在“科技、文化、衛生”三下鄉活動中，派遣優秀醫護人員參加醫療下鄉和青年誌願等醫療扶貧活動；多次奔赴老少邊窮地區，如前往國家級貧困縣內蒙古寧城地區，為當地群眾開展義診、診治疾病等；多次開動“眼科防盲手術車”到郊區開展手術，受到群眾歡迎。在麵向社會進行健康教育方麵，派出醫護人員320人次，舉辦各種義診、谘詢活動19次，接待群眾近5000人次。利用“愛眼日”的有利時機，進行大規模的眼保健知識宣傳，產生了廣泛的影響。
護理工作開展整體護理近4年來，深入貫徹以病人為中心的服務方針，堅持按照三級甲等醫院的標準嚴格管理，強化主動的服務意識，重視臨床操作技能培訓，重視護士隊伍的繼續教育工作，形成了努力工作、勤奮學習的良好風氣，有效地提高了醫療護理質量。本年度，在規範化服務達標、爭創全國百佳醫院、城市衛生綜合檢查等係列活動中，醫院護理工作通過嚴格評比，受到同行和上級機關的好評，病人滿意率達到99.149。
科研工作科研立項13項（其中國家級1項、部級2項、市級2項、局級8項共獲經費48.5萬元；申報科技成果20項，經初評被推薦市科技進步獎I4項（其中特等獎1項、一等獎1項、二等獎1項、三等獎11項全年投寄學術論文426篇，公開發表261篇；參加全國或地方性學術會議162人次。作為北京市高科技實驗室的“北京眼耳鼻咽喉疾病研究中心”通過了專家論證，該研究中心共獲得1300萬元的資金支持（其中市科委700萬元、市衛生局200萬元、醫院400萬元）另外，眼、耳鼻咽喉學科和內科糖尿病專業及麻醉科也獲得了共185萬元的資金資助。
醫學教育有計劃地培養各學科帶頭人和專業技術骨幹，鼓勵和支持年輕人報考研究生，研究生人數逐年增加，目前，在讀人數61人，畢業23人。醫院所承擔的首都醫科大學醫學四係的臨床教學任務，成績顯著，在首醫大係統本科生統考中，連續第六年獲得第一，在北京市衛生係統醫學繼續教育評估中獲得優秀成績。
全年職工外出進修、學習719人次；接收進修人員136人（其中本市31人，外省市105人
國際交流積極開展對外交流，努力尋求合作機會，通過各種渠道積極創造條件，有計劃地輸送中青年醫護人員到國外進修學習，加快人才培養，是本年度醫院外事工作的重點。1999年醫院公派出國55人次（其中考察訪問10人次、參加國際會議26人次、進修培訓15人次、其他4人次全年接待參觀訪問的外賓30批454人次，著重在眼科、耳葬咽喉科和社區醫療等領域進行了深入交流；協助衛生部國際交流中心舉辦了有600多名國內外專家出席的“國際防盲會議”；此外，醫院長期與中國中醫研究院、針灸研究所合作，承擔外賓及台灣同胞的針灸教學任務，共接待來自英、美、法、日、德等國家和地區的72位學員來醫院針灸科實習。
體製改革與管理醫院作為北京市衛生局人事製度改革第二批試點單位之一，年內進行了如下改革：強化編製管理、調整機構、精簡幹部、嚴格考核、層層聘任、改革分配製度、規範分配行為等。改革使醫院逐步形成能上能下、競爭上崗、多勞多得的新機製。
深入開展管理研究，努力建立以病人為中心、富有生機的新的管理體製和運行機製。為了不斷提高管理者的能力和水平，年內先後組織三批近20人次到外省市醫院進行關於機構人事製度改革、後勤管理社會化、科研管理體製、人才培養、分配製度等方麵的學習、考察，分別撰寫了考察報告。召開了醫院中層以上幹部參加的第13次改革研討會，對醫院下一步的改革進行了更深入、更有針對性的討論。先後派管理人員參加市、全國培訓班或學術會議30餘人次。年內完成管理論文近30篇，其中參加國際和全國性會議交流10篇，在國家級刊物上發表4篇。
後勤與基建後勤部門緊緊圍繞醫院中心工作、努力增強為醫院一線服務的思想意識，年內圓滿完成了高壓配電室增容改造任務，在近50年罕見的連續高達40丈以上高溫天氣下，後勤職工發揚連續作戰的精神，短時間內安裝空調191台，為酷暑中的患者送去了清涼。為探索後勤改革新路，醫院在職工食堂實行了承包製，引人競爭機製，工作人員積極性大大提高，飯菜種類達30多種，確實改善了職工生活。
近年來，為了改善醫療環境，醫院已投資3300萬元。年內又騰空、改造兩層行政辦公樓，建立了連接三樓眼科門診的“連廊”，為眼科增加了1500平米的醫療用房，這對於規範就醫流程、緩解病人看病難、提高醫院競爭力起到了積極作用。
1999年是治安保衛任務最繁重的一年。消防工作又是保衛工作的重點，保衛部門進一步完善各項製度，加強消防設施建設，重視常規安全檢查，確保了醫院的安全運行。在建國50周年慶典活動期間，保衛部門克服了醫院地理位置特殊、治安環境差等治安管理方麵的困難，出色完成了安全保衛任務，被北京市公安局授予集體三等功。
精神文明建設堅持思想政治工作常抓不懈。根據不同崗位，深入進行職業道德、紀律、責任教育，舉辦禮儀培訓和心理學講座，將規範化服務教育作為新職工崗前教育的重要內容，結合《醫師法》的出台，舉辦《醫師法》講座及知識答卷，使職工進一步明確作為一名醫務工作者的責任。繼續開展規範化服務達標工作，多次組織各種有意義的參觀展覽，以強化職工立足本職、優質服務的思想。工會在加強民主管理、關心職工生活、維護職工權益等方麵，發揮了其紐帶和支柱作用。共青團工作也開展得有聲有色，院團委連年榮獲市級和局級“紅旗團委”稱號。
1999年醫院榮獲全國百佳醫院稱號0997—1998年度被評為全國民族團結進步模範單位；連續第二年被評為全國模範職工之家；連續第13次完成無償獻血任務；被確定為北京市規範化服務達標示範單位。此外醫院的人事、財務、設備管理和監察、審計、大病統籌公費醫療管理、離退休、計劃生育等各項工作均取得新成績，醫院連續第7年被評為“首都文明單位”。