本書應用係統科學的思想和現代經濟學理論，主要采用實證研究與係統分析的研究方法。
一、係統科學思想與現代經濟學理論相結合的方法
把係統科學思想和現代經濟學理論的研究方法結合起來，以實證研究為主，規範分析與實證分析相結合，並輔之以係統分析、綜合分析的方法，探討經濟改革時期中國經濟波動問題。
二、增長周期研究法
針對經濟周期的研究方法，一種是傳統型的研究方法，即把經濟周期看做是經濟活動擴張和收縮、偏離平衡的一個過程，通過對各階段波穀波峰的劃分來進行研究。另一種是現代型的研究方法，即把經濟周期看做是圍繞經濟增長趨勢的經濟波動，認為經濟運行具有不同的狀態，分為增長周期與古典周期，研究一種狀態向另一種狀態運動的可能性，或是研究兩種狀態的關係。
本書主要應用增長周期方法研究經濟改革時期中國經濟波動問題。
三、衝擊傳導的分析框架
經濟衝擊問題已經成為經濟政策理論和經濟周期理論的核心問題。經濟衝擊對於係統變量的影響機理，稱為經濟衝擊的作用機製；由係統變量向特征變量的傳導機理，稱為經濟衝擊的傳導機製。我國加入WTO以後，在開放經濟環境當中受到的經濟衝擊，特別是金融投機衝擊和市場價格衝擊的可能性大增。因此，加強經濟衝擊及其傳導機製的分析研究，有助於監測宏觀經濟運行和製定有效的宏觀經濟政策，有助於確保國家經濟安全。
四、比較研究方法
比較中國改革開放前的經濟波動與經濟改革後的經濟波動，比較中國經濟波動與國際經濟波動，把對中國宏觀經濟運行的研究置於複雜多變的國際經濟大環境中，從封閉式的研究轉變為開放式的研究，探析20世紀90年代中期以來的中國經濟波動變化。通過比較分析考察經濟改革時期中國經濟波動與國際經濟波動的互動性關係，深入認識經濟改革時期中國經濟波動的規律特征。