召開73個單位109名護士長參加的護理工作會議；舉辦護士長工作手冊和護理業務查房記錄展評活動；組織42個單位90多名護士長參加的紀念“512”國際護士節活動；組織23個單位27名護理部主任、總護士長和手術室護士長參加市衛生局舉辦的手術室護士長管理研討會；舉辦62個單位115名主管護理工作的業務院長、護士長參加的護理管理研討學習班；舉辦52個單位94名護士長參加整體護理培訓班；組織6所醫院10名院感專、兼職人員和護理部主任參觀煤炭總醫院醫院感染管理工作；組織5所區級醫院10名院感專職人員和護理部主任參加中美院感控製學習班；組織29所一級醫院院長參加市衛生局舉辦的北京地區醫院感染管理院長研修班。全年外出參觀、培訓、進修學習173人次。護理論文參加國內交流8篇，刊物發表9篇。
藥政管理全區有藥品經營企業181家，其中年內新開辦32家。有批發兼零售企業29家；零售企業152家。有97家醫院2630人申報麻醉藥品使用醫師資格培訓，1690人參加培訓考核，1628人取得麻醉醫師處方權資格證書。藥品質量監測，全區完成藥品檢驗1247件，抽檢122件，不合格11件，抽檢不合格率9.02%；送檢1125件，不合格20件，送檢不合格率1.78%；認定中藥飲片3件，不合格1件，不合格率33.33%。年內對全區醫、藥單位現存藥品進行清查，查出存有過期失效藥品及超過生產日期5年以上藥品的單位共68家，藥品批次數為2322次，總金額約124萬元。對這些過期藥品控封存，將集中統一銷毀。全年立案查處違法案件21起，罰沒款303459.45元，收繳假劣藥品折價101359.30元。
醫學教育有46人進人“1050人才培訓工程”。全年25個繼續教育基地承擔區審批的繼續教育項目308項，培訓37030人次。舉辦各種類型培訓班16期，培訓1011人次。為社區衛生服務培養全科人才，舉辦全科醫師培訓班2期236人；舉辦社區護理培訓班1期85人。學曆教育243人，其中研究生5人，本科22人，大專216人。畢業78人，其中大專75人，本科3人。參加護理、中醫、中藥專業自學高考129人。年內繼續教育完成25學分2641人，占在崗衛技人員總數的1%。組織鄉村醫生資格考試58人，及格40人，辦理資格證書40個，中專水平證書8個。區衛校招幼教保健1個班40人，護士2個班71人，鄉醫1個班26人。畢業護士40人，醫務文秘40人，社區醫士121人。全年科教經費支出107.7萬元。區衛生局年內通過北京市繼續醫學教育和北京市鄉村醫生正規化、係統化中等醫學教育評估。被市衛生局評為繼續醫學教育先進單位。區中醫醫院接收實習生236人，接收來自美國、德國、瑞士等8個國家和地區的留學生38人實習。
科研工作1999年獲區科技進步獎10項，95篇論文在雜誌上發表或在學術會上交流。評出“衛生局優秀論文基金獎”21篇，其中一等獎2篇，二等獎7篇，三等獎12篇。引進先進醫療技術14項。醫學會全年組織學術講座108場次，18000人次參加。義診4次，600人次參加。
紅十字會全區有紅十字會員50000人。年內舉辦5期中小學衛生老師急救員培訓班，150人參加；有13名老師參加市會救護師資培訓班；各街鄉紅會舉辦衛生救護培訓班31期2000人參加；全區有25名持證師資，238名持證急救員。年內為平山遭受洪災群眾募集10萬元人民幣，25.5噸糧食，價值3萬元藥品，1萬餘元衣被，總價值22萬元。
2個街道為台灣災民捐款9955.50元。三裏屯醫院的20位醫護人員和衛生係統的23名共青團員，赴西柏坡開展向老區人民獻愛心係列活動，義診245人次，免費提供價值300元的藥品，為西柏坡通家口希望小學捐贈價值5000元的學習用品及圖書，為敬老院10位孤老送去價值1000元的生活用品和食品。全年開展夏（冬）令營4次，參加活動700人次。開展社會公益活動500次，20000人次參加。開展社會服務活動150次，8000人次參加。年內區會上朝陽有線新聞10次，向朝陽報、北京紅會、中國紅會、北京日報投稿34篇，區會出《紅十字之音》4期，綜合信息4期。年內接待來自國際聯合會東亞、東南亞15國組成的40人訪華團，參觀左家莊、團結湖街道的紅十字會。
計劃財務衛生事業上級撥款3587.22萬元，事業費支出3587.22萬元；差額補助費支出1592.40萬元；業務收入33782萬元，業務支出31593萬元。固定資產總額19335萬元。
公費醫療管理。全區享受公費醫療單位604個，享受人數70178人。全年公費醫療經費支出7953萬元，比上年的7682萬元增加了271萬元，上升幅度為0。全區年人均開支1165元，上升幅度20%。其中區屬單位享受人數43211人，年人均開支1675元，比上年增加277.09元，上升幅度20%。年初駐區的市級享受公費醫療單位66個16837人交市公費醫療辦公室統一管理。堅持實行“總量控製，結構調整”，繼續實行公費醫療經費由醫院統一管理的辦法。加強對大病支出的管理，聘請公費醫療檢查監督員3名。
年內舉辦了2期150人參加的公費醫療管理幹部培訓班。公費醫療辦公室投入40餘萬元，對區38家承擔公費醫療管理任務的醫療單位計算機進行更新換代。7月19日，區公費醫療辦公室歸屬朝陽區勞動和社會保障局。
基本建設全年竣工項目5個，總建築麵積16282平方米，總投資約1884萬元。其中垡頭17號樓、18號樓醫院及宿舍工程8622平方米；來廣營醫院遷建1830平方米；翻擴建雙橋醫院300平方米；和平醫院門診樓改造2460平方米，平房翻建1770平方米；豆各莊衛生院改造工程1300平方米。
全年在建項目6個，其中區二院傳染病樓擴建工程2200平方米，區中醫醫院加層工程882平方米，勁鬆醫院擴建工程830平方米，管莊醫院加層840平方米，孫河醫院翻建450平方米，黃港醫院遷建工程2700平方米。
完成區防病保健中心工程23600平方米、六裏屯綜合醫院12200平方米部分前期工作，並領取到規劃許可證。完成左家莊等7個單位汙水改造工程，共投資126萬元。完成婦幼保健院等6個單位的煤改氣工程，投資140萬元。對雙橋等6個單位進行房屋維修，共投資8.3萬元。完成垡頭宿舍新房分配、二輪房調配，出售新房122套。年內朝陽區衛生局榮獲市計委、市財政局、市衛生局頒發的“北京市三項建設”工作一等獎。