理以及傳染病的防治、疫情的報告和處理原則等做了細致、周密的安排，做到了“認識到位、領導到位、目標到位、人員到位”，先後對500餘家供應食品、飲用水的集體食堂和生產經營單位進行了衛生監督檢查，對3400餘名食品從業人員進行了健康體檢和食品衛生知識培訓，對天安門城樓地區和天安門廣場主題燈箱進行了2次消毒、殺蟲、滅鼠工作，投放藥品560公斤，粘鼠板300餘塊。經過數月的不懈努力，確保了國慶活動衛生防病工作萬無一失，國慶期間未發生大型食物中毒、嚴重水汙染和傳染病爆發流行。
本局召開了“首都衛生係統國慶50周年活動醫療救護保障工作誓師動員大會”，對醫療保障工作精心計劃、周密安排，並提出了具體的工作要求，各醫院都選派了政治可靠、業務精湛、身體健康的優秀醫務人員承擔醫療救護保障工作，同時，配備了性能良好的醫療儀器設備和急救車，以及數量充足、種類齊全的藥品。本著“誰主管誰負責”的原則，逐級落實責任製，並與各醫院簽訂了《首都國慶活動醫療救護安全保證責任書》。經過各方通力合作，4個月內共承擔了10次大型合練、彩排、預演和正式慶祝活動的醫療救護保障任務。累計派出232個醫療點、1624名醫務人員，共救治患者4890人，轉入醫院繼續治療患者29人，沒有發生一起醫療意外事故，為國慶各項活動的順利進行起到了保駕護航的作用，受到了國慶後勤保障指揮部的表彰。
本局還承擔了國慶衛生方陣1400人的群眾遊行任務。醫學院校的廣大師生組成遊行隊伍，頂烈日、冒酷暑進行訓練，發揚流血流汗不流淚、掉皮掉肉不掉隊的精神，克服了諸多困難，出色地完成了國慶遊行任務，向全國乃至全世界展示了首都醫務工作者良好的精神風貌。
預防保健堅持預防為主方針，重點加強腸道傳染病的監測，傳染病總發病率下降了13.44%。其中急性腸道感染的發病數下降了61.3%；患者人數和帶菌者下降了21.3%。加強性病、艾滋病以及血源傳染的預防措施。計劃免疫接種率已多年保持在95%以上，連續15年未出現脊灰野毒株病例，相關的麻疹、百日咳、白喉、肺結核及乙肝病例也保持在較低的發病水平。製訂《北京市流動兒童計免工作實施方案（試行）》和《外地來京人員衛生防疫管理規定》，使外地流動人口的計劃免疫工作逐步得到加強。針對1998年北京流感疫情，1999年對易感人群進行了疫苗注射，流感發病率比上年下降貨.1%。按照《北京市2000年消除碘缺乏病規劃綱要》，定期對鹽庫、零售單位和居民戶的食鹽進行常規定量監測工作。繼續貫徹《中華人民共和國食品衛生法》，全市共監督檢查各類食品生產經營單位397397戶次，與去年同期相比，上升19.8%合格率為83.4%；抽樣檢驗各類食品75322件，合格率為90.4%，與去年同期相比上升3.3%。加強對中小型餐飲業的管理，對全市16300戶小型餐飲店逐一進行了檢查整頓和複驗換證，對未達標準的餐飲店注銷了衛生許可證，使我市的中小餐飲業衛生狀況有了一個根本的轉變。為遏製送餐業引起的食物中毒，我們對送餐單位進行了拉網式大檢查，對檢查不合格的10個企業分別給予取消送餐資格、停業整頓和罰款的處罰。同時狠抓學校食品衛生工作和抽查的力度，對2552所學校進行了檢查，保證了學生飲食衛生安全。加強對自來水廠、單位、自備水源和高層建築二次供水設備的監督管理，監督覆蓋率均達到100%。