其實經過這麼來來回回的幾件事，朝廷中人有的人疑心劉毅要學桓玄將來造反，有的人知道劉毅沒這個膽子，但二劉之間恐怕沒有多少和平的日子了，聽說還有人在賭二劉具體什麼翻臉的。
劉毅所有的要求都被同意後，他又上表想在去荊州上任前再去京口拜祭一下自己的祖先，這裏要說明一下的當初劉毅在倒桓的時候還在家裏服喪，原來一些該辦的儀式還沒有辦完，所以他當時還是穿著喪服參加起義的，而作為劉毅的本家並且是同鄉的劉裕也就前去倪塘（建康東南郊）親自迎接劉毅，其實這在當時來說，劉毅的行為是極不合理的，他身為一方諸候，路過京師居然不去拜見皇帝，要是說了出來也是一樁大罪。
其實在倪塘之前，劉裕的手下，也就是他如今的心腹寧遠將軍胡藩悄悄對他說，“明公認為，以劉毅的為人他會甘於居於您的麾下嗎？”劉裕聽了沉默不語，其實這個答案不說大家都明的，這是不可能的，所以劉裕就問他，“那依你之見了？”
胡藩說，“主公您統帥百萬大軍出戰，每戰必勝，在行軍打仗，排軍布陣這一方麵來說，劉毅自己也知道他是不如您的，可是論到博覽群書，吟詩作賦，他卻自認為是英雄豪傑。正因如此，那些文人雅士、白麵書生等集中他的府上，為他效命，我擔心他終將不會甘心在您之下，不如趁這次會麵的機會，幹脆除掉他。”
其實對於劉毅的處置方式，劉裕早有打算，因此對於胡藩的提議劉裕就反對：“我與劉毅都有複興國家的功勞，他現在也沒有犯什麼不可饒恕的大罪，我們也不可自相殘殺。”劉毅現在可是有些誌得意滿，卻不知道他悄悄地躲過一場生死危機。
告別劉裕諸人之後，劉毅終於起程，坐船西上江陵接任荊州刺史去了，可是到了這個時候，劉毅他還是有些不老實，他在途中經過他曾經管轄過的豫，江兩地時，就在當地的駐軍抽調了一萬人的大軍準備帶往荊州，對於朝廷來說，以前也從來沒有新刺史要從舊地調兵過去這個先例，這簡直就是赤裸裸地無視朝廷的權威，也可以說是無視了劉裕的權威。
可是結果就是劉裕再一次無視了劉毅的舉動，反正劉裕的心態就是這樣，你盡管鬧吧，你現在鬧得過份，將來和你清算時，你的罪過就越大，當然，劉毅心裏也會嘀咕兩聲，這劉裕最近沒有發瘋吧？我記得自己好像和他合不來的。
三個月後，也就是義熙八年（注：公元412年）閏六月一日，也就是在劉毅到荊州上任之後的第三個月，原來的荊州刺史，現任的豫州刺史劉道規不幸病逝，年僅四十三歲，算得上是英年早逝，要知道劉裕都比劉道規要大，也是打了多年的仗，現在卻沒有絲毫的問題，有人說是劉道規開始接任荊州這個爛攤子時，耗盡心力，才會導致他早死。
當然，劉道規的病逝對於劉裕來說來說，是一個不可估量的損失，畢竟，劉裕本身的宗族兄弟便不多，親兄弟也就兩人，一個是劉道規，還有一個是劉道憐，劉道憐就不說了，為人貪財卻又沒有本事，不過討好他老娘蕭文壽的本事還是不錯的，劉道規倒是劉氏家族裏除了劉裕之外的另外一個將才，也有人說如果劉道規不英年早逝，再加上後麵的劉穆之不死於劉裕的前麵，說不定劉裕就會完成前無古人的由南方統一北方的壯舉，不過這總歸隻是推測，當不得真。
正好這時，上任不久的荊州刺史劉毅在荊州全境裏麵大肆折騰了一番，把他從豫州裏帶出來的文武吏員安排到荊州的各個崗位上，雖然說一朝天子一朝臣，可是劉毅的吃相也太難看了，三個月之內他手下的佐吏便全部換人了，惹得江陵城中怨聲載道。
大概是在人員調換完了之後，劉毅水土不服，又生病了。要說劉毅就這樣死去也可成為一個史書傳頌的忠義之臣，可是從他後來大軍攻城之時，還能指揮作戰來看，恐怕他這次的生病又是一個幌子。
嗯，先不管他是不是幌子，反正劉毅病了之後，他自覺不能處理政事，便上書給朝廷，希望派自己的堂弟兗州刺史劉蕃來幫著自己處理荊州的政務。