迎檢及重大政治活動的衛生防病保障工作。在為迎接第四次全國城市衛生檢查、迎接建國50周年、迎澳門回歸等大型活動中，完成了各項衛生防病保障任華，沒有發生食物中毒、傳染病暴發和飲水汙染事故。在“迎國檢”中，朝陽區衛生局榮獲“迎國檢優秀組織獎”，防疫站榮獲“組織獎”。
婦幼保健婦女保健。孕產婦6235人，建冊6186人，建冊率5.2%。全年活產兒6247人，新生兒訪視率93.4%。圍產兒死亡52人，死亡率8.39%。無孕產婦死亡。全區有產科床位268張，母嬰同室床位占產科總床位的100%。住院期間母乳喂養率95.4%；0~4個月母乳喂養率5%，比上年提高了1.6%。16所醫院監測7958例圍產兒，出生缺陷發生78例，發生率9.8%。新生兒疾病篩查8467例，送檢率為9%，疾病發生率3.57萬。
兒童保健。全區有0~6歲兒童50186人，管理托幼園所203個，入托兒童31161人。有68個園所發生傳染病，發病374例，其中有2所發生暴發，暴發59例，病種以水痘為主。對53942名兒童進行係統管理，對2711名兒童進行生長監測。全年兒童體檢51231人，受檢率93.27%。嬰兒死亡59人，死亡率9.3%；5歲以下兒童死亡65人，死亡率10.2%。年內婦幼保健院為202個園所的47供名保教人員進行體檢，體檢率98.1%。兒童保健係統管理工作被評為北京市第三名，孕產婦係統管理工作被評為北京市第五名。
生殖保健。年內對19967人進行婚前醫學檢查，婚前檢查率99%。查出婚育疾病患者1134人，暫緩結婚2人，不宜生育3人。
全年全區做各項計劃生育手術65073例，其中放環8598例，取環6450例，輸卵管結紮106例，人工流產21071例，引產1287例，藥物流產27257例，皮下埋植304例，並發症發生率3.17/萬。全區開展計劃生育技術服務單位68所，有專業技術人員298名。全區從事助產技術服務的單位17所，人員389名。朝陽區衛生局計劃生育工作被區計生委評為標準化管理一級達標單位。
醫療工作全年完成門診1710743人次，急診237525人次，急救126964人次，危重症搶救609人次，區級醫院門診、病房搶救成功率分別為79.64%和79.879%。住院7243人次，出院7296人次，區級醫院病床使用率63.13%，周轉次數12.71次年，治愈率51.17%，好轉率41.35%，死亡率4.13%。住院病人7日確診率為86.61%，出人院診斷符合率弨.86%，臨床與病理診斷符合率98.79%，術後死亡率0.16%，手術前後診斷符合率90.1%。無菌手術化膿率0.18%，院內感染發生率2.23%。全年完成高考體檢5268人，征兵體檢1059人，為國慶50周年閱兵女民兵方陣500人體檢；辦理就近醫療1459人，辦離休幹部優診卡2175人；處理醫療糾紛64起，答複來信9封；組織醫療事故技術鑒定28起，其中2起定為三級醫療技術事故，有7起上訴北京市衛生局複議。完成轄區內105家新設、補注冊醫療機構的實地驗收、注冊工作。為31家醫療機構變更手續。舉辦醫療機構法人（負責人）4期402人參加的《中華人民共和國執業醫師法》培訓班。組織全區9826名醫師進行醫師法考試，及格率為99.579%。完成轄區內執業醫師983名考試報名、資格審核和實踐技能考試工作。
醫院等級評審工作。年內金盞衛生院被評為一級甲等衛生院，常營回民醫院被評為一級合格醫院，南區口腔醫院被評為一級甲等醫院。
醫政監督執法工作。加大了醫政監督、管理和執法力度。年內抽查31個醫療機構，並對28個醫療機構的78個協作科室進行了審核、清理。取締了窪裏、立水橋、羊坊等19個地區的無證行醫窩點57家，出動人員70人次，車輛14台次，沒收大量假藥等物品。全年罰沒款35410.10元。年初對北京龍頭房地產開發有限公司未經批準擅自擴大診療項目，違法任用日籍非衛生技術人員從事醫療衛生工作的違法行為作出行政處罰決定，該公司不服，上訴至朝陽區人民法院及市第二中級人民法院，長達9個月的一審、二審，以本局勝訴告終。這是自《醫療機構管理條例》和《外國醫師來華短期行醫暫行管理辦法》頒布以來，全國第一例因任用未在中國取得行醫資格的外籍醫師而引發的行政訴訟案。
醫療聯合體。全區共有民、社辦醫療機構168家，其中醫院23家，門診部12家，診所133家。有醫務人員1669人。全年門診315543人次，開設病床849張，收治病人3977人次。
獻血工作。全區完成獻血27705瓶，全部實現無償獻血。朝陽區衛生係統85人無償獻血，榮獲北京市無償獻血先進單位。
精神文明建設。在衛生係統幹部、職工中開展鄧小平理論、愛國主義、社會公德、職業道德、家庭美德等教育。圍繞以病人為中心，在18所醫院開展了全程優質服務創建活動；在全係統開展了“創建文明示範崗”、“青年文明號”、“青年崗位能手”活動，區二院婦產科被評為市級“中國文明示範崗”；中醫院骨外科榮獲市級“青年文明號”稱號，防疫站市場科、安華醫院病房組、區二院婦產科病房榮獲區級“青年文明號”稱號；蔡連君等18人被評為區級崗位能手；鄭桂榮等10人被評為區級“十佳”醫務工作者；太陽宮等5家醫院被評為市級行業規範化服務達標單位；三裏屯醫院被評為北京市衛生係統先進集體，馬克敏等23人被評為北京市衛生係統先進個人；垂楊柳醫院等7家被評為區級精神文明單位；勁鬆醫院被評為市級精神文明單位；社區衛生服務工作被評為朝陽區宣傳戰線十件大事之一；寶群堯獲得第一屆“首都精神文明獎”榮譽稱號。全係統全年為病人辦實事1294件；拒收紅包169人次，其中上交紅包19人次，合計13934元；收表揚信367封，錦旗、牌匾、鏡框76件。年內開展“8所城鄉醫院手拉手”共建活動。
醫療設備。全年衛生係統醫療設備總投資1444萬元，其中市財政撥款240萬元，區財政撥款1204萬元。專用醫療儀器、設備1584台（件）價值總金額8160.21萬元。
護理工作。區屬醫療機構有床位1470張，護理人員983人，其中副主任護師11人，主管護師137人，護師508人，護士327人。大學本科學曆1人，大學專科學曆104人，中專學曆856人，無專業學曆22人。383名護士參加全國護士執業考試，合格301人，合格率90.1%。為64個單位358名護士辦理首次護士執業注冊，發放執業證書。年內有6918名護士持有護士執業證書。為轄區66個單位330名護士辦理參加2000年全國護士執業考試的報名工作。