5月
開展甲流防控和醫療救治。市、區兩級衛生行政部門對892家醫療衛生機構進行了督導檢查。4日，北京市公共衛生信息中心研發甲流患者信息上報軟件並上線。12日，副局長鄧小虹帶領疾病控製、醫院感染、醫療救治、應急管理等方麵的專家對崇文區防控甲流工作進行了督導檢查。13日，醫療組組長鄧小虹和副組長李又勇帶領市疾控中心、醫院感染管理、衛生監督等部門的專家到海澱區衛生局、疾控中心、甘家口社區服務中心和武警總醫院，就甲流防控和醫療救治等進行督導檢查。14日，召開北京市甲流防控工作會議。15日，衛生部就宣貫《甲型H1N1流感診療方案（2009年試行版第一版）》、甲流臨床救治和《甲型H1N1流感醫院感染控製技術指南（試行）》召開電視電話培訓會議。16日，醫療組對甲流患者信息上報係統進行了調整。19日，市衛生局聯合總後衛生部醫療局，組織醫院感染、衛生監督等方麵的專家，對解放軍306醫院和309醫院甲流防控和醫療救治工作進行檢查。22日，醫政處緊急部署120、999隨時準備為上述人員提供轉運服務。
市衛生局對全係統“小金庫”組織自查自糾，成立了由黨組書記、局長方來英任組長的治理“小金庫”工作領導小組，領導小組辦公室設在財務處。市中醫局製成免煎衝劑和中藥香囊，免費發放給社區居民和海關檢疫局、國門路大飯店、市政府、市人大、市政協等部門。
市衛生局婦社處與市人大、市政府法製辦有關人員到西城區、房山區、通州區社區衛生服務機構進行社區衛生服務立法調研。
市衛生局舉辦鄉醫大課堂。5月15日，第一期鄉醫大課堂在順義區舉辦，215人參加。鄉醫大課堂還將在昌平、大興、海澱、房山等地陸續舉辦。市衛生局與世界肺健基金會合作，啟動了北京煙草控製媒體傳播項目。
6月
3日
市衛生監督所召開區縣防控甲流專項工作互查布置會，18個區縣衛生局主管領導參加了會議。由各區縣衛生局主管領導帶隊、市衛生監督所聯絡員、區縣衛生監督員、疾控人員和市級院感專家組成18個檢查組，對各區縣防控甲流工作落實情況進行磨盤式檢查，查範圍主要為區縣衛生行政部門、醫療機構、疾控機構和學校、托幼機構。
4日
市中醫局召開中醫醫療服務信息網工作會，並對18個區縣的工作人員進行了專業技術培訓。市中醫局召開中醫醫療質量監測工作會。
5日
市衛生局、市教委聯合召開家庭護眼按摩操推廣啟動會。將同仁醫院專家等編製的《家庭護眼按摩操》66萬份圖解和配套培訓手冊以“小禮包”的形式發放給全市小學生及家長。
市衛生局召開18個區縣衛生局和人事局會議，部署引進畢業生到社區衛生服務機構工作。為區縣爭取了500名非北京生源指標。
副市長丁向陽主持召開“健康北京人——全民健康促進十年行動規劃”高層會議。市委宣傳部常務副部長陳啟剛，衛生部原副部長、中華預防醫學會會長王隴德，中國醫藥衛生事業發展基金會理事長王彥峰、副秘書長張青陽、部長李小峰，中國疾控中心主任王宇，市衛生局副局長趙春惠、疾控處處長趙濤，市疾控中心主任鄧瑛、副主任曾曉秡及“十年行動規劃”辦公室工作人員參加了會議。王宇介紹了當前甲流防控情況，王隴德介紹了腦卒中篩查及幹預工程，趙春惠介紹了“健康北京人——全民健康促進十年行動規劃”啟動方案。
市衛生局召開市衛生係統中、高級思想政治職稱評審、推薦會，共有23個單位的40人申報中、高級政工專業職務任職資格。經資格初審、專家論文審閱、中級論文答辯，向中級評審委員會推薦33人參加評審。中評委經過投票表決，12人通過了中級政工師的任職資格。推薦12人申報高級政工師，最終經市委組織部評審，11人獲得高級政工師任職資格。市衛生局召開“小金庫”專項治理工作會，各直屬單位主管領導、紀檢書記、財務及審計負責人和局機關各處處長270餘人參加。會議就“小金庫”治理工作的範圍、內容、步驟和政策界限以及工作要求作出了部署。
市衛生局召開集中空調工作研討會，修改《北京市集中空調公共衛生管理辦法》，製訂了4號地鐵集中空調抽檢工作方案。
8日
市中醫局召開全市二級以上中醫醫療機構院長會議，部署中醫藥防治甲流工作。
衛生部部長陳竺在副市長丁向陽、市政府副秘書長魯勇和市衛生局局長方來英等的陪同下，到燕翔飯店、佑安醫院看望和慰問接受醫學觀察和隔離的東盟實驗室監測技術培訓班學員。
10日
市中醫局聯合市衛生局、市藥監局、市科委召開首都中醫藥係統防控甲流高層研討會。
11日、18日、25日
北京衛生係統政風行風評議組組長周大齊帶領評議員與部分三級甲等綜合醫院的醫務處長、護理部主任到友誼醫院、同仁醫院、地壇醫院就市衛生局醫政處政風建設、依法履行職責、辦事效率、責任意識、服務態度、清正廉潔等情況進行了座談。
11～16日
市衛生局在各區縣檢查的基礎上對醫院感染性疾病科建設情況進行全麵複查，92家醫院感染性疾病科中布局基本合理的88家、不合理4家。
12～13日
市中醫局召開中醫醫療服務信息網工作會，並對18個區縣的工作人員進行了專業技術培訓。
14日
第六個世界獻血者日，主題是“繼續重視通過實現100％自願無償捐獻血和血液成分的目標，改善安全和充足的血液供應”。市獻血辦推出國內首部無償獻血科幻情景喜劇《獻血總動員》和《愛心之家的秘密》，並製成光盤，發放至中央單位，市、區縣屬各企事業單位，街鄉居民、獻血者手中。
16日
市衛生局啟動北京市“十百千”衛生人才培養專項經費資助工作。
17日
市衛生局、市人口計生委、首都醫科大學組建“人口衛生”方陣總隊，參加國慶60周年群眾遊行活動。“人口衛生”方陣共2323人，由首都醫科大學、北京衛生學校、北京護士學校的師生組成。
市衛生局召開北京市醫療機構藥品集中采購局級聯席會議，研究討論《2009年北京市醫療機構藥品集中采購工作方案》及目錄。
市衛生局局長方來英接待以色列施耐德兒童醫療中心代表團，就進一步加強北京與以色列在兒童醫療方麵的合作進行會談。
市衛生監督所邀請國家疾控中心、市疾控中心、清華大學、市自來水集團和相關區縣衛生監督所的專家對飲用水在線監測網絡的建設方案進行論證，並提出改進意見。
18日
衛生部醫政司委托北京民科醫療電子技術研究所研發了白內障複明手術信息報告係統，召開了白內障複明手術信息報告係統培訓視頻會議。該係統於7月1日起在全國統一使用。
市衛生局召開衛生係統局級後備幹部和優秀處級幹部民主推薦會。
18～19日
市衛生局組織18個區縣衛生局醫政科科長、11個區域醫療中心主管醫療的領導和醫務科長召開區域醫療中心建設工作主題會。市衛生局副局長鄧小虹就區域醫療中心下一步重點建設作了指示。
19日
市衛生局召開人體器官移植專項執法工作情況反饋暨監督培訓會，18個區縣衛生監督所的骨幹及協和醫院、人民醫院等10家開展人體器官移植技術的醫療機構相關主管人員參加。
市衛生局召開公共場所監督工作會議，研討公共場所甲流防控工作、遊泳場館和洗浴場所的專項整治、公共場所監督工作規範以及公共場所量化分級管理、現階段集中空調通風係統監督檢測工作程序。
22日
市衛生監督所啟動市級督查工作，重點是區縣對轄區消毒產品生產企業的監督檢查情況，深入25家企業（占全市消毒產品生產企業總數的10％）檢查衛生許可證、衛生許可批件，並根據消毒企業生產規範的要求逐一檢查其依法生產情況等。
市衛生局召開第五批援藏幹部執行第三年任務的專業技術幹部座談會。7名援藏幹部分別來自婦產醫院、友誼醫院、中醫醫院和老年醫院。
召開市甲流互聯網宣傳彙報會，副市長丁向陽、市政府副秘書長魯勇，市衛生局副局長郭積勇、趙春惠出席。
23日
市衛生局召開學科骨幹評審會，市屬18家醫院74名學科骨幹候選人參加了答辯。
23～24日
市教委、市衛生局組成聯合檢查組，對本市10所學曆教育型民辦高校的16個校區進行了衛生安全檢查。結果顯示，16個校區均建立了傳染病防控領導小組，常規開展學生管理工作，為傳染病監測提供了良好的網絡基礎。同時發現，民辦高校在傳染病防控方麵存在較大隱患，傳染病防控體係、監測體係以及傳染病登記管理均不完善。
市衛生局組織直屬單位及18個區縣開展政府采購知識培訓，並啟動了直屬單位ＧＰＡ談判調研統計工作。
24日
市衛生局委托北京市心血管疾病介入診療質量控製和改進中心舉辦全市心血管疾病介入診療病例信息報送培訓。41個醫療機構的100餘人參加了培訓。市衛生局組織北京市全科醫師崗位培訓師資培訓班，解放軍總醫院、友誼醫院、垂楊柳醫院等31個全科醫師臨床技能培訓基地的31名學員參加。