清軍走後不久，沙俄侵略者卷土重來，又重新占領了雅克薩，侵略軍頭目托爾布津也重返這裏，並指揮俄軍又一次築起土城，繼續與我國為敵。
薩布素得知這一消息，決定再次發兵攻打雅克薩。他根據雅克薩靠江的地形特點，派兵在不靠江的三麵挖掘戰壕，築起堡壘長圍。又修造兵船駛往雅克薩江麵，形成四麵包圍之勢。然後從四麵同時猛烈攻城，把守城的七百多俄國侵略軍打死了六百多人，俄軍頭目托爾布津也在這次戰鬥中喪了命。沙俄政府見侵略中國的企圖無法得逞，隻好接受清朝政府提出的通過談判解決中俄邊界問題的建議，沙俄派出使者到中國要求談判議定邊界，並請求清軍不再圍攻雅克薩城。清朝政府同意進行談判，並下令解除雅克薩之圍，讓那一百多個幸存的沙俄兵活著撤了回去。
當時，在中國西部的蒙古族部落準噶爾的首領噶爾丹，一再勾結沙俄發動叛亂，成為一大禍患。薩布素為了安邊衛國，提出一係列防禦叛亂的計劃和措施，得到清朝政府同意。1696年，康熙皇帝親自出征，要徹底平定噶爾丹的叛亂，解除邊界威脅。他命令薩布素統率一部分兵卒從東路出發，配合他的主力部隊打擊噶爾丹叛兵。在幾路人馬合力圍殲下，噶爾丹的叛亂終於基本平息，使西北邊境重獲安寧。
薩布素不僅長於武功，而且重視教育。他首先倡導在墨爾根（今黑龍江嫩江）建立學校，招收各民族兒童入學，培養有知識的人才。他頑強抵抗侵略者的愛國思想行為，一直受到廣大軍民的讚揚。
簡評：
薩布素其子常德在寧安城南月牙河旁為其父安葬一座“衣冠塚”，並立石碑紀念。當地百姓稱“衣冠塚”謂“將軍墳”。該紀念碑，已經寧安縣文物管理部門移至渤海故宮博物館（今渤海鎮興隆寺前廣場）供旅遊人們瞻仰參觀，前往遊人絡繹不絕，人們懷著崇敬的心情，緬懷薩布素將軍的一生是當之無愧的，讓一代抗俄民族英雄的業績，永垂青史。愛國詩人吳兆騫更作《奉贈副帥薩公》，說盡薩布素豐功功績：
彤樨詔下拜輕車，千裏雄藩獨建牙；
共道伏波能許國，應如驃騎不為家；
星門晝靜無峰火，雪海風清有戌茄；
獨臂秋鷹飛控出，指揮萬馬獵平沙。