6月24日、7月4日
舉辦實驗室網絡甲流病毒基因擴展技術培訓班，市傳染病網絡實驗室成員、流感樣病例甲流病毒檢測指定實驗室共55個單位的實驗室基因擴增技術骨幹100餘人參加。
25日
市衛生局召開甲流防控網絡宣教工作會。
26日
北京報告甲流確診病例103例。當日，北京首次出現了二代病例，為北京第96例確診病例的女友。北京市全科醫師骨幹培訓班結業典禮，14個區縣的50名學員拿到結業證書。
副市長丁向陽主持召開“進一步落實防控甲流措施，確保國慶公共衛生安全，專家獻計獻策座談會”。中國醫藥衛生事業發展基金會理事長王彥峰、副秘書長張青陽、部長李小峰，市委宣傳部常務副部長陳啟剛等參加會議。
26～27日
首都預防艾滋病宣傳誌願者“1＋1”十進行動之“拒絕毒品，遠離艾滋”主題活動在18個區縣公園舉行。
市衛生局組織人事幹部和財務幹部對四川省人民醫院、成都市衛生局就醫院績效管理、收入分配等工作進行了考察。
27日
市衛生局疾控處、市疾控中心負責人與首都機場甲流防控相關單位召開工作協調會，就首都機場地區傳染病防控的協調機製、當前防控工作中麵臨的問題等進行了磋商。
29日
中國醫藥衛生事業發展基金會、市中醫局共同組織老中醫藥專家及中西醫結合專家，針對可能發生的流感大流行、中醫藥應如何作好準備進行了座談。中國醫藥衛生事業發展基金會理事長王彥峰、北京醫學會會長金大鵬、市中醫局局長趙靜等參加座談。市衛生局召開紀念建黨88周年暨表彰大會。
30日
召開北京市國慶60周年精神衛生保障工作動員會暨精神衛生工作管理培訓班。市衛生、公安、民政、財政、教育、司法、殘聯7個精神衛生工作聯席會議成員單位領導，18個區縣精神衛生工作聯席辦成員單位領導，市、區縣兩級綜合治理辦公室領導，市及區縣精神衛生保健所領導及專業人員，公安局治安係統領導及工作人員180餘人參加會議。6月
市衛生局組織醫院管理、醫療（門急診、臨床）、醫技（藥學、醫學檢驗、醫學影像、病理、輸血）、護理、院感、病案、信息、財務、物價等方麵的專家修訂《北京地區醫院管理考核評價標準實施細則》。市衛生局開展了本市重大疾病醫療保障情況調研，主要涉及嚴重危及兒童生命健康、導致患兒家庭沉重經濟負擔的兒童重特大疾病的病種和發病人數、診療費用和兒童醫療保障及其對於減輕患兒家庭負擔的作用等。
市愛衛會印製4萬份宣傳畫和50萬份宣傳品發送到各社區、各單位，並召開全市健康社區培訓會，部署社區防控甲流，對相關知識進行培訓。
市衛生規劃建設管理信息係統開始試運行。該係統設有衛生規劃、基本建設管理、醫療廢物管理、醫療衛生機構汙水處置及住房製度改革管理等5個工作子平台，同時還設計了信息交流平台。
市衛生局協調市編辦和市人力社保局等部門聯合下發了《關於為北京農村山區、半山區定向培養衛生人才的實施意見》。
市衛生局對臨床教學科研單位的臨床教學現狀、存在問題及今後的發展規劃等進行調研。
7月
1日
正式啟用《北京市社區精神衛生個人健康檔案》，提出對全市社區精防人員的培訓，社區精神病人個人健康檔案數據轉錄、複核與補充，社區精神病人信息管理網絡係統管理，督導與考核等工作要求。市衛生局召開直屬單位保衛處長會，在市衛生係統開展為期100天的消防安全“合圍攻堅行動”，消除火災事故隱患，確保國慶消防安全。
市衛生局和市教委聯合舉行新聞通報會。市衛生局局長方來英和市教委副主任鄭萼介紹了南湖中園小學發熱疫情的發現和處置情況，以及對疫情所采取的防控措施。
市衛生局聯合其他委辦局舉行了北京市康複醫院和護理院試點啟動儀式。
3日
為進一步做好北京市甲流密切接觸者集中醫學觀察工作，市衛生局副局長趙春惠，18個區縣衛生局、疾控中心領導及專業人員在國門路飯店醫學觀察點進行了現場觀摩學習。
市中醫局製訂的中醫藥臨床和實驗室中藥篩選的科研方案通過市科委組織的經費預算評審並正式立項。同時，市政府下撥1000萬元專款，用於論證中醫藥治療甲流的臨床研究和防治藥物篩選。
3～5日
北京市中醫類別醫師資格實踐技能考試，應考1757人，實考1643人，及格1197人。
6日
市中醫局召開北京市防控甲流工作會議。全市二級以上中醫、中西醫結合、民族醫院院長和各區縣衛生局有關負責人參會。
市衛生局召開各區縣衛生局、各三級醫院、各直屬單位主要領導會議。傳達市政府安全生產電視電話會議精神，通報7月3日通州區新華聯家園發生的汙水井急性中毒事故，對衛生係統安全生產工作進行再部署。
6～31日
市衛生局委托北京醫學會組織專家對17種三類技術標準、宮腔鏡診療技術管理規範等進行專題討論，並將專家意見彙總後上報衛生部。
7日
市衛生局完成《北京市衛生局關於淨化社會文化環境工作實施方案》，並上報首都精神文明建設辦公室。
8日
成立首都衛生係統人才隊伍建設中長期發展規劃課題組，並初步提出了規劃的總體框架。
8～9日
市衛生監督所召開北京衛生監督工作平台統計模塊培訓會，各區縣衛生監督所信息科室負責人、統計報告人員、平台管理員以及市衛生監督所各業務科室人員參加。
9日
第五批援藏幹部第二期專業技術幹部完成援藏任務返京。
10日
市中醫局印製《北京市民預防甲型H1N1流感中醫藥指南》30萬冊下發到城鄉居民。
市衛生局召開維穩、安全相關工作會議，直屬單位主管領導、保衛處長、總務處長及三級醫院保衛處長參加。
北京市對口支援四川省什邡市第五批醫療衛生隊啟程，執行為期3個月的醫療衛生支援任務。
12～18日
市衛生局協調東城區、海澱區衛生局完成第八次全國歸僑僑眷代表大會的公共衛生保障工作。
13日
市衛生局局長方來英在北京安貞醫院與法國衛生部醫院管理與服務總局局長安妮·波度女士就進一步加強與法國醫療機構在急救和災害醫學領域的合作進行了會談。
14日
衛生部醫政司督導組對本市甲流定點醫療機構的救治工作進行了督導。
市衛生局第六批援疆幹部第一期專業技術幹部完成援疆任務返回北京。
15日
市中醫局局長趙靜帶隊到北京佑安醫院督導中醫藥防治甲流工作。
16日
市衛生局召開“手拉手”幫帶活動工作研討會。市衛生局召開崗位管理工作交流研討會。
市愛衛辦召開北京市“全球健康合作夥伴，創建無煙醫院”項目中期階段工作交流會。
18日
市中醫局、市衛生局、中國醫藥衛生事業發展基金會、中國民間中醫醫藥研究開發協會召開“中醫刁氏正脊治療眩暈、心髒神經官能症”市級科研項目啟動儀式暨發展研討會。
20日
市衛生局召開由直屬醫院黨委書記、院長，市衛生局、市中醫局機關各處室領導參加的“院長當一天患者”座談會。局黨組副書記張秀芳主持會議。局黨組書記、局長方來英，衛生局社會監督員、第二批學習實踐活動指導檢查組組長參加會議。
市衛生局黨組召開局係統內部競爭領導幹部動員部署會，對競爭佑安醫院、回龍觀醫院、婦產醫院副院長的工作進行了部署。
21日
市衛生局副局長於魯明帶領市政府防控甲流指揮部的有關領導以及市衛生監督所、東城區衛生局、東城區衛生監督所的有關同誌前往協和醫院，對發熱門診、普通門診和急診室的體溫篩查以及實驗室等接診流程及醫療防護情況進行了檢查。
市衛生局召開“健康奧運，健康北京”媒體宣傳及2008年度衛生好新聞評選終評會。最終評選出“健康奧運，健康北京”媒體宣傳獲獎作品21件、2008年度衛生好新聞獲獎作品36件。
市中醫局啟動北京市社區中醫藥人才培養1234“回歸紮根”工程。
22日
市衛生局召開北京市醫學專業質控中心第二季度聯席會，現有的16個北京市醫療質量控製和改進中心主任及辦公室工作人員參加。
22～23日
市中醫局組織相關專家，分兩組對全市8家三級中醫醫療機構開展了醫療質量與安全暨中醫藥防治甲流督查。
23～24日
市中醫局委托北京市中醫藥對外交流與技術合作中心舉辦外事幹部培訓班，20餘個中醫機構派人參加。