司馬遷的出生地在哪兒呢？他自己說“遷生龍門”。龍門在哪兒？在黃河邊今天的陝西省韓城市以北。大家知道，黃河發源於青藏高原，流經今天的甘肅、寧夏等省，形成富庶的河套地區。然後向南流，成為山西、陝西兩省的界河。在黃河流下太行山之前，遇到了一塊衝不過去的阻礙，這就是龍門山。據傳說，當年大禹治水時，將龍門山劈開，一分為二，黃河之水才能通過，這個地方就叫做“龍門”，黃河從此地通過後，就豁然奔放，滔滔不絕。但魚類仍舊為龍門所阻，隻有少數能跳過龍門。俗傳跳過去的就成了龍，跳不過去的依舊是魚。後世將登上高位的人也比喻為“登龍門”。“龍門”這個詞太響亮了。由於司馬遷出生此地，後人直接稱他為“龍門”。
既然有人用其出生地“龍門”來稱呼司馬遷，就把司馬遷和神秘的動物——龍聯係起來了。司馬遷是否以龍種自居，或者相信龍這種神物的存在呢？要回答這個問題，首先要了解龍是什麼。
司馬遷的時代還沒有現代的宗教，印度的佛教尚未傳入中國，中國本土宗教道教的創始人張道陵還未出生，西方基督教的創始人耶穌也沒有降世。當時人們信仰和崇拜什麼大神呢？
秦漢時代人們首先崇拜山嶽，因為山高接天，可通天神，他們把境內的四座高山稱作四嶽，當作天神來崇拜。泰山就被稱為東嶽，即東方最高的山。秦始皇祭祀泰山和上山封禪就是山嶽崇拜的表現。漢武帝也登泰山和封禪，同樣繼承了山嶽崇拜的傳統。此外，秦始皇和漢武帝都曾祭祀天下的名山大川，而且祭祀八位大神：天神、地神、戰神、陰界神、陽界神、太陽神、月亮神、四季神。
至於龍，它的起源就更早，可能起源自原始人的“萬物有靈觀”。中國原始人早就崇拜龍了，龍是他們信奉的一種圖騰。它在自然界中沒有，是現實生活中的人經過幻想創造出來的。當時的人認為任何動物、植物，甚至非生物，如石頭，隻要成了精，就有靈性，具有超自然的力量。如：《西遊記》的主角就是一個猴精，《紅樓夢》從一塊有靈性的石頭說起。古人將鱷、蛇、蜥蜴等凶殘可怖、形色怪異的動物看成一類，對之生出神秘感和敬畏之心，從而將其神化。經過幾千年，甚至幾十萬年的幻想創造，產生了這個神秘的生物——龍。古人又將一些令人恐怖的自然現象——暴風雨時的烏雲、閃電、海潮、龍卷風、泥石流等看成是這個神物的品格體現，於是產生了龍崇拜。人們每次遭到自然災害，找不到解釋的原因，就說災害地區出了一條龍。龍是無法抵抗的自然力的形象體現。這樣一來，龍這種神物很怪：馬頭、鹿角、牛耳、兔眼、魚鱗、狗足、鷹爪、其身彎轉如蛇，姿態豐富多變。
孔子就聽說過龍的傳說，但他不太相信龍的存在。《史記》的《老子韓非列傳》中引用孔子的話說：“鳥，吾知其能飛；魚，吾知其能遊；獸，吾知其能走。走者可以為網，遊者可以為綸，飛者可以為矰。至於龍，吾不知其乘風雲而上天。”其意思是說，鳥類，我知道它們能夠飛翔；魚類，我知道它們能夠在水中遊動；獸類，我知道它們能夠攀援高山，行走如飛。行走的獸類我們可以用捕獸機捕獲，善於遊水的魚類我們可以用漁網來捕捉，善於飛翔的鳥類我們可以用弓箭來射殺。至於龍，我不知道它憑什麼本領能乘著風雲而上天。”這明顯是一種懷疑龍的存在的態度。《孔子世家》中說孔子“不語怪、力、亂、神”，說明孔子不相信超自然的力量，是一個務實主義者。